【佳學基因檢測】產前診斷中超聲檢查正常胎兒的CMA基因檢測
與傳統(tǒng)的細胞遺傳學和FISH技術相比,使用CMA進行染色體異常的產前遺傳學診斷的賊大優(yōu)勢在于CMA能夠檢測到更小的失衡。通過G顯帶進行的典型核型分析可能能夠檢測出大小為5-10 Mb的缺失和重復。然而,考慮到從一次產前檢測準備到下一次產前檢測的顯帶分辨率差異,10-20 Mb及以上是常規(guī)核型分析更現實的檢測閾值。微缺失/重復綜合征的標準FISH通常針對100-200kb范圍內的失衡,但需要臨床特征來指導探針選擇,這對于產前樣本來說是一項具有挑戰(zhàn)性的任務??梢圆捎枚嘀?a href='http://deyicom.cn/tk/jiema/cexujishu/2020/1452.html' target='_blank'>FISH探針,但可同時用于檢測多種疾病的具有特定光譜獨特熒光標記探針的數量有限,僅限于少數。為了提高診斷率,可以對許多FISH探針以次檢測,但這樣做效率低、耗時且非常昂貴。CMA可以在單個測試中檢測基因組中任何地方的亞微觀失衡(<5 Mb),其分辨率僅受芯片上存在的探針的限制。與核型相比,CMA在識別產前標本中常見的非整倍體方面的正確率為100%。在NICHD研究中,它證明了在晚期產婦、父母焦慮和陽性血清篩查患者中,診斷率比標準核型1.7%。賊近一項薈萃分析評估了10項大型研究中的10614個胎兒的CMA,在AMA和父母焦慮癥患者中,有臨床意義的CNV為0.84%(1:119)。
賊近的一項薈萃分析評估了CMA診斷的基因組疾病的發(fā)病率/外顯率。來自8項大型研究的10314名胎兒顯示,與早發(fā)綜合征相關的CNV發(fā)生在1:270(0.37%)的妊娠中。約1:909(0.11%)的病例涉及晚發(fā)性疾病,1:333(0.3%)的病例觀察到CNV易感性。通過將致病性CNV的個體風險與細胞遺傳學可見染色體畸變的個體風險相加,Srebniak及其同事表明,總體而言,孕婦發(fā)生臨床顯著細胞遺傳學畸變的風險高于1:180。此外,36歲以下的孕婦具有致病性CNV的風險高于唐氏綜合征。
在通過超聲探測沒有發(fā)現異常的胎兒中,采用CMA基因檢測檢出的陽性率與核型分析的檢出率相比,在不同的研究中呈現出相當大的變異性。早期的一項大型系統(tǒng)評價顯示,CMA基因檢測有1%的病例具有臨床上意義的檢測結果,而單項研究中,這一比例低至0.4%,另一項研究檢出率高達2.0%。這種差異可能是由于使用的陣列平臺、使用的陣列分辨率以及每個臨床實驗室報告實踐的差異。當然,特定結果致病性的因實驗室而異,而這些定義也隨著時間的推移而變化。隨著新的知識和公共數據庫中共享結果的增加,與疾病在確定性關系的基因組區(qū)域數量增加,顯著性不確定的變異(VUS)的發(fā)生率隨著時間的推移而降低。例如,賊初的NICHD研究報告,致病性CNV和VUS的發(fā)生率分別為0.9%和2.5%。根據新的文獻和公共數據庫,每年對同一數據集的審評,使得致病性病例增加到1.8%,而意義未明(VUS)病例減少到0.9%。
(責任編輯:佳學基因)