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【佳學基因檢測】開發(fā)高速驗證基因解碼結果的技術:基因檢測加速退出

【佳學基因】高速驗證基因解碼結果的技術:基因檢測加速退出 今天,先進學術期刊《自然》上發(fā)表了一篇重磅論文。一支來自華盛頓大學的科研團隊利用CRISPR技術,對乳腺癌重要風險基因 BRCA1 進行了 飽和式的基因編輯 ,詳細解析了近4000個不同的單核苷酸變異會對這條基因產生怎樣的影響。研究人員稱,這個發(fā)現(xiàn)有望立刻在臨床上得到應用。 ▲《自然》的多篇新聞報道了這一

佳學基因檢測】開發(fā)高速驗證基因解碼的技術,基因檢測加速退出
 

基因解碼導讀

基因解碼技術是一種先進的基因信息分析技術,它不依賴先證者案例,可以對尚未報道的、獨特的疾病、歷史上新發(fā)現(xiàn)的病例進行分析解讀,是個性化醫(yī)學的基礎支撐。但是,基因解碼技術在沒有先證者的情況下,盡管分析依據(jù)確鑿,學科專家仍然持有疑慮。本文介紹了一種快速驗證基因解碼結果的技術,將會加速正確醫(yī)學領域對基因解碼結果的承認,使得具有列舉、假設、驗證特點的基因檢測加速退出歷史舞臺。

基因信息領域的三個產業(yè)形態(tài)?

 

基因信息產業(yè)主要有三種形式:基因測序、基因檢測和基因解碼。基因測序是獲得基因序列的技術,它主要通過測序儀器來完成。由于基因測序儀器主要是由國外的生產商來提供,中國國內的基因測序領域主要是提供科研服務。由于儀器更新?lián)Q代快,銷售價格快速下降,進入這一領域的門檻消除。加上基本沒有技術含量,這一領域自2015年來,競爭激烈。基因檢測是在少量了解人的基因序列與疾病的關系的基礎上,為人們提供的一種了解自身是否存在特定的突變序列的方式。基因檢測的特點是檢查自己身上是否具有他人所具有的好的(如天賦)或壞的序列(如腫瘤基因),是一種假設式、列舉式、驗證式的檢測。假設是指在檢測前先假設受檢者有已經(jīng)患過病的病人的基因序列,并據(jù)此選擇檢測內容;驗證是通過檢測過程去檢查檢測前的假設是否正確。由于任何一個基因都有數(shù)以萬記的基因位點,而每一個位點都可能突變,從而成為疾病表征相同、天賦能力相同,但是基因原因各不相同的內在原因。但是基因檢測往往只是有選擇的檢測列舉下來的有限的位點,而超過99%的導致疾病、引起疾病風險的基因卻因為沒有包括在檢測范圍之內,從而不能發(fā)現(xiàn)疾病發(fā)生的真正原因。這也是為什么大多數(shù)基因檢測公司只能做易感基因、風險基因檢測的原因?;蚪獯a是一種新型分析技術,它首先摒棄人為的選擇,盡賊大可能、正確的獲得全部基因序列;在就是它采用獨特的基因序列解讀技術,不依賴報道的案列來明確突變的影響??梢园l(fā)現(xiàn)任何一種疾病的獨特的、先進的發(fā)病原因。與基因檢測不同的是,基因解碼技術可以用來進行致病基因鑒定、基因病罕見病的治療藥物設計與尋找,可以對基因矯正治療提供基因修改、編輯指導。與自體干細胞技術結合,可以實現(xiàn)對基因病、遺傳病的有效治療。

基因解碼技術由前國際細胞治療協(xié)會副主席、天津大學藥物科學與技術學院教授黃家學博士及其團隊率先提出,并進行系統(tǒng)論述。緊接著,一系列基因解碼產品投入應用。但是囿于基因信息分析必須經(jīng)過先證者驗證的觀點的束縛,即使在科學研究領域,也還有專家學者對基因解碼技術持懷疑態(tài)度,從而限制了基因解碼技術的推廣,每年因此而得不到基因病因鑒定的患者在中國就有4000多萬人。可喜的是,基因解碼及相關技術快速發(fā)展,基因解碼分析驗證技術得到業(yè)界的承認,這將推動基因解碼技術的應用,加速其對基因檢測技術的取代。

一種快速驗證基因解碼結果的技術出現(xiàn)

2018年9月13日,國際高級學術期刊《自然》上發(fā)表了一篇重磅論文。一支來自華盛頓大學的基因解碼科研團隊利用人工基因序列突變技術,對BRCA1進行了窮盡式的基因序列改變。在此以前,臨床上的病列揭示出部分位點的突變可以導致乳腺癌的發(fā)生,但是,全基因測序結果發(fā)現(xiàn)不同的人在BRCA1上有各不相同的基因突變。根據(jù)基因信息分析的傳統(tǒng)方法,由于這些位點沒有在先證者身上發(fā)現(xiàn)、報道并記錄在數(shù)據(jù)庫中,這些突變位點都被打上了意義未明的標簽,無法對患者的發(fā)病原因進行明確的、正確的判斷。致病基因鑒定基因解碼雖然可以得出判斷,但是遭到部分信息分析專家的懷疑。致病基因鑒定基因解碼的特點是可以對任何一種基因序列變化的遺傳效應進行評估,而這一研究報道則是對任何一個、總數(shù)為近4000個不同的序列變化的效應進行觀察分析。

在這個技術體系中,基因解碼科學家設計了一個巧妙的實驗。他們采用一個可以顯示基因序列變化對乳腺癌的發(fā)生的影響的細胞系。在這個細胞里,如果基因的序列變化使得BRCA1蛋白失去其應有的功能,細胞就會死亡,這對應于癌癥的發(fā)生。與這個細胞系對應的是窮盡式的人工突變制造方法。利用基因編輯工具,在這個細胞系里制造了所有可能發(fā)生的基因突變,從而可以驗證基因解碼的高效性。利用這個方法,研究人員們在半年里評價了近4000個位點,增加了400多種會讓BRCA1失去功能的突變,以及300多種會影響B(tài)RCA1表達的突變。這涵蓋了BRCA1基因的主要功能區(qū)域。未來的數(shù)年里,研究者計劃將這項工作拓展到整條BRCA1基因上。


快速驗證基因解碼正確與否的方法


基因解碼快速驗證技術增加了700多個可以檢出遺傳效應的位點

基因解碼技術有哪些應用?

基因解碼技術賊主要的應用是對基因病、遺傳病的致病基因鑒定。由于基因解碼采用的是窮盡式的、不依賴于數(shù)據(jù)庫案例的、基于結構和功能關系的基因序列分析方法,可以大幅度疾病原因的檢出率。為基因矯正、基因治療提供基因突變位置指引。實現(xiàn)基因病、遺傳病、罕見病的有效治療。此外,靶向用藥基因解碼、腫瘤風險基因解碼、天賦基因解碼、皮膚護理基因解碼、正確用藥基因解碼等領域的應用為正確營養(yǎng)、個性化皮膚護理、健康管理和疾病治療提供了更為高效的信息。

 


參考文獻

[1] Findlay et al., (2018), Accurate classification of BRCA1 variants with saturation genome editing, Nature, DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-018-0461-z
[2] 1,000s of breast cancer gene variants engineered, analyzed, Retrieved September 12, 2018, from https://newsroom.uw.edu/news/thousands-breast-cancer-gene-variants-engineered-and-analyzed
[3] Huge genetic-screening effort helps pinpoint roots of breast cancer, Retrieved September 12, 2018, from https://www.nature.com/articles/d41586-018-06665-x
[4] Gene editing reveals the effect of thousands of variants in a key cancer gene, Retrieved September 12, 2018, from https://www.nature.com/articles/d41586-018-06022-y



(責任編輯:佳學基因)
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