【佳學基因檢測】如何進行更正確的視網(wǎng)膜細胞瘤基因檢測——基因解碼?
視網(wǎng)膜母細胞瘤(RB,OMIM 180200,ORPHA 790)是兒童中賊常見的眼內(nèi)腫瘤,發(fā)病率在15000到18000分之一。視網(wǎng)膜母細胞瘤是腫瘤抑制基因的雙等位基因失活引起腫瘤發(fā)生的典型代表。RB1基因的雙等位失活被認為是視網(wǎng)膜細胞瘤發(fā)生的致病基因。
在約60%的視網(wǎng)膜母細胞瘤病例中,RB1的兩個等位基因在一個成視網(wǎng)膜母細母中同時突變,引起散發(fā)性單側(cè)視網(wǎng)膜母細胞瘤。 由于僅僅是腫瘤細胞發(fā)生突變,患者的生育不會受到影響。另外約40%視網(wǎng)膜母細胞瘤患者攜帶一個胚系突變,這些患者通常會在一歲左右發(fā)生雙側(cè)視網(wǎng)膜母細胞瘤。由于胚系突變存在于所有的細胞中,可以從雙親中的一方遺傳得來(家族性視網(wǎng)膜母細胞瘤),也可能是在精子的發(fā)生過程中產(chǎn)生(散發(fā)性視網(wǎng)膜母細胞瘤)。
散發(fā)性視網(wǎng)膜母細胞瘤的比例很高,首診患者中幾乎有80%的視網(wǎng)膜母細胞瘤屬于這種情形,患者沒有家族病史,因此認為它們是從頭引起的。體細胞突變鑲嵌是新發(fā)突變發(fā)病率高的單基因遺傳病的一個共同特點。有些突變發(fā)生在授精卵產(chǎn)生后的早期胚胎細胞中,因此不同的組織中突變細胞的存在情況不一樣。由于鑲嵌的程度不一樣,突變對不同組織的影響也不一樣,如視網(wǎng)膜、淋巴細胞、性腺等。突變是否在腺腺中存在非常重要,因為它直接影響患者的生育建議方案。
體細胞鑲嵌程度的檢測具有一定的難度。因為普通的基因檢測主要是采用桑格爾測序技術,對從血細胞中分離的組織DNA進行測序。難于檢測突變比例低于15%的鑲嵌細胞。此外,因為Sanger測序是一種半定量技術,等位基因突變頻率的定量是不正確的,無法區(qū)分高比例鑲嵌和雜合等位基因。
采用等位基因特異性PCR方法可以用來檢測含量較低的突變鑲嵌細胞,但是這一方法通常用來檢測賊常見的突變,無法對可能發(fā)生突變的其他位點進行檢測。而這種情況在視網(wǎng)膜母細胞瘤的發(fā)生中尤其重要。高通量測序技術,在檢測靈敏度和突變的種類方面具有明顯的優(yōu)勢。
視網(wǎng)膜母細胞瘤基因檢測、基因解碼延伸閱讀:
【佳學基因解碼-基因檢測】兒童的眼中“釘”——視網(wǎng)膜母細胞瘤
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