【佳學(xué)基因檢測(cè)】肺癌早期篩查中的基因檢測(cè)與抗體檢測(cè)效用對(duì)比分析
《肺癌發(fā)生過程的人體組成變化基因解碼》清晰地論述了,導(dǎo)致肺癌發(fā)生的基因突變會(huì)使患者體內(nèi)產(chǎn)生組織特異性蛋白質(zhì)或者是新抗原neo-antigen,即腫瘤基因解碼中所說(shuō)的非同意突變,從而改變自身抗原的變化。這些腫瘤抗原處于免疫系統(tǒng)和正在發(fā)展的癌癥之間,并形成交接點(diǎn),在整個(gè)惡變過程中都會(huì)發(fā)生,因此有可能作為早期檢測(cè)的生物標(biāo)記物加以利用。免疫系統(tǒng)與癌癥之間的關(guān)系很復(fù)雜,《癌癥發(fā)生過程 的免疫系統(tǒng)作用》強(qiáng)調(diào)了細(xì)胞毒性T細(xì)胞的作用。然而,《人體免疫系統(tǒng)基因解碼》則認(rèn)識(shí)到,體液免疫系統(tǒng)可能會(huì)失調(diào),從而產(chǎn)生自身抗體,這為發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物提供了另一個(gè)來(lái)源。
基因解碼一直在尋找與肺癌相關(guān)的抗體。首先是p53抗體,約12%的肺癌患者(包括小細(xì)胞肺癌和非小細(xì)胞肺癌)中存在p53抗體。事實(shí)上,在通過透視檢測(cè)肺癌之前,p53抗體的出現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了這種可能性。在p53抗 體之后,又發(fā)現(xiàn)有幾種抗體與肺癌有關(guān),這些抗體被肺癌的抗體檢測(cè)基因解碼合并成一個(gè)抗體檢測(cè)包。肺癌特異性抗體基因解碼通過非小細(xì)胞肺癌NSCLC噬菌體展示文庫(kù)中鑒定出五抗原決定簇,它們與非小細(xì)胞肺部NSCLC患者血清的反應(yīng)比對(duì)照組更強(qiáng)烈。結(jié)合對(duì)這些抗原決定簇的分析,非小細(xì)胞肺癌NSCLC與對(duì)照組的敏感性和特異性分別為91%和91%。
在診斷肺癌時(shí),肺癌早期正確篩查研究課題申報(bào)組對(duì)包括小細(xì)胞肺癌SCLC和非小細(xì)胞肺癌NSCLC患者以及匹配對(duì)照組的隊(duì)列進(jìn)行了六種抗體(p53抗體、NY-ESO-1抗體、CAGE抗體、GBU4-5抗體、膜聯(lián)蛋白1抗體和SOX-2抗體)的檢測(cè)。最終驗(yàn)證得到的敏感性為37%,特異性為90%。這組抗體在驗(yàn)證后的實(shí)驗(yàn)組中進(jìn)行了測(cè)試,結(jié)果相似。研究結(jié)果轉(zhuǎn)化為一種可以購(gòu)買的EarlyCDT Lung肺癌早期篩查分析方法。肺癌的抗體檢測(cè)開發(fā)小組一組小細(xì)胞肺癌SCLC患者中使用了六種抗體,以及抗Hu-D抗體。由于小細(xì)胞肺癌SCLC患者和對(duì)照組之間的水平?jīng)]有差異,因此分析中沒有檢測(cè)到膜聯(lián)蛋白1抗體。將剩余抗體組的特異性設(shè)置為90%,敏感性為50%;然而,這些發(fā)現(xiàn)并沒有在獨(dú)立人群中得到驗(yàn)證。然后,對(duì)抗體組合包進(jìn)行了修改,得到了七個(gè)抗體組合檢測(cè)包,包括p53、NY-ESO-1、CAGE、GBU4-5、Hu-D、SOX-2、MAGE-A4,以將敏感性/特異性提高到47%/90%。EarlyCDT Lung在臨床實(shí)踐中的應(yīng)用有限,臨床醫(yī)生在研究高危患者的肺癌時(shí)使用了它。第一批1699名患者(包括六個(gè)抗體組和七個(gè)抗體組)被納入分析,并進(jìn)行了6個(gè)月的隨訪,發(fā)現(xiàn)六個(gè)抗體組的敏感性/特異性為46%/83%,七個(gè)抗體組的敏感性/特異性為37%/91%。一項(xiàng)對(duì)12000人的試驗(yàn),隨機(jī)分為EarlyCDT Lung或常規(guī)護(hù)理(即不篩查),旨在確定這種血液檢測(cè)在肺癌篩查計(jì)劃中的作用。
針對(duì)腫瘤特異性抗原的抗體已應(yīng)用于低劑量CT(LDCT)試驗(yàn),以確定其檢測(cè)肺癌的有效性。為此,肺癌診斷的抗體方法研究團(tuán)隊(duì)在肺癌患者診斷前和診斷時(shí)以及對(duì)照組的血清中使用了六種抗體(針對(duì)APEX1、NOLC1、PXN、Bac克隆R580E16和MT-RNR2的抗體)。使用低劑量CT作為訓(xùn)練組,肺篩查項(xiàng)目作為驗(yàn)證隊(duì)列,非小細(xì)胞肺癌的NSCLC的總體敏感性為58%,特異性為43%。這些研究中獲得的低靈敏度和特異性說(shuō)明,難以找到肺癌特有的一致的血清學(xué)變化,并可能限制這些檢測(cè)在大型篩查項(xiàng)目中的應(yīng)用。
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