【佳學(xué)基因檢測(cè)】肺癌組織基因檢測(cè)揭示的基因突變演變過(guò)程
佳學(xué)基因?qū)Ψ伟┗驒z測(cè)的介紹：
肺癌是全球癌癥相關(guān)死亡的主要原因。佳學(xué)基因檢測(cè)分析了前421例納入TRACERx研究的非小細(xì)胞肺癌患者手術(shù)或隨訪期間采集的1,644個(gè)腫瘤區(qū)域。該項(xiàng)目旨在解碼肺癌演化,并解決主要研究終點(diǎn):確定腫瘤內(nèi)異質(zhì)性與臨床預(yù)后之間的關(guān)系。在肺腺癌中,40種常見(jiàn)癌癥基因中有22種受到顯著的亞克隆選擇作用,包括經(jīng)典的腫瘤發(fā)生基因,如TP53和KRAS。肺癌致病基因鑒定基因解碼確定了驅(qū)動(dòng)因子、突變過(guò)程和全基因組加倍(WGD)事件之間的進(jìn)化依賴關(guān)系。盡管患者有吸煙史,但8%的肺腺癌沒(méi)有煙草誘導(dǎo)的突變證據(jù)。與從未吸煙者的腫瘤相比,這些腫瘤的EGFR突變和RET、ROS1、ALK和MET致癌異構(gòu)體的檢出率相似,這表明它們可能具有相似的病因和發(fā)病過(guò)程。大規(guī)模亞克隆擴(kuò)增與正向亞克隆選擇相關(guān)。harbour賊近亞克隆擴(kuò)增(在系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分支的末端)的患者無(wú)病生存期顯著縮短。19%的腫瘤檢測(cè)到亞克隆WGD,10%的腫瘤并存有多個(gè)平行的亞克隆WGD。亞克隆WGD(而不是主克隆WGD)與無(wú)病生存期縮短相關(guān)。拷貝數(shù)異質(zhì)性與術(shù)后1年內(nèi)胸外反復(fù)相關(guān)。這些數(shù)據(jù)證明了克隆擴(kuò)增、WGD和拷貝數(shù)不穩(wěn)定性在確定非小細(xì)胞肺癌反復(fù)時(shí)間和模式中的重要性,并提供了一個(gè)全面的臨床癌癥進(jìn)化數(shù)據(jù)資源。
肺癌基因檢測(cè)關(guān)鍵詞：
轉(zhuǎn)化研究,遺傳學(xué)研究
肺癌發(fā)生與惡化的基因檢測(cè)分析
肺癌是全球癌癥相關(guān)死亡的主要原因,占癌癥相關(guān)死亡率的18%和癌癥發(fā)病率的11%。然而,導(dǎo)致這種aggressive腫瘤行為的生物學(xué)機(jī)制仍然很大程度上未被闡明。多區(qū)域測(cè)序提供了一個(gè)利用觀察到的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)來(lái)推斷腫瘤系統(tǒng)發(fā)育的機(jī)會(huì)。然而,其他基因檢測(cè)使用原發(fā)腫瘤樣本的多區(qū)域測(cè)序(在此稱為"區(qū)域")的研究,對(duì)于給定的腫瘤類型,樣本數(shù)量?jī)H限于100例或更少,這限制了基因組和臨床分析的統(tǒng)計(jì)力。腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)的功能相關(guān)性也一直存在爭(zhēng)議,對(duì)于個(gè)性化醫(yī)學(xué)有重要影響。
非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)通過(guò)治療的進(jìn)化跟蹤(TRACERx)(臨床試驗(yàn).gov識(shí)別號(hào):NCT01888601)是一項(xiàng)前瞻性多中心癌癥研究,旨在從診斷和手術(shù)切除到治好或疾病反復(fù),勾勒出腫瘤演化過(guò)程。TRACERx的兩個(gè)主要終點(diǎn)是確定腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)與臨床結(jié)果之間的關(guān)聯(lián),以及鉑類輔助化療對(duì)反復(fù)疾病中腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)的影響。2017年,對(duì)前100例納入TRACERx的患者的分析揭示了普遍存在的基因組腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH),以及體細(xì)胞拷貝數(shù)變化(SCNA)異質(zhì)性與預(yù)后不良之間存在顯著關(guān)聯(lián)。然而,并未觀察到突變腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)與預(yù)后之間的關(guān)系。在這個(gè)項(xiàng)目中,佳學(xué)基因擴(kuò)展了對(duì)NSCLC進(jìn)化基礎(chǔ)的理解,并進(jìn)一步研究了已建立和新的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)測(cè)量指標(biāo)與臨床結(jié)果之間的關(guān)系。為此,佳學(xué)基因利用前421例前瞻性納入TRACERx的患者的多區(qū)域外顯子組原發(fā)腫瘤數(shù)據(jù)。
