【佳學基因檢測】基因解碼中的eQTL數(shù)據(jù)是如何提升腫瘤基因檢測正確性的?
自從佳學基因主創(chuàng)人員開始耕耘于基因信息技術的浩瀚星空中,GWAS技術有力地、成功地將遺傳位點與基因變異序列與人類復雜性狀緊密聯(lián)系起來。盡管基因解碼豐富了基因信息的知識,填充了基因密碼詞典,人類對GWAS結果的內(nèi)在機理的理解還遠未達到佳學基因對自身的要求。這阻礙了將GWAS研究結果轉化為診斷、治療和高精度預測的有效性。對人體疾病表征相關聯(lián)的表達數(shù)量性狀位點(eQTL)的富集研究揭示了基因表達調(diào)控的重要性。采用功能數(shù)量化研究揭示:在已模型化研究的12種疾病中,80%的共同變異對人體疾病表征的影響可以歸因于人體基因組中存在的一類核酸酶敏感性位點,這進一步說明轉錄調(diào)控機制在決定人與人之間不同的重要性。充分證明基于數(shù)據(jù)庫候選基因的檢測需要讓位于以基因解碼為基礎的基因信息分析。
已經(jīng)進行了大量的轉錄組研究,在這些研究中,對大量個體的基因型和表達水平進行了分析。從研究過的組織來說,賊全面的轉錄組數(shù)據(jù)集是基因型組織表達項目(GTEx),在這一大規(guī)模項目中,近1000個個體的多個組織樣本中收集了DNA和RNA,并進行高覆蓋率測序。這一引人注目的資源為在轉錄水平上研究變異序列的功能后果提供了全面的跨組織分析數(shù)據(jù)。
為了整合這些大規(guī)模轉錄組研究產(chǎn)生的知識并闡明疾病生物學,為腫瘤的正確治療提代更為有效的基因變異序列檢測?;蚪獯a人員為基因信息的智能解碼開發(fā)了一種稱之為PrediXcan的模型算法。在這種基因信息深度解碼算法中,佳學基因采用了基因水平的關聯(lián)方法,用于測試基因表達水平對表型的決定作用。PrediXcan用于GWAS或測序研究(即DNA變異和表型的全基因組范圍的解碼研究)。它使用經(jīng)過定量的轉錄組數(shù)據(jù)集(如GTEx)訓練的模型估算轉錄組水平。采用這一模型預測的表達水平隨后與基因關聯(lián)測試中的表型建立關聯(lián),這一方法可以突破GWAS分析方法的固有缺陷。佳學基因采用的這一方法極大地豐富了可以用來解密基因信息的原始數(shù)據(jù)。
- 【佳學基因檢測】什么是MLPA基因檢測?有什么優(yōu)點?...
- 【佳學基因檢測】如何將全基因組測序(WGS)基因檢測數(shù)據(jù)定位到人的標準基因組上?...
- 【佳學基因檢測】FISH基因檢測中的探針類型選擇...
- 【佳學基因檢測】腫瘤基因檢測生物信息分析注意事項...
- 【佳學基因檢測】癌癥基因組檢測要點:一定要知道!...
- 【佳學基因檢測】什么是基因組檢測?...
- 【佳學基因檢測】TP53突變基因檢測...
- 【佳學基因檢測】基因解碼對Y染色體的進一步解密...
- 【佳學基因檢測】腫瘤基因檢測需要包括重復或反復區(qū)域的分析嗎?...
- 【佳學基因檢測】如何采用液體活檢檢進行細胞學檢測與NGS測序...
- 【佳學基因檢測】臨床科研服務:GWAS課題中的統(tǒng)計分析...
- 【佳學基因檢測】腫瘤靶向藥物Regorafenib (Stivarga) 及其在結直腸癌治療中的作用...
- 【佳學基因檢測】ALDOA的群體遺傳學結果對基因檢測正確性的影響...
- 【佳學基因檢測】SLC25A4的雙生子遺傳學分析結果簡介...
- 【佳學基因檢測】ASIC1的分子遺傳學分析成果...
- 【佳學基因檢測】ANXA6分子病理學成果概要...
- 【佳學基因檢測】檢驗科醫(yī)師晉升考試關于ADRA2C的知識...
- 【佳學基因檢測】醫(yī)學院碩士研究考試關于ACVR2A基因檢測的知識要點...
- 【佳學基因檢測】醫(yī)學博士ANK1基因檢測的知識結構準備...
- 【佳學基因檢測】醫(yī)學院專升本關于ADCYAP1R1基因檢測的基本技能...
- 【佳學基因檢測】病例分析會中需要知道的關于ACLY基因的知識...
- 【佳學基因檢測】病案討論中需要知道的關于AIF1的知識...
- 【佳學基因檢測】質(zhì)譜基因檢測AGTR2基因存在基因突變該怎么理解?...
- 【佳學基因檢測】飛行質(zhì)譜基因檢測發(fā)現(xiàn)ADRA2A有突變,嚴重嗎?...
- 【佳學基因檢測】核型分析發(fā)現(xiàn)NAT1突變了,是什么意思?...
- 【佳學基因檢測】遺傳學檢測結果指出ALOX15突變,該找誰咨詢?...
- 【佳學基因檢測】高精度基因檢測為什么包含ADD1基因?...
- 【佳學基因檢測】基因檢測包中為什么一定要有ACTA2基因?...
- 【佳學基因檢測】基因檢測時查看是否包含ADH1C重要嗎?...
- 【佳學基因檢測】NR0B1基因間序列存在突變是否需要阻斷遺傳?...
- 來了,就說兩句!
-
- 賊新評論 進入詳細評論頁>>