【佳學(xué)基因檢測】肺癌ctDNA基因檢測正確性因素被搞清楚了!
癌癥基因檢測及各種生物標(biāo)志物的研究發(fā)現(xiàn),DNA是通過細(xì)胞死亡(壞死或凋亡)或活細(xì)胞主動(dòng)分泌進(jìn)入血漿的。癌癥患者體內(nèi)的部分無細(xì)胞DNA來自腫瘤,形成所謂的“循環(huán)腫瘤DNA”(ctDNA)。在一項(xiàng)非小細(xì)胞肺癌的致病基因鑒定基因解碼研究中證明了ctDNA在肺癌中的作用,《肺癌的正確用藥850基因解碼》研究中發(fā)現(xiàn)了常見的突變,從而創(chuàng)建了一個(gè)庫,用于檢測與非小細(xì)胞肺癌相關(guān)的突變。在健康對照組和非小細(xì)胞肺癌患者的驗(yàn)證隊(duì)列中,敏感性和特異性分別為85%和96%。隨著時(shí)間的推移,患者體內(nèi)腫瘤體積和ctDNA數(shù)量之間也存在相關(guān)性,這為使用ctDNA監(jiān)測治療反應(yīng)開辟了前景。在所有晚期NSCLC病例中都能檢測到ctDNA,但在早期病例中只有50%可以檢測到。
一項(xiàng)多中心前瞻性研究通過職業(yè)/煙草接觸從有癌癥風(fēng)險(xiǎn)的健康人群中獲取血液樣本。TP53和KRAS突變分別在癌癥診斷前平均20個(gè)月和14個(gè)月檢測到,但只有4.6%的患者檢測到TP53突變,只有1.5%的患者檢測到KRAS突變。此外,3%和0.9%的陽性受檢者在超過5年的隨訪中未發(fā)生癌癥,其TP53和KRAS突變也呈陽性。為了開發(fā)一種早期檢測方法,肺癌的液體活檢基因檢測有效性研究評估了早期和晚期小細(xì)胞肺癌SCLC中的TP53突變,并將其與對照組進(jìn)行比較,以了解這種方法的特異性。在35%的早期和54%的晚期腫瘤中發(fā)現(xiàn)了TP53突變,但在11%的匹配對照中也發(fā)現(xiàn)了這些突變。
通過量化人類端粒酶(hTERT)基因,可以估計(jì)循環(huán)DNA的總量。使用這種方法,非小細(xì)胞肺癌NSCLC患者的循環(huán)DNA的濃度比年齡/性別/吸煙匹配的對照組高得多。一項(xiàng)后續(xù)研究觀察了低劑量CT(LDCT)觀察性研究中有顯著吸煙史的患者群體的總循環(huán)DNA?;€檢查時(shí)循環(huán)DNA總量與隨后癌癥風(fēng)險(xiǎn)之間沒有關(guān)聯(lián),盡管診斷時(shí)循環(huán)DNA越多,預(yù)后越差。此外,測量總循環(huán)DNA對非小細(xì)胞肺癌NSCLC沒有特異性;例如,在特發(fā)性肺纖維化中也發(fā)現(xiàn)循環(huán)DNA含量增加。
目前,ctDNA的臨床用途在于基于活檢衍生的基因組圖譜的ctDNA分析,從而發(fā)現(xiàn)肺癌患者的個(gè)性化數(shù)據(jù),以及隨后對患者反應(yīng)和治療的緊急耐藥性以及腫瘤演變的監(jiān)測。在篩查背景下,可以使用p53等常見肺癌突變,但在沒有肺癌的吸煙史患者中也存在這種突變,混淆了特異性。此外,越來越多的證據(jù)表明健康組織中存在廣泛的基因鑲嵌現(xiàn)象,包括已知在癌癥中起作用的基因中存在突變。雖然使用基于液滴數(shù)字PCR的方法進(jìn)行候選基因分析的敏感性更高,但隨著下一代測序的敏感性增加,更廣泛的基因突變可能會(huì)提供更多關(guān)于腫瘤存在的信息。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)