【佳學基因檢測】肺癌早期篩查中的基因檢測與抗體檢測效用對比分析
《肺癌發(fā)生過程的人體組成變化基因解碼》清晰地論述了,導(dǎo)致肺癌發(fā)生的基因突變會使患者體內(nèi)產(chǎn)生組織特異性蛋白質(zhì)或者是新抗原neo-antigen,即腫瘤基因解碼中所說的非同意突變,從而改變自身抗原的變化。這些腫瘤抗原處于免疫系統(tǒng)和正在發(fā)展的癌癥之間,并形成交接點,在整個惡變過程中都會發(fā)生,因此有可能作為早期檢測的生物標記物加以利用。免疫系統(tǒng)與癌癥之間的關(guān)系很復(fù)雜,《癌癥發(fā)生過程 的免疫系統(tǒng)作用》強調(diào)了細胞毒性T細胞的作用。然而,《人體免疫系統(tǒng)基因解碼》則認識到,體液免疫系統(tǒng)可能會失調(diào),從而產(chǎn)生自身抗體,這為發(fā)現(xiàn)生物標志物提供了另一個來源。
基因解碼一直在尋找與肺癌相關(guān)的抗體。首先是p53抗體,約12%的肺癌患者(包括小細胞肺癌和非小細胞肺癌)中存在p53抗體。事實上,在通過透視檢測肺癌之前,p53抗體的出現(xiàn)強調(diào)了這種可能性。在p53抗 體之后,又發(fā)現(xiàn)有幾種抗體與肺癌有關(guān),這些抗體被肺癌的抗體檢測基因解碼合并成一個抗體檢測包。肺癌特異性抗體基因解碼通過非小細胞肺癌NSCLC噬菌體展示文庫中鑒定出五抗原決定簇,它們與非小細胞肺部NSCLC患者血清的反應(yīng)比對照組更強烈。結(jié)合對這些抗原決定簇的分析,非小細胞肺癌NSCLC與對照組的敏感性和特異性分別為91%和91%。
在診斷肺癌時,肺癌早期正確篩查研究課題申報組對包括小細胞肺癌SCLC和非小細胞肺癌NSCLC患者以及匹配對照組的隊列進行了六種抗體(p53抗體、NY-ESO-1抗體、CAGE抗體、GBU4-5抗體、膜聯(lián)蛋白1抗體和SOX-2抗體)的檢測。賊終驗證得到的敏感性為37%,特異性為90%。這組抗體在驗證后的實驗組中進行了測試,結(jié)果相似。研究結(jié)果轉(zhuǎn)化為一種可以購買的EarlyCDT Lung肺癌早期篩查分析方法。肺癌的抗體檢測開發(fā)小組一組小細胞肺癌SCLC患者中使用了六種抗體,以及抗Hu-D抗體。由于小細胞肺癌SCLC患者和對照組之間的水平?jīng)]有差異,因此分析中沒有檢測到膜聯(lián)蛋白1抗體。將剩余抗體組的特異性設(shè)置為90%,敏感性為50%;然而,這些發(fā)現(xiàn)并沒有在獨立人群中得到驗證。然后,對抗體組合包進行了修改,得到了七個抗體組合檢測包,包括p53、NY-ESO-1、CAGE、GBU4-5、Hu-D、SOX-2、MAGE-A4,以將敏感性/特異性提高到47%/90%。EarlyCDT Lung在臨床實踐中的應(yīng)用有限,臨床醫(yī)生在研究高?;颊叩姆伟r使用了它。先進批1699名患者(包括六個抗體組和七個抗體組)被納入分析,并進行了6個月的隨訪,發(fā)現(xiàn)六個抗體組的敏感性/特異性為46%/83%,七個抗體組的敏感性/特異性為37%/91%。一項對12000人的試驗,隨機分為EarlyCDT Lung或常規(guī)護理(即不篩查),旨在確定這種血液檢測在肺癌篩查計劃中的作用。
針對腫瘤特異性抗原的抗體已應(yīng)用于低劑量CT(LDCT)試驗,以確定其檢測肺癌的有效性。為此,肺癌診斷的抗體方法研究團隊在肺癌患者診斷前和診斷時以及對照組的血清中使用了六種抗體(針對APEX1、NOLC1、PXN、Bac克隆R580E16和MT-RNR2的抗體)。使用低劑量CT作為訓(xùn)練組,肺篩查項目作為驗證隊列,非小細胞肺癌的NSCLC的總體敏感性為58%,特異性為43%。這些研究中獲得的低靈敏度和特異性說明,難以找到肺癌特有的一致的血清學變化,并可能限制這些檢測在大型篩查項目中的應(yīng)用。