【佳學(xué)基因檢測(cè)】如何采用新的基因檢測(cè)技術(shù)提高對(duì)多發(fā)性骨髓瘤復(fù)雜基因變化的基因檢測(cè)和解析？

多發(fā)性骨髓瘤 (MM) 是一種血液惡性腫瘤，影響終末分化的 B 系細(xì)胞，其特征是骨髓中克隆性漿細(xì)胞的積累。它具有復(fù)雜的基因序列變化模式，被認(rèn)為會(huì)導(dǎo)致該疾病在治療反應(yīng)和總體結(jié)果方面的多樣性。新療法的引入顯著提高了生存率。然而，盡管取得了這些進(jìn)步，但該疾病基本上仍然無法治好，并且具有高風(fēng)險(xiǎn)畸變的患者繼續(xù)表現(xiàn)出不良結(jié)果。因此，為了更好的制定治療方案，需要通過更為精細(xì)的基因檢測(cè)識(shí)別高危患者并了解潛在的疾病生物學(xué)。這是基因解碼基因檢測(cè)在正確醫(yī)學(xué)時(shí)代所能發(fā)揮的獨(dú)具特色的作用。

從《血液病患者的基因檢測(cè)多樣性》得知，根據(jù)發(fā)生在基因序列上的主要特征性變化，多發(fā)性骨髓瘤（MM） 主要分為超二倍體 (HRD) 和非 HRD 病例。在這個(gè)分類中，HRD多發(fā)性骨髓瘤的特征是奇數(shù)染色體的多重三體性，而非 HRD多發(fā)性骨髓瘤與免疫球蛋白重鏈 (IGH) 易位相關(guān)。最常見的 IGH 易位包括 t(4;14)、t(11;14)、t(6;14)、t(14;16) 和 t(14;20)，它們通過與強(qiáng) Eμ 和3' 調(diào)節(jié)區(qū) (RR) IGH 增強(qiáng)子分別引起多發(fā)性骨髓瘤SET/FGFR3、CCND1、CCND3、MAF 和 MAFB 的失調(diào)。傳統(tǒng)上，這些原發(fā)性異常以及與不良結(jié)果相關(guān)的常見繼發(fā)性事件（包括 17p 缺失、1q21 擴(kuò)增和MYC易位），已在臨床常規(guī)中使用熒光原位雜交（FISH）基因檢測(cè)進(jìn)行了研究。盡管啟動(dòng)事件看似簡單的二分法，但下一代測(cè)序揭示了遺傳畸變的復(fù)雜情況，導(dǎo)致一些基因檢測(cè)方法只能識(shí)別某些特定的基因突變。這種基因序列變化的復(fù)雜情況通常包含一系列繼發(fā)性遺傳畸變，具有頻繁的拷貝數(shù)變異 (CNV)、單核苷酸變異 (SNV) 和結(jié)構(gòu)變異 (SV)，這些變異是由模板化插入、局灶性擴(kuò)增、染色體復(fù)雜性、染色體碎裂或其他復(fù)雜的重排所引起?？偟膩碚f，這些畸變會(huì)影響漿細(xì)胞分化、細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、DNA 修復(fù)和多種信號(hào)通路，從而使得每一種情況需要特定的靶向藥物來治療，這是多發(fā)性骨髓瘤高效治療并改善結(jié)果對(duì)基因檢測(cè)所提出的純需求。血液科腫瘤基因解碼正在努力鑒定各種可開發(fā)靶向藥物的基因突變、畸變類型。正時(shí)由于藥物研發(fā)與基于高通量測(cè)序的基因解碼結(jié)俁在一起，創(chuàng)造了使用個(gè)性化醫(yī)學(xué)策略治療多發(fā)性骨髓瘤的可能性。

Linked-read 全基因組測(cè)序 (lrWGS) 是佳學(xué)基因檢測(cè)、基因解碼正在開發(fā)的一項(xiàng)新的基因測(cè)序技術(shù)，可以從傳統(tǒng)的短讀長測(cè)序中創(chuàng)建合成長讀長。鏈接讀取數(shù)據(jù)是通過生成源自單個(gè)高分子量 (HMW) DNA 分子的讀取組或讀取云來實(shí)現(xiàn)的，它們都帶有將它們連接在一起的通用條形碼。將讀取云映射在一起并隨后利用讀取云中 SNV 的存在，可以改進(jìn)大相塊的映射和單倍型重建。lrWGS 數(shù)據(jù)進(jìn)一步提供了通過分析跨越染色體斷點(diǎn)的讀取云來識(shí)別和重建 SV 的能力。一些研究已經(jīng)有效地使用 lrWGS 來識(shí)別和描述各種癌癥和其他疾病中通常很復(fù)雜的 SV。這使得 lrWGS 成為在多發(fā)性骨髓瘤和其他具有復(fù)雜基因組的疾病中提供全面基因信息的有吸引力的選擇。

佳學(xué)基因檢測(cè)可以直接在經(jīng)過熒光激活細(xì)胞分選 (FACS) 的變性細(xì)胞上生成高質(zhì)量的 lrWGS，而無需事先進(jìn)行 DNA 純化。在概念驗(yàn)證研究中將其應(yīng)用于多發(fā)性骨髓瘤，血液病復(fù)雜基因變化的高精度基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn) lrWGS 高效地檢測(cè)到 FISH 基因檢測(cè)可以檢出的易位和 CNV。此外，佳學(xué)基因新開發(fā)的全基因測(cè)序技術(shù)lrWGS 允許識(shí)別和解析各種基因信息的結(jié)構(gòu)性變化，包括個(gè)體獨(dú)特性結(jié)構(gòu)變化，對(duì)患者個(gè)體的治療和預(yù)后都有積極的影響。

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