【佳學(xué)基因檢測】熒光原位雜交(FISH)在實體瘤診斷和個體化治療中的應(yīng)用

熒光原位雜交基因檢測導(dǎo)讀：

熒光原位雜交(FISH)是一種重要的分子病理學(xué)檢測技術(shù),通過使用熒光標(biāo)記的DNA探針與組織或細(xì)胞中的特定基因或染色體區(qū)域雜交,可以檢測基因的數(shù)目、結(jié)構(gòu)和位置等異常情況。

在實體瘤診斷方面,FISH技術(shù)主要用于:

鑒別腫瘤的類型和亞型,如通過檢測特定的基因重排(如EWSR1-FLI1在Ewing肉瘤中)進(jìn)行分型。

評估預(yù)后相關(guān)的分子標(biāo)志物,如HER2基因擴增在乳腺癌中與較差預(yù)后相關(guān)。

檢測腫瘤特征性的染色體異常,如慢性骨髓性白血病的費城染色體。

在個體化治療方面,FISH檢測結(jié)果可以指導(dǎo)靶向藥物的選擇:

檢測驅(qū)動基因的擴增或者過度表達(dá),如EGFR、HER2等,可用于選擇相應(yīng)的小分子靶向藥物或單克隆抗體。

檢測基因重排,如ALK、ROS1等,可用于選擇相應(yīng)的酪氨酸激酶抑制劑。

檢測抗腫瘤藥物靶點的狀態(tài),如TOPO2A基因擴增可用于預(yù)測對蒽環(huán)類藥物的反應(yīng)。

綜上所述,FISH技術(shù)為實體瘤的分子分型診斷和靶向治療藥物的正確使用提供了重要的分子依據(jù),是現(xiàn)代正確腫瘤學(xué)不可或缺的分子病理檢測手段。

熒光原位雜交（FISH）是基因異常常規(guī)診斷中的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)

熒光原位雜交（FISH）是基因異常常規(guī)診斷中的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)。由于FISH操作簡單，佳學(xué)基因腫瘤基因檢測可以識別腫瘤特異性異常。其應(yīng)用僅限于設(shè)計的探針類型?；蛑嘏牛鏏LK、ROS1反映多個易位伙伴，關(guān)鍵區(qū)域的缺失，例如1p和19q，基因融合，例如COL1A1-PDGFB，基因組失衡，例如6p、6q、11q和擴增，例如HER2，是個性化腫瘤學(xué)的目標(biāo)。遺傳標(biāo)記的確認(rèn)通常是開始特定、靶向治療的直接指標(biāo)。在其他情況下，檢測到的異常有助于病理學(xué)家更好地區(qū)分軟組織肉瘤，或作出賊終診斷。佳學(xué)基因的主要目標(biāo)是表明，將FISH應(yīng)用于福爾馬林固定石蠟包埋組織樣本（FFPE）可以評估來自原發(fā)性腫瘤或轉(zhuǎn)移瘤的細(xì)胞群中的基因組狀態(tài)。盡管有許多更先進(jìn)的技術(shù)可供使用，例如實時PCR或新一代測序，但FISH仍然是許多遺傳實驗室中常用的方法。

熒光原位雜交(FISH)在實體瘤診斷和個體化治療中的應(yīng)用關(guān)鍵詞

ALK；COL1A1-PDGFB；FISH；HER2；ROS1；個性化醫(yī)學(xué)；個性化腫瘤學(xué)；t（X，18）；靶向治療。

佳學(xué)基因是如何理解熒光原位雜交技術(shù)的？

原位雜交篩查在個性化醫(yī)學(xué)中起到支持作用。多種已知的異?，F(xiàn)象，包括由易位、插入或倒位導(dǎo)致的重排、缺失（刪除）和增益（例如擴增），主要可以通過熒光原位雜交（FISH）來評估。在某些情況下，色原原位雜交（CISH）也被引入到分子病理學(xué)和分子腫瘤學(xué)領(lǐng)域。兩種原位雜交方法都基于相同的原理，即與感興趣的區(qū)域進(jìn)行退火、檢測、評估和空間定位。這兩種方法的主要區(qū)別在于基因組區(qū)域的標(biāo)記方法，可以使用生物素或地高辛（CISH），或者使用熒光標(biāo)記（FISH），然后使用適當(dāng)?shù)臋z測系統(tǒng)。對于用生物素標(biāo)記的探針，使用與辣根過氧化物酶（HRP-鏈霉親和素）結(jié)合的鏈霉親和素進(jìn)行檢測。對于帶有地高辛的探針，使用抗地高辛熒光素一抗，隨后使用與熒光素結(jié)合的HRP二抗，并在明場顯微鏡下計數(shù)信號。FISH檢測是直接進(jìn)行的，需要熒光顯微鏡。遺傳標(biāo)記的檢測通常在患者決策中起到關(guān)鍵作用，從患者風(fēng)險分層到實施適當(dāng)?shù)闹委煛＿@兩種原位技術(shù)都用于該領(lǐng)域。例如，與FISH相比，CISH在檢測HER-2/neu基因擴增方面的靈敏度為97.5%，特異性為94%。在一組4460例乳腺癌患者的FISH和CISH結(jié)果的一致性率為96%，表明CISH是一種與FISH相當(dāng)?shù)募夹g(shù)。大多數(shù)資料都認(rèn)為，在基因擴增檢測中，F(xiàn)ISH和CISH的表現(xiàn)幾乎相同。然而，由于17號染色體的多體性，CISH對于低水平擴增的靈敏度可能較低。對于使用FISH和CISH檢測的ALK（ALK受體酪氨酸激酶）重排，也有類似的觀察結(jié)果。在對449個樣本的測試中，這兩種方法分別顯示出19個和18個ALK陽性樣本。CISH的靈敏度為94.4%，特異性為100%。雖然每種診斷工具，不僅基于雜交，還基于蛋白質(zhì)表達(dá)，如免疫組織化學(xué)（IHC），都有其優(yōu)點和缺點，但FISH技術(shù)目前被認(rèn)為是參考方法。

原位檢測的另一替代方法是使用mRNA作為生物標(biāo)志物。該技術(shù)使用與測試的mRNA分子互補的單鏈DNA探針。標(biāo)準(zhǔn)程序包括消化、雜交、使用抗地高辛抗體和標(biāo)記有HRP的二抗進(jìn)行檢測，以及使用顯色劑（例如DAB，即3,3'-二氨基聯(lián)苯胺）和明場顯微鏡對結(jié)果進(jìn)行可視化。與上述ISH技術(shù)相比，mRNAISH更快、更便宜、制備更容易且毒性更低?？梢允褂眉从眯驮噭┖袑Ω栺R林固定石蠟包埋（FFPE）樣本中的乳腺癌HER2基因表達(dá)進(jìn)行評估。與其他基于mRNA評估的技術(shù)一樣，其主要限制是核糖核酸的穩(wěn)定性較差。