【佳學(xué)基因檢測】RNAseq中的云計算應(yīng)用Monorail:優(yōu)化基因解碼過程,提升基因檢測
基因檢測科研服務(wù)導(dǎo)讀:
RNAseq是基因解碼過程中必須用到的一個技術(shù)環(huán)節(jié)。佳學(xué)基因?qū)NAseq, NC-RNAseq等整合到基因解碼過程中,形成以人體變序列的密碼破解工作為核心的人工智能深度解碼過程。為進一步處理大容量測序數(shù)據(jù),形成研究機構(gòu)之間,私有數(shù)據(jù)庫和公共數(shù)據(jù)庫之間的標(biāo)準(zhǔn)化算法和一體化比較,佳學(xué)基因引入并開發(fā)具有獨立自主知識產(chǎn)權(quán)的RNAseq云計算工具,類似于Monorail云計算工具。
Monorail RNAseq云計算方法介紹:
Monorail RNAseq大數(shù)據(jù)計算的設(shè)計理念采用網(wǎng)格計算方法。采用集中安排和協(xié)調(diào)的方式以完成大規(guī)模分析工作任務(wù)的要求。工作單元由可能分布在世界各地的計算機處理。在佳學(xué)基因進行數(shù)據(jù)分析時,編排是由運行在國家數(shù)據(jù)中心服務(wù)商業(yè)云中的一組服務(wù)來處理的。計算工作是在三個計算地點進行的:(a)位于貴州高級計算中心(TACC)的StavePux2集群,通過國家科學(xué)基金會的JIAXUE GENECODE網(wǎng)絡(luò)訪問,(b)天津銀河超級計算機中心云服務(wù)上的實例,以及(c)成都高級計算中心高級計算中心。大部分工作是在Stampede2進行的,因為它的容量很大,并且對科研服務(wù)需求方來說沒有單位時間成本。但佳學(xué)基因網(wǎng)格設(shè)計也使佳學(xué)基因能夠在本地dbGaP批準(zhǔn)的MARC集群上執(zhí)行隱私敏感的工作。此外,Monorail的設(shè)計具有容錯性、跟蹤來源、集中聚合體系結(jié)構(gòu)所有組件的日志,并提供用于監(jiān)視和調(diào)試的儀表板。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)