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【佳學(xué)基因-基因檢測】核酸提取技術(shù)簡述(下)
加醇沉淀
用醇沉淀的目的是使核酸從裂解體系中沉淀下來,從而實(shí)現(xiàn)核酸與其它雜質(zhì)–主要是鹽的分離。就核酸而言,標(biāo)準(zhǔn)的醇沉淀要求有一定的鹽及某一比例的醇用量,但這決不是說這些鹽是必不可少的或者醇的比例是不可更改的。實(shí)際操作中不難發(fā)現(xiàn),當(dāng)裂解體系中核酸的濃度達(dá)到一定水平后,單獨(dú)使用醇也可以使核酸沉淀下來;或者含有鹽,使用低比例的醇也可以使核酸沉淀下來,這樣的話,得率可能會降低。當(dāng)碰到問題,判斷其主要是純度原因時(shí),有效可以通過調(diào)整沉淀?xiàng)l件來改善。
洗滌
洗滌原理與目的: 洗滌是非常重要的,首先一定要將沉淀懸浮起來;第二就是要控制一定的時(shí)間,尤其是當(dāng)核酸沉淀比較大時(shí);第三是少量多次;第四則是去上清要有效。對于質(zhì)量好的離心管,上清可以去除得非常有效,否則其殘留量多到會影響后續(xù)的實(shí)驗(yàn)??梢酝ㄟ^倒掉液體后再短暫離心,將殘液用移液器吸出。
由于殘液中都含有上一步操作中的雜質(zhì),其殘留量與混勻程度、核酸沉淀的大小都有關(guān)。揮發(fā)時(shí)去掉的是乙醇,雜質(zhì)是不會被揮發(fā)去除的。另外,核酸沉淀的大小及裂解液的裂解能力也決定了洗滌的強(qiáng)度。沉淀越大,裂解液的裂解能力越強(qiáng),洗滌越要有效:放置時(shí)間相對要長一點(diǎn),洗滌次數(shù)也要考慮增加。當(dāng)然,乙醇濃度的選擇也非常重要,一般情況,洗滌要用室溫的 75% 乙醇。
核酸溶解與保存
核酸溶解: DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,其中原因是有人認(rèn)為 EDTA 可以減少 DNA 被可能殘留下來的 DNase 降解的風(fēng)險(xiǎn)。如果操作過程控制得當(dāng),DNase 的殘留幾乎是可以忽略的,有效可以直接使用 Tris 或者水 (pH 接近 7) 溶解 DNA。
核酸保存:基本上,核酸在保存中的穩(wěn)定性,與溫度成反比,與濃度成正比。一般在-20℃保存。如果溫度不合適,核酸發(fā)生降解或者消失,首要原因是酶殘留導(dǎo)致的酶解,第二個(gè)原因則是保存核酸溶液的 pH 值不合適導(dǎo)致的水解 ,RNA 在弱酸性更穩(wěn)定,而 DNA 在弱堿性更合適。
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