【佳學(xué)基因檢測(cè)】一些與胎兒早產(chǎn)有關(guān)的多態(tài)性基因檢測(cè)位點(diǎn)
免疫系統(tǒng)功能異常與早產(chǎn)的關(guān)系導(dǎo)讀
早產(chǎn)(PTB)是一種典型的炎癥性疾病,發(fā)病機(jī)制尚不清楚。調(diào)查抗炎因子 IL-4 和 IL-10 基因多態(tài)性與早產(chǎn)之間關(guān)系的研究產(chǎn)生了相互矛盾的結(jié)果。胎兒早產(chǎn)的基因解碼基因檢測(cè)回顧和薈萃分析旨在總結(jié) IL-4 和 IL-10 基因多態(tài)性的影響,并闡明它們與早產(chǎn)的可能關(guān)聯(lián)。
方法
使用 PubMed、Web of Science 和 Cochrane 圖書館(截至 2022 年 4 月 2 日)進(jìn)行了系統(tǒng)的文獻(xiàn)綜述。使用“基因”數(shù)據(jù)庫(kù)中的MeSH術(shù)語(yǔ)、相關(guān)條目術(shù)語(yǔ)和其他名稱來(lái)查找相關(guān)文章。根據(jù)研究的異質(zhì)性,使用固定或隨機(jī)效應(yīng)模型來(lái)計(jì)算 IL-4 和 IL-10 基因多態(tài)性的顯著性。在等位基因、隱性、顯性、共顯性和過(guò)度顯性模型中計(jì)算優(yōu)勢(shì)比 (OR) 和 95% 置信區(qū)間 (CI)。Eggers 發(fā)表偏倚圖用于以圖形方式表示發(fā)表偏倚。
結(jié)果
在兩種白細(xì)胞介素(IL-4-590C/T (rs2243250) = 5 和 IL-10-592A/C (rs1800872)、-819T/C (rs1800871) 和 -1082A/G (rs1800896) = 16)中發(fā)現(xiàn)多態(tài)性21 篇文章??傮w而言,只有過(guò)度顯性基因模型 AA + GG與. AG 顯示 IL-10-1082A/G (rs1800896) 和早產(chǎn)之間存在顯著關(guān)聯(lián)(OR [95% CI] = 0.87 [0.76, 0.99],p= 0.04)。然而,在等位基因模型、隱性模型、顯性模型、共顯性模型和超顯性模型中,IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872) 和未發(fā)現(xiàn) IL-10-819T/C (rs1800871) 與早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。在基因模型中,在 IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872)、IL-10-819T/C (rs1800871) 和 IL-10-1082A 之間未發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的關(guān)聯(lián)/G (rs1800896) 多態(tài)性和早產(chǎn)在亞組分析中通過(guò)種族或?qū)φ战M哈迪-溫伯格平衡 (HWE) p值進(jìn)行。Eggers 的發(fā)表偏倚圖和 IL-10-1082A/G (rs1800896) 的異質(zhì)性檢驗(yàn) (I 2 <50%, p = 0.05) 表明漏斗不對(duì)稱可能是由于發(fā)表偏倚而不是異質(zhì)性。
結(jié)論
目前的研究表明,過(guò)度顯性基因模型 AA + GG與. IL-10-1082A/G (rs1800896) 多態(tài)性的 AG 可能與早產(chǎn)的基因易感性有關(guān),并且可能對(duì)早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)具有保護(hù)作用。IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 多態(tài)性與早產(chǎn)之間的關(guān)聯(lián)不明確。由于納入研究的局限性和發(fā)表偏倚的風(fēng)險(xiǎn),需要進(jìn)一步的研究來(lái)證實(shí)免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)的發(fā)現(xiàn)。
國(guó)際基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)參考
https://inplasy.com/inplasy-2022-4-0044,標(biāo)識(shí)符 INPLASY202240044。
關(guān)鍵詞: 早產(chǎn),基因多態(tài)性,IL-4,IL-10,薈萃分析
佳學(xué)基因?qū)τ谠绠a(chǎn)與基因檢測(cè)關(guān)系的科普
早產(chǎn) (PTB) 由世界衛(wèi)生組織 (WHO) 定義為在懷孕 37 周之前活產(chǎn)的嬰兒 。根據(jù)新的估計(jì),2014 年早產(chǎn)患病率占所有活產(chǎn)嬰兒的 8.7% 至 13.4%,每年約有 1500 萬(wàn)早產(chǎn)兒出生 。PTB 是全球 5 歲以下兒童死亡的主要原因 。此外,早產(chǎn)兒因多器官系統(tǒng)不成熟而導(dǎo)致短期和長(zhǎng)期并發(fā)癥的風(fēng)險(xiǎn)更高,例如腦癱、智力障礙、視力和聽力障礙以及認(rèn)知發(fā)育受損 。PTB 已成為一個(gè)全球性的公共衛(wèi)生問題,越來(lái)越多的證據(jù)表明該綜合征歸因于各種病理過(guò)程 。許多研究表明,促炎細(xì)胞因子如腫瘤壞死因子-α (TNF-α) 和白細(xì)胞介素-1α (IL-1α) 的基因變異與早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān) 。然而,抗炎細(xì)胞因子的基因多態(tài)性與早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系仍存在爭(zhēng)議。妊娠期間從靜止到促炎環(huán)境的轉(zhuǎn)變開始了分娩,這通過(guò)在分娩期間促炎細(xì)胞因子(例如白細(xì)胞介素和 TNF-α)的增加而得到證實(shí)(7)。分娩期間需要細(xì)胞因子來(lái)啟動(dòng)和調(diào)節(jié)子宮收縮、宮頸成熟和胎膜破裂 。
與不足月生產(chǎn)相關(guān)的促炎細(xì)胞因子的上調(diào)相反,抗炎細(xì)胞因子如 IL-10 和 IL-4 可以通過(guò)限制巨噬細(xì)胞促炎細(xì)胞因子的產(chǎn)生在懷孕期間提供代償性保護(hù)作用 。PTB 風(fēng)險(xiǎn)與細(xì)胞因子向促炎和抗炎細(xì)胞因子減少的轉(zhuǎn)變有關(guān)。然而,在沒有可識(shí)別感染原的女性中,高水平的促炎細(xì)胞因子和低水平的抗炎細(xì)胞因子可能是由其他因素引起的(例如,基因決定的促炎合成上調(diào)或下調(diào)的傾向)和抗炎細(xì)胞因子由于基因多態(tài)性)。許多研究已將細(xì)胞因子與疾病聯(lián)系起來(lái),尤其是這些細(xì)胞因子基因中的一些關(guān)鍵單核苷酸多態(tài)性 (SNP),它們可能會(huì)干擾基因表達(dá),從而可能影響疾病的發(fā)病機(jī)制。
各種細(xì)胞分泌 IL-4 和 IL-10。它們通過(guò)限制過(guò)度炎癥反應(yīng)、增強(qiáng)先天免疫和促進(jìn)組織修復(fù)機(jī)制,在感染和炎癥期間維持組織穩(wěn)態(tài)方面發(fā)揮重要作用 。因此,IL-4 和 IL-10 可能在以感染和炎癥為特征的不足月生產(chǎn)中發(fā)揮重要作用 。體外實(shí)驗(yàn)表明,IL-4 和 IL-10 可以下調(diào)人類妊娠相關(guān)組織中脂多糖 (LPS) 介導(dǎo)的炎癥反應(yīng) 。動(dòng)物研究還發(fā)現(xiàn),IL-10 可以有效預(yù)防 LPS 誘導(dǎo)的 PTB。因此,了解IL-4和IL-10在PTB中的作用有利于臨床轉(zhuǎn)化研究,并可能為PTB治療提供潛在靶點(diǎn)。
許多研究發(fā)現(xiàn)IL-4和IL-10等細(xì)胞因子中的基因多態(tài)性可能在PTB中起重要作用。然而,研究結(jié)果是矛盾的。由于免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)廣泛的文獻(xiàn)檢索和初步篩選,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)選擇了兩種研究賊多的抗炎因子 IL-4 和 10 進(jìn)行進(jìn)一步研究。本系統(tǒng)回顧和薈萃分析旨在確定抗炎細(xì)胞因子基因 IL-4 和 IL-10 的 SNP 與不足月出生之間的關(guān)系。
方法
搜索策略
使用 PubMed、Web of Science 和 Cochrane Library 進(jìn)行了系統(tǒng)的文獻(xiàn)檢索,文章發(fā)表至 2022 年 4 月 2 日。為確保全面的文獻(xiàn)檢索,人工檢索和篩選了納入研究和相關(guān)評(píng)論的參考文獻(xiàn)列表。沒有語(yǔ)言限制。兩位作者(XL 和 XY)使用以下檢索詞獨(dú)立檢索所有數(shù)據(jù)庫(kù):(“多態(tài)性,遺傳”或“多態(tài)性,基因”或“遺傳多態(tài)性”或“基因多態(tài)性”或“基因多態(tài)性”或“基因多態(tài)性”或“多態(tài)性,基因”或“多態(tài)性,基因”或“多態(tài)性(遺傳學(xué))”或“多態(tài)性(遺傳學(xué))”或“基因變異”或“基因變異”或“變異,基因”或“變異,遺傳”或“多樣性” ,遺傳”或“多樣性,
納入和排除標(biāo)準(zhǔn)
以下是免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)系統(tǒng)評(píng)價(jià)和薈萃分析的納入標(biāo)準(zhǔn):1)病例對(duì)照或隊(duì)列研究;2)診斷為早產(chǎn)兒或早產(chǎn)胎膜早破(PPROM)的病例組和足月出生健康人對(duì)照組;3)研究IL-4和IL-10多態(tài)性與PTB或PPROM的關(guān)系;4)為計(jì)算優(yōu)勢(shì)比(ORs)和相應(yīng)的95%置信區(qū)間(CIs)提供了足夠的支持基因型分布的數(shù)據(jù),5)可以獲得全文文章。以下是排除標(biāo)準(zhǔn): 1) 不符合任何納入標(biāo)準(zhǔn)的研究;2) 包含重復(fù)數(shù)據(jù)的研究。
研究選擇和數(shù)據(jù)提取
使用 Endnote (EndNote 2020),在數(shù)據(jù)選擇過(guò)程中排除了重復(fù)研究。進(jìn)一步篩選納入研究的標(biāo)題和摘要,并使用納入和排除標(biāo)準(zhǔn)對(duì)全文進(jìn)行審查。以下特征由兩名審稿人(XL 和 XY)根據(jù)系統(tǒng)評(píng)價(jià)和薈萃分析(PRISMA)指導(dǎo)的先進(jìn)報(bào)告項(xiàng)目獨(dú)立地從每個(gè)符合條件的文獻(xiàn)中提?。合冗M(jìn)作者的姓氏、出版年份、研究國(guó)家、受試者年齡、病例組表型、單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 基因分型方法、病例數(shù)和對(duì)照數(shù)、病例組不足月出生時(shí)間、每項(xiàng)研究的紐卡斯?fàn)?渥太華量表 (NOS) 質(zhì)量評(píng)分、Hardy-Weinberg 平衡 (HWE) ) p-病例和對(duì)照中IL-4和IL-10基因多態(tài)性的對(duì)照值和基因型頻率。分歧通過(guò)討論解決,直到達(dá)成共識(shí),如果出現(xiàn)不一致,則轉(zhuǎn)介專家(CM)。
質(zhì)量評(píng)估
兩位評(píng)審員(XL 和 XY)使用 NOS 獨(dú)立評(píng)估納入文獻(xiàn)的方法質(zhì)量,以確定薈萃分析中非隨機(jī)研究的質(zhì)量。NOS 使用星級(jí)評(píng)定系統(tǒng)評(píng)估質(zhì)量;評(píng)分范圍為 0 到 9 星且≥7 星的研究被認(rèn)為是高質(zhì)量的。兩位評(píng)審員之間的爭(zhēng)議以上述相同方式解決。
異質(zhì)性和發(fā)表偏倚的評(píng)估
根據(jù)Cochrane Q檢驗(yàn),使用標(biāo)準(zhǔn)χ 2檢驗(yàn)(α = 0.1)和I 2檢驗(yàn)評(píng)估統(tǒng)計(jì)異質(zhì)性。如果滿足p ≥ 0.05 和 I 2 ≤ 50%,則使用固定效應(yīng)模型(Mantel-Haenszel 方法)確認(rèn)集體有效性。如果p < 0.05 或 I 2 > 50% ,則使用隨機(jī)效應(yīng)模型。Eggers 的發(fā)表偏倚圖用于以圖形方式表示發(fā)表偏倚。使用修剪和填充方法調(diào)整發(fā)表偏倚。此外,發(fā)表偏倚(p < 0.05)在免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)的討論部分進(jìn)行了仔細(xì)討論,并列為免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)薈萃分析的局限性之一。
統(tǒng)計(jì)分析
使用Stata(17.0版)軟件進(jìn)行薈萃分析。計(jì)算 OR 和 95% CI 以評(píng)估 IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872)(在“dpSNP”數(shù)據(jù)庫(kù)中稱為 T/G)、IL-10- 819T/C(rs1800871)(在“dpSNP”數(shù)據(jù)庫(kù)中稱為A/G)和IL-10-1082A/G(rs1800896)(在“dpSNP”數(shù)據(jù)庫(kù)中稱為T/C)等位基因模型T中的多態(tài)性和PTB -等位基因與。C 等位基因,C 等位基因與. A 等位基因、C 等位基因與. T 等位基因和 G 等位基因與. A 等位基因,隱性模型 TT與. CT + CC,CC與. AA + AC,CC與. TT + TC 和 GG與. AA + AG,主導(dǎo)模型 CT+TT與. 抄送,交流 + 抄送與。AA、TC + CC與. TT 和 AG + GG與. AA,共同主導(dǎo)模型 TT與. CC 和 CT與. CC、CC與. AA 和 AC與. AA、CC與. TT 和 TC與. TT、AG與. AA 和 GG與. AA 和過(guò)度主導(dǎo)模型 CC + TT與. CT、AA + CC與. AC、TT + CC與. TC 和 AA + GG與. 分別為 AG。根據(jù)HWE,在一對(duì)等位基因的情況下,基因p(顯性)和基因q(隱性)基因頻率之間的關(guān)系如下:p + q= 1, p2 + 2 pq + q2。如果在納入研究中僅提供基因型或等位基因頻率信息,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)使用此公式計(jì)算特定基因模型的數(shù)量。亞組分析用于按種族或?qū)φ盏?HWE p值調(diào)查異質(zhì)性的潛在來(lái)源。擬合優(yōu)度 χ2 檢驗(yàn)評(píng)估對(duì)照組的 HWE 偏差。免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)進(jìn)行了敏感性分析以確定免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)研究結(jié)果的穩(wěn)健性。對(duì)于敏感性分析,使用了留一法的薈萃分析。p值< 0.05 被認(rèn)為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
試驗(yàn)序列分析
使用 TSA-Trial Sequential Analysis Viewer(版本 0.9.5.10 β,Copenhagen Trial Unit,Copenhagen,Denmark)進(jìn)行試驗(yàn)序貫分析 (TSA) 。然后自動(dòng)生成所需的信息大小和 TSA 監(jiān)控邊界。
SNP的表達(dá)定量性狀基因座評(píng)估
免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)使用一個(gè)公開可用的數(shù)據(jù)庫(kù)(QTLbase:http ://www.mulinlab.org/qtlbase/index.html)搜索了 SNP 的表達(dá)數(shù)量性狀基因座(eQTL )。結(jié)果表示為每個(gè) SNP 的標(biāo)稱p值。
結(jié)果
研究選擇
根據(jù) PRISMA 流程圖,對(duì) PubMed、Web of Science 和 Cochrane 圖書館的系統(tǒng)文獻(xiàn)檢索產(chǎn)生了 191 項(xiàng)研究,包括 26 條重復(fù)記錄(圖1, 和表 S1 )。在審查了 165 篇非重復(fù)文章的標(biāo)題和摘要后,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)排除了 124 篇研究,原因如下:1)研究是評(píng)論文章(n = 16);2) 研究是會(huì)議報(bào)告(n = 10);3) 研究是關(guān)于不足月出生并發(fā)癥的 (n = 9);4) 其他不相關(guān)的研究 (n = 92)。其余 38 項(xiàng)研究中,15 項(xiàng)因缺乏合格數(shù)據(jù)而被排除,1 項(xiàng)研究因數(shù)據(jù)重復(fù)而被排除。賊后,本研究納入了 21 項(xiàng)符合條件的研究(IL-4 = 5,IL-10 = 16,包含四項(xiàng)重復(fù)研究),總樣本量為 29 至 559 例。這些研究包括不足月出生或 PPROM 病例以及健康對(duì)照。利用這些研究,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)調(diào)查了 IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872)、IL-10-819T/C (rs1800871) 和 IL- 10-1082A/G (rs1800896) 基因多態(tài)性和不足月出生的風(fēng)險(xiǎn)。
圖1:PRISMA 流程圖。PRISMA,系統(tǒng)評(píng)價(jià)和元分析的先進(jìn)報(bào)告項(xiàng)目。
研究特點(diǎn)
表1總結(jié)了免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)系統(tǒng)評(píng)價(jià)薈萃分析中納入研究的主要特征。從 2004 年到 2020 年,這些研究包括 538 例和 1123 例 IL-4-590C/T (rs2243250) 對(duì)照、787 例和 1756 例 IL-10-592A/C (rs1800872) 對(duì)照、1225 例和 1769 例 IL- 10-819T/C (rs1800871) 和 1612 例和 3386 例 IL-10-1082A/G (rs1800896) 的對(duì)照。因?yàn)椴皇撬械幕蛐投急昏b定出來(lái),所以基因型的數(shù)量與病例和對(duì)照的數(shù)量有些不一致。大多數(shù)病例組是不足月出生患者,一些研究包括 PPROM 患者。大多數(shù)研究的 NOS 評(píng)分大于或等于 7,表明質(zhì)量較高。
表1:納入研究的主要特征
IL-4-590C/T (rs2243250) | ||||||||||||||||
作者 | 年 | 案例/控制 | 種族 | 年齡(平均值±標(biāo)準(zhǔn)差)或[范圍] | 單核苷酸多態(tài)性 | 案例 | 控件 | HWE( P )控制 | 表型 | PTB時(shí)間 | NOS評(píng)分 | |||||
案例 | 控件 | TT | 電腦斷層掃描 | 抄送 | TT | 電腦斷層掃描 | 抄送 | |||||||||
柳博米爾斯卡婭等 | 2020 | 50/50 | 烏克蘭 | 29.60 ± 6.30 | TaqMan-SNP | 2 | 11 | 37 | 3 | 19 | 28 | 0.92 | 可編程只讀存儲(chǔ)器 | 26-34W | 8 | |
海因茨曼等人 | 2009 | 121/270 | 德語(yǔ) | 納米 | 納米 | PCR-RFLP | 2 | 25 | 94 | 7 | 74 | 189 | 0.95 | PTB | <32W | 6 |
卡利什等人 | 2004年 | 29/44 | 美國(guó)人 | 納米 | 納米 | PCR-SSP | 6 | 9 | 14 | 1 | 14 | 29 | 0.65 | PTB | <37W | 7 |
Annells 等人 | 2004年 | 202/185 | 澳大利亞人 | 29.33[15-44] | 30[18-43] | PCR-SSP | 4 | 36 | 162 | 2 | 46 | 137 | 0.39 | PTB | 20-35W | 9 |
恩格爾等人 | 2005年 | 136/574 | 美國(guó)人 | 26.60 ± 6.40 | 26.60 ± 6.10 | TaqMan-SNP | 5 | 44 | 87 | 10 | 130 | 434 | 0.94 | PTB | 24-29W | 7 |
IL-10-592A/C (rs1800872) | ||||||||||||||||
作者 | 年 |
案例/ 控制 |
種族 | 年齡(平均值±標(biāo)準(zhǔn)差)或[范圍] | 單核苷酸多態(tài)性 | 案例 | 控件 | HWE( P )控制 | 表型 | PTB時(shí)間 | NOS評(píng)分 | |||||
案例 | 控件 | 抄送 | 交流電 | AA | 抄送 | 交流電 | AA | |||||||||
柳博米爾斯卡婭等 | 2020 | 50/50 | 烏克蘭 | 29.60 ± 6.30 | TaqMan-SNP | 25 | 18 | 7 | 2 | 37 | 11 | 0.00 | 可編程只讀存儲(chǔ)器 | 26-34W | 8 | |
韓等人 | 2020 | 115/147 | 韓國(guó)人 | 30.52 ± 4.60 | 30.47 ± 4.89 | PCR-RFLP | 14 | 58 | 43 | 20 | 56 | 71 | 0.10 | PTB | 24-37W | 9 |
潘迪等人 | 2018 | 559/559 | 印度人 | 25.85 ± 4.17 | 25.67 ± 3.72 | ARMS-PCR | 334 | 147 | 78 | 355 | 145 | 59 | 0.00 | PTB | <37W | 8 |
拉莫斯等人 | 2016 年 | 201/201 | 巴西人 |
22.80 ± 6.30 26.20 ± 6.20 |
23.90 ± 6.10 | TaqMan-SNP | 69 | 53 | 10 | 79 | 93 | 27 | 0.96 |
PTB/ PPROM |
<37W | 7 |
梅農(nóng)等人 | 2010 | 83/40 | 美國(guó)人 |
25.32 ± 5.53 27.33 ± 6.30 |
25.22 ± 5.29 27.33 ± 6.30 |
NM | 45 | 33 | 5 | 26 | 10 | 4 | 0.07 | PTB | 22-36W | 6 |
Engel et al | 2005 | 136/574 | American | 26.60 ± 6.40 | 26.60 ± 6.10 | TaqMan-SNP | 69 | 55 | 12 | 256 | 247 | 71 | 0.34 | PTB | 24-29W | 7 |
Annells et al | 2004 | 202/185 | Australian | 29.33[15-44] | 30[18-43] | PCR-SSP | 123 | 69 | 10 | 112 | 64 | 9 | 0.97 | PTB | 20-35W | 9 |
IL-10-819T/C(rs1800871) | ||||||||||||||||
Author | Year |
Cases/ Controls |
Racial | Age (mean ± SD) or [range] | SNP GM | Cases | Controls | HWE(P) control | Phenotype | PTB time | NOS score | |||||
Cases | Controls | CC | TC | TT | CC | TC | TT | |||||||||
Lyubomirskaya et al | 2020 | 50/50 | Ukrainian | NM | NM | TaqMan-SNP | 11 | 2 | 37 | 4 | 7 | 39 | 0.00 | PPROM | 26-34W | 8 |
Pandey et al | 2018 | 559/559 | Indian | 25.85 ± 4.17 | 25.67 ± 3.72 | ARMS-PCR | 285 | 190 | 84 | 304 | 180 | 76 | 0.00 | PTB | <37W | 8 |
Ramos et al | 2016 | 201/201 | Brazilian |
22.80 ± 6.30 26.20 ± 6.20 |
23.90 ± 6.10 | TaqMan-SNP | 64 | 56 | 12 | 78 | 93 | 28 | 0.97 |
PTB/ PPROM |
<37W | 7 |
Nuk et al | 2012 | 77/200 | Austrian | 31[26-35] | 29[24-34] | PCR-SSP | 36 | 31 | 6 | 109 | 73 | 15 | 0.57 | PTB | 29-30W | 7 |
Engel et al | 2005 | 136/574 | American | 26.60 ± 6.40 | 26.60 ± 6.10 | TaqMan-SNP | 69 | 55 | 12 | 256 | 247 | 71 | 0.34 | PTB | 24-29W | 7 |
Annells et al | 2004 | 202/185 | Australian | 29.33[15-44] | 30[18-43] | PCR-SSP | 123 | 69 | 10 | 112 | 64 | 9 | 0.97 | PTB | 20-35W | 9 |
IL-10-1082A/G (rs1800896) | ||||||||||||||||
Author | Year |
Cases/ Controls |
Racial | Age (mean ± SD) or [range] | SNP GM | Cases | Controls | HWE(P) control | Phenotype | PTB time | NOS score | |||||
Cases | Controls | GG | AG | AA | GG | AG | AA | |||||||||
Pandey et al | 2018 | 559/559 | Indian | 25.85 ± 4.17 | 25.67 ± 3.72 | ARMS-PCR | 190 | 291 | 78 | 246 | 257 | 56 | 0.35 | PTB | <37W | 8 |
努克等人 | 2012 | 77/200 | 奧地利人 | 31[26-35] | 29[24-34] | PCR-SSP | 11 | 43 | 23 | 30 | 90 | 60 | 0.70 | PTB | 29-30W | 7 |
梅農(nóng)等人 | 2010 | 83/40 | 美國(guó)人 |
25.32 ± 5.53 27.33 ± 6.30 |
25.22 ± 5.29 27.33 ± 6.30 |
納米 | 13 | 53 | 17 | 9 | 19 | 12 | 0.78 | PTB | 22-36W | 6 |
莫拉等人 | 2009 | 192/198 | 巴西人 | 24.10 ± 6.20 | 23.60 ± 6.60 | PCR-SSP | 25 | 100 | 67 | 24 | 93 | 81 | 0.73 | PTB | 24-36+6W | 7 |
斯通克等人 | 2008年 | 86/1362 | 奧地利人 | 23.70 ± 4.70 | PCR-RFLP | 14 | 52 | 20 | 237 | 669 | 456 | 0.76 | PTB | <37W | 7 | |
斯佩爾等人 | 2006年 | 80/80 | 美國(guó)人 | 26.90 ± 6.60 | 26.40 ± 6.70 | PCR-SSP | 16 | 41 | 19 | 17 | 39 | 23 | 0.95 | PTB | <37W | 8 |
馬塔爾等人 | 2006年 | 139/119 | 巴西人 | 35[18-45] | 納米 | PCR-SSP | 15 | 68 | 51 | 15 | 57 | 47 | 0.72 | PTB | <37W | 7 |
柯克等人 | 2006年 | 29/25 | 德語(yǔ) | 32[22-44] | 32[20-36] | PCR-RFLP | 6 | 19 | 4 | 5 | 11 | 9 | 0.63 | PTB | <29W | 8 |
恩格爾等人 | 2005年 | 136/574 | 美國(guó)人 | 26.60 ± 6.40 | 26.60 ± 6.10 | TaqMan-SNP | 69 | 55 | 12 | 256 | 247 | 71 | 0.34 | PTB | 24-29W | 7 |
卡利什等人 | 2004年 | 29/44 | 美國(guó)人 | 34[20-49] | PCR-SSP | 4 | 14 | 9 | 8 | 19 | 14 | 0.73 | PTB | 24-37W | 7 | |
Annells 等人 | 2004年 | 202/185 | 澳大利亞人 | 29.33[15-44] | 30[18-43] | PCR-SSP | 61 | 85 | 56 | 40 | 101 | 44 | 0.21 | PTB | 20-35W | 9 |
SD,標(biāo)準(zhǔn)差;HWE,Hardy-Weinberg 均衡;NOS,紐卡斯?fàn)?渥太華量表;PPROM,早產(chǎn)胎膜早破;GM,基因型法;W,周;PCR-RFLP,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性;NM,未提及;PTB,早產(chǎn);VNTR,可變數(shù)量的串聯(lián)重復(fù);PCR-SSP、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)和序列特異性引物;ARMS-PCR,多重?cái)U(kuò)增耐藥突變系統(tǒng);SNP,單核苷酸多態(tài)性。
薈萃分析結(jié)果
免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)綜述中的五項(xiàng)研究調(diào)查了 IL-4-590C/T (rs2243250) 多態(tài)性與早產(chǎn)之間的關(guān)聯(lián)。在不同的遺傳模型下,未發(fā)現(xiàn)早產(chǎn)的總體風(fēng)險(xiǎn)與 SNP 之間存在顯著關(guān)聯(lián)(表 2 )。種族亞組分析顯示,在不同遺傳模型下,PTB 與 IL-4-590C/T (rs2243250) 多態(tài)性之間沒有顯著關(guān)聯(lián)。
表 2:總體分析和亞組分析的主要結(jié)果
IL-4-590C/T (rs2243250) |
|||||||||||||||||||||
研究小組 | T 等位基因與 C 等位基因 |
CT+TT 與 CC |
TT 與 CT+CC |
TT 與 CC | CT與CC | CC+TT 與 CT | |||||||||||||||
或(95% 置信區(qū)間) | P值 |
或(95% 置信區(qū)間) |
P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | ||||||||||
全面的 | 1.03[0.61,1.75] | 0.91 |
0.94[0.55,1.62] |
0.83 | 1.73[0.91,3.28] | 0.09 | 1.68[0.88,2.20] | 0.12 | 0.87[0.53,1.42] | 0.57 | 1.20[0.75,1.89] | 0.45 | |||||||||
亞組分析 |
|||||||||||||||||||||
烏克蘭 | 0.53[0.26,1.08] | – |
0.45[0.19,1.04] |
– | 0.65[0.10,4.09] | – | 0.50[0.08,3.23] | – | 0.44[0.18,1.17] | – | 2.17[0.90,5.24] | – | |||||||||
德語(yǔ) | 0.70[0.45,1.10] | – |
0.67[0.41,1.11] |
– | 0.63[-.13,3.09] | – | 0.57[0.12,2.82] | – | 0.68[0.41,1.14] | – | 1.45[0.87,2.43] | – | |||||||||
美國(guó)人 | 1.79[1.28,2.50] | 0.30 |
1.79[1.24,2.59] |
0.75 | 3.47[1.41,8.57] | 0.17 | 3.96[1.58,9.88] | 0.19 | 1.64[1.11,2.40] | 0.68 | 0.66[0.45,0.96] | 0.34 | |||||||||
澳大利亞人 | 0.78[0.51,1.21] | – |
0.70[0.44,1.14] |
– | 1.85[0.33,10.21] | – | 1.69[0.31,9.38] | – | 0.66[0.40,1.08] | – | 1.53[0.93,2.49] | – | |||||||||
IL-10-592A/C (rs1800872) |
|||||||||||||||||||||
研究小組 | C 等位基因與. A等位基因 |
AC+CC與. AA |
抄送與。AA+AC |
抄送與。AA | 交流與。AA | AA+CC與. 交流電 | |||||||||||||||
或(95% 置信區(qū)間) | P值 |
或(95% 置信區(qū)間) |
P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | ||||||||||
全面的 | 1.19[0.89,1.60] | 0.24 |
1.13[0.90,1.42] |
0.29 | 1.31[0.74,2.31] | 0.36 | 1.51[0.86,2.64] | 0.15 | 1.12[0.87,1.44] | 0.36 | 1.09[0.70,1.69] | 0.71 | |||||||||
亞組分析 |
|||||||||||||||||||||
烏克蘭 | 3.06[1.11,5.46] | – |
1.73[0.61,4.91] |
– | 24[5.25,109.65] | – | 19.64[3.50,114.14] | – | 0.76[0.25,2.30] | – | 5.06[2.15,11.91] | – | |||||||||
韓國(guó)人 | 1.09[0.75,1.58] | – |
1.56[0.95,2.57] |
– | 0.88[0.42,1.83] | – | 1.16[0.53,2.52] | – | 1.71[1.01,2.90] | – | 0.60[0.37,0.99] | – | |||||||||
美國(guó)人 | 1.13[0.79,1.60] | 0.25 |
1.50[0.84,2.69] |
0.82 | 0.99[0.51,1.91] | 0.11 | 1.55[0.85,2.84] | 0.86 | 1.46[0.78,2.74] | 0.41 | 0.82[0.39,1.74] | 0.09 | |||||||||
澳大利亞人 | 0.94[0.67,1.32] | – |
0.98[0.39,2.47] |
– | 1.01[0.67,1.53] | – | 0.99[0.39,2.52] | – | 0.97[0.37,2.54] | – | 1.02[0.67,1.55] | – | |||||||||
印度人 | 0.83[0.68,1.00] | – |
0.73[0.51,1.04] |
– | 0.85[0.67,1.09] | – | 0.71[0.49,1.03] | – | 0.77[0.51,1.15] | – | 0.98[0.75,1.28] | – | |||||||||
巴西人 | 1.53[1.09,2.15] | – |
1.92[0.89,4.10] |
– | 1.66[1.07,2.59] | – | 2.36[1.07,5.22] | – | 1.54[0.69,3.42] | – | 1.31[0.84,2.04] | – | |||||||||
按 HWE p值 |
|||||||||||||||||||||
≤0.1 | 1.20[0.68,2.13] | 0.00 |
1.01[0.77,1.33] |
0.05 | 1.64[0.36,7.45] | 0.00 | 1.83[0.50,6.63] | 0.00 | 1.05[0.78,1.42] | 0.06 | 1.08[0.41,2.84] | 0.00 | |||||||||
>0.1 | 1.22[0.94,1.59] | 0.13 |
1.47[0.96,2.26] |
0.55 | 1.28[0.99,1.66] | 0.28 | 1.51[0.86,2.64] | 0.86 | 1.30[0.82,2.04] | 0.77 | 1.13[0.89,1.44] | 0.72 | |||||||||
IL-10-819T/C (rs1800871) |
|||||||||||||||||||||
研究小組 | C 等位基因與. T等位基因 |
TC+CC與. TT |
抄送與。TT+TC |
抄送與。TT | TC與. TT | TT+CC與. TC | |||||||||||||||
或(95% 置信區(qū)間) | P值 |
或(95% 置信區(qū)間) |
P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | ||||||||||
全面的 | 1.04[0.92,1.17] | 0.56 |
1.07[0.84,1.36] |
0.59 | 1.04[0.89,1.21] | 0.66 | 1.11[0.86,1.43] | 0.41 | 1.03[0.79,1.34] | 0.84 | 1.01[0.86,1.19] | 0.92 | |||||||||
|
|||||||||||||||||||||
<0.05 | 0.93[0.78,1.11] | 0.07 |
0.92[0.67,1.27] |
0.50 | 0.92[0.74,1.16] | 0.04 | 0.94[0.67,1.31] | 0.06 | 0.89[0.62,1.28] | 0.18 | 0.96[0.75,1.23] | 0.08 | |||||||||
>0.05 | 1.14[0.97,1.35] | 0.23 |
1.32[0.90.1.94] |
0.72 | 1.14[0.92,1.42] | 0.29 | 1.40[0.94,2.09] | 0.50 | 1.23[0.82,1.85] | 0.25 | 1.05[0.84,1.30] | 0.71 | |||||||||
IL-10-1082A/G (rs1800896) |
|||||||||||||||||||||
研究小組 |
G 等位基因與. A等位基因 |
AG+GG與. AA |
GG對(duì)。AA+AG |
AG與. AA |
AA+GG與. 股份公司 |
||||||||||||||||
或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | 或(95% 置信區(qū)間) | P值 | ||||||||||||
全面的 | 0.99[0.90,1.09] | 0.82 | 1.10[0.93,1.29] | 0.27 | 0.90[0.77,1.05] | 0.16 | 1.13[0.95,1.34] | 0.16 | 0.87[0.76,0.99] | 0.04 | |||||||||||
亞組分析 |
|||||||||||||||||||||
德國(guó)人 | 1.59[0.74,3.40] | – |
3.52[0.93,13.35] |
– | 1.04[0.28,3.04] | – | 3.89[0.97,15.64] | 0.41[0.14,1.24] | – | ||||||||||||
美國(guó)人 | 1.15[0.93,1.42] | 0.83 |
1.36[0.92,2.00] |
0.90 | 1.10[0.81,1.50] | 0.50 | 1.39[0.92,2.08] | 0.86 | 0.91[0.69,1.22] | 0.34 | |||||||||||
澳大利亞人 | 1.10[0.83,1.45] | – |
0.81[0.51,1.29] |
– | 1.57[0.99,2.49] | – | 0.66[0.41,1.08] | – | 1.66[1.11,2.47] | – | |||||||||||
奧地利人 | 1.13[0.89,1.43] | 0.52 |
1.44[0.98,2.10] |
0.38 | 0.89[0.56,1.41] | 0.83 | 1.52[1.02,2.26] | 0.39 | 0.69[0.49,0.97] | 0.53 | |||||||||||
巴西人 | 1.09[0.87,1.37] | 0.53 |
1.20[0.87,1.64] |
0.56 | 1.00[0.62,1.60] | 0.66 | 1.22[0.87,1.70] | 0.63 | 0.84[0.62,1.15] | 0.78 | |||||||||||
印度人 | 0.74[0.62,0.88] | – |
0.69[0.48,0.99] |
– | 0.66[0.51,0.83] | – | 0.81[0.55,1.19] | – | 0.78[0.62,0.99] | – | |||||||||||
CI,置信區(qū)間;或,優(yōu)勢(shì)比;HWE,哈代-溫伯格平衡。
七項(xiàng)研究評(píng)估了 IL-10-592A/C (rs1800872) 多態(tài)性與早產(chǎn)之間的關(guān)系。在不同的基因因素模型下,未發(fā)現(xiàn)早產(chǎn)的總體風(fēng)險(xiǎn)與 rs1800872 之間存在顯著關(guān)聯(lián)(表 2)。通過(guò)對(duì)照的種族和 HWE p值進(jìn)行的亞組分析也表明早產(chǎn)與不同遺傳模型下的 IL-10-592A/C (rs1800872) 多態(tài)性之間沒有顯著關(guān)聯(lián)。
共納入 6 項(xiàng)研究探討 IL-10-819T/C (rs1800871) 多態(tài)性與早產(chǎn)的關(guān)系,不同基因模型下早產(chǎn)的總體風(fēng)險(xiǎn)與 rs1800871 之間未發(fā)現(xiàn)顯著相關(guān)性表 2, )。通過(guò)對(duì)照的 HWE p值進(jìn)行的亞組分析也顯示早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)與不同遺傳模型下的 IL-10-819T/C (rs1800871) 多態(tài)性之間沒有顯著關(guān)聯(lián)。
納入 11 項(xiàng)研究以調(diào)查 IL-10-1082A/G (rs1800896) 多態(tài)性與早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)之間的聯(lián)系。過(guò)度顯性基因模型 AA + GG與. AG 顯示 IL-10-1082A/G (rs1800896) 和早產(chǎn)之間存在顯著關(guān)聯(lián)(OR [95% CI] = 0.87[0.76, 0.99], p = 0.04)(表 2)。在過(guò)度顯性基因模型下,這種多態(tài)性對(duì)PTB易感性具有保護(hù)作用。在奧地利、美國(guó)、巴西、巴西和德國(guó)亞組中,不同遺傳模型下早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)與 rs1800896 之間沒有顯著關(guān)聯(lián)(圖 S8)。然而,從等位基因模型 G 等位基因與. A 等位基因,隱性模型 GG與。AA + AG,主導(dǎo)模型 AG + GG與. AA,以及過(guò)度主導(dǎo)模型 AA + GG與. AG在印度。但需要注意的是,樣本量很小,只包括了一項(xiàng)印度研究。
圖 2:IL-10-1082A/G(rs1800896) 多態(tài)性和早產(chǎn)的森林圖。等位基因模型(G vs A)、隱性模型(GG vs. AA+AG)、顯性模型(AG+GG vs AA)、共顯性模型(AG vs. AA)和過(guò)度顯性模型(AA+GG vs .AG)。每項(xiàng)研究的基因型計(jì)數(shù)、體重、OR、95% 置信區(qū)間。根據(jù)異質(zhì)性分別采用固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)模型。
在IL-10-1082A/G(rs1800896)發(fā)表偏倚方面,漏斗圖有比較明顯的不對(duì)稱性(圖 3),表明存在一定程度的發(fā)表偏倚。由于異質(zhì)性低,不太可能是由異質(zhì)性引起的發(fā)表偏倚,如在圖 2. 通過(guò)目測(cè)對(duì) IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 的漏斗圖評(píng)估是對(duì)稱的,表明沒有顯著性差異發(fā)表偏倚。
圖 3:IL-10-1082A/G(rs1800896) 多態(tài)性的發(fā)表偏倚漏斗圖
根據(jù)隨機(jī)或固定效應(yīng)模型,使用留一法森林圖對(duì)納入研究進(jìn)行敏感性分析,以研究免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)結(jié)果的敏感性。研究的順序排除對(duì)上述所有發(fā)現(xiàn)沒有顯著影響,表明它們的穩(wěn)健性(圖 4)。
圖 4:敏感性分析:IL-10-1082A/G(rs1800896) 多態(tài)性和 PTB(AA+GG 與 AG)的留一法薈萃分析。
TSA 分析
為了提高免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)研究結(jié)果的穩(wěn)健性,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)對(duì) IL-10-1082A/G (rs1800896) 的過(guò)度顯性基因模型(AA + GG與AG)、等位基因模型 T-等位基因與. IL-4-590C/T (rs2243250) 的 C 等位基因,C 等位基因與. IL-10-592A/C(rs1800872) 的 A 等位基因和 C 等位基因與. IL-10-819T/C (rs1800871) 多態(tài)性的 T 等位基因 (圖 5 )。在每個(gè)多態(tài)性的所有基因模型中都進(jìn)行了TSA,發(fā)現(xiàn)了相似的結(jié)果,因此以上述結(jié)果為例。研究結(jié)果表明,IL-10-1082A/G (rs1800896) 多態(tài)性的過(guò)度顯性基因模型(AA + GG vs. AG)的累積 Z 曲線越過(guò)了試驗(yàn)順序監(jiān)測(cè)邊界(I 型錯(cuò)誤 5%,Z得分 = 1.96) 在達(dá)到所需信息大小 (TSA = 4376) ( 圖 5)。在 IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 多態(tài)性(分別為 TSA = 5142 和 34107)的等位基因模型中觀察到類似的模式。然而,IL-4-590C/T (rs2243250) 多態(tài)性等位基因模型的累積 Z 曲線沒有跨越試驗(yàn)序貫監(jiān)測(cè)邊界(I 型錯(cuò)誤 5%,Z 分?jǐn)?shù) = 1.96),沒有達(dá)到所需信息大小(TSA = 10223)。因此,累積的證據(jù)足以支持 IL-10-1082A/G (rs1800896)、IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 多態(tài)性和早產(chǎn)的結(jié)論在相應(yīng)的基因模型中。此外,需要更多的研究來(lái)證實(shí)不同基因模型中 IL-4-590C/T (rs2243250) 多態(tài)性與早產(chǎn)之間的真實(shí)關(guān)系。
圖 5:IL-10-1082A/G(rs1800896) 多態(tài)性和早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)之間的 TSA(AA+GG 與 AG)
SNP 的 eQTL
為了確定上述 SNP 是否在血液中顯示為 eQTL 的證據(jù),免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)檢查了 eQTL 的“QTLbase”。四個(gè) SNP 的 eQTL的有效等位基因和p值具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p < 10 -8)。
基因檢測(cè)在胎兒早產(chǎn)的應(yīng)用性研究
在本系統(tǒng)回顧和薈萃分析中,過(guò)度顯性基因模型 AA+GG與. AG 揭示了 IL-10-1082A/G (rs1800896) 和早產(chǎn)之間的顯著關(guān)聯(lián)。此外,由于其他位點(diǎn)的基因檢測(cè)研究數(shù)量不足,本研究排除了許多其他 IL-4 和 IL-10 基因多態(tài)性的位點(diǎn)。
人類分娩是一個(gè)炎癥過(guò)程,當(dāng)炎癥平衡被破壞時(shí),炎癥級(jí)聯(lián)反應(yīng)的形成可導(dǎo)致PTB的發(fā)生??寡准?xì)胞因子對(duì)于維持妊娠至關(guān)重要 。此外,抗炎細(xì)胞因子 IL-4 和 IL-10 抑制促炎細(xì)胞因子的產(chǎn)生,減少 IL-4 和 IL-10 的產(chǎn)生可能增加對(duì)感染的易感性并導(dǎo)致早產(chǎn)。在比較早產(chǎn)和足月胎盤時(shí),研究人員發(fā)現(xiàn)足月胎盤具有更高的 IL-4 和 IL-10 。此外,研究表明早產(chǎn)的炎癥反應(yīng)受基因控制。因此,IL-4 和 IL-10 中的 SNP 可能導(dǎo)致抗炎細(xì)胞因子降低,從而將細(xì)胞因子平衡轉(zhuǎn)向炎癥。因此,IL-4 和 IL-10 中的 SNP 已被廣泛研究為預(yù)測(cè)??早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)的潛在候選者 。
在多胎妊娠中,-590 位的 IL-4 C > T 替代與 IL-4 的產(chǎn)生增加和對(duì)早產(chǎn)的易感性有關(guān) 。同樣,Heinzmann 等人。和 Belousova 等人發(fā)現(xiàn) IL-4-590C/T (rs2243250) 基因多態(tài)性與早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)之間存在關(guān)聯(lián) 。另一方面,Lyubomirskaya 等人發(fā)現(xiàn) IL-4 SNP 與烏克蘭扎波羅熱地區(qū)人群中 PPROM 的風(fēng)險(xiǎn)或保護(hù)作用之間沒有顯著關(guān)聯(lián) 。這項(xiàng)薈萃分析發(fā)現(xiàn) IL-4-590C/T (rs2243250) 基因多態(tài)性與早產(chǎn)之間沒有顯著關(guān)聯(lián)。然而,IL-4 590 T 等位基因頻率在某些種族群體中異常高。免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)基于種族的亞組分析還發(fā)現(xiàn) IL-4-590C/T (rs2243250) 基因多態(tài)性與早產(chǎn)之間沒有顯著聯(lián)系。這可能是由于納入的研究數(shù)量較少,研究之間存在相當(dāng)大的異質(zhì)性,這需要進(jìn)一步的研究證實(shí)。
另一種眾所周知的可以抑制促炎細(xì)胞因子的抗炎細(xì)胞因子是 IL-10 。IL-10 的基因變異可能會(huì)影響基因表達(dá),從而影響其水平,從而導(dǎo)致孕婦和早產(chǎn)的炎癥失衡 。IL-10-592A/C (rs1800872)、IL-10-819T/C (rs1800871) 和 IL-10-1082A/G (rs1800896) 中的多態(tài)性是早產(chǎn)研究中常見的 SNP 。然而,對(duì) IL-10 基因多態(tài)性和早產(chǎn)的研究得出了相互矛盾的結(jié)果。梅農(nóng)等人。發(fā)現(xiàn) IL-10 SNPs 和早產(chǎn)相互作用的差異可能有基因基礎(chǔ)。同時(shí),Moura 等人、Stonek 等人和 Mattar 等人。表明 IL-10-1082A/G (rs1800896) 多態(tài)性不是識(shí)別早產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn)增加的女性的基因標(biāo)記。然而,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)的研究結(jié)果表明,IL-10-1082A/G (rs1800896) 過(guò)度顯性基因模型 AA+GG與. AG對(duì)PTB有顯著的保護(hù)作用。同樣,Kerk 等人。揭示 IL-10-1082A/G (rs1800896) 可能在持續(xù)不到 29 周的嚴(yán)重早產(chǎn)中起作用 。在 IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 的其他基因模型與早產(chǎn)之間未發(fā)現(xiàn)顯著關(guān)聯(lián)。此外,在亞組分析中未發(fā)現(xiàn)種族差異。
埃斯克代爾等人。發(fā)現(xiàn)人類分泌 IL-10 的能力因 IL-10 基因座的基因組成而異 。同樣,蘇亞雷斯等人。發(fā)現(xiàn) IL-10(mRNA 和血清蛋白)水平顯示出顯著的個(gè)體間變異,這些變異在基因啟動(dòng)子 處受多態(tài)性變異的基因控制。1082 G 基因型純合子個(gè)體的 IL-10 水平有較高的趨勢(shì),但 AG 和 AA 基因型組之間 IL-10 的表達(dá)沒有差異 。該研究還發(fā)現(xiàn),在具有-1082 GG和GA基因型的個(gè)體中,IL-10轉(zhuǎn)錄物的濃度相當(dāng)分散(四分位距= 13.85和18.87),表明還涉及其他基因或環(huán)境因素。此外,體外和動(dòng)物研究表明,IL-10 可以改善 LPS 誘導(dǎo)的早產(chǎn)模型的結(jié)果 。臨床研究表明,較低的 IL-10 水平與早產(chǎn)顯著相關(guān),并有可能用作預(yù)測(cè)早產(chǎn)的生物標(biāo)志物。eQTL 評(píng)估結(jié)果表明,本研究中的 4 個(gè) SNP(rs2243250、rs1800872、rs1800871 和 rs1800896)與相應(yīng)基因(IL-4 和 IL-10)的表達(dá)顯著相關(guān),這也證明了過(guò)- PTB上IL-10-1082A/G(rs1800896)多態(tài)性的顯性基因模型AA+GG vs AG可能是由于血液中IL-10表達(dá)的增加??傮w而言,這些發(fā)現(xiàn)表明 AA+GG 與 IL-10-1082A/G (rs1800896) 基因型的 AG 對(duì)早產(chǎn)的保護(hù)作用可能是由于 IL-10 水平的增加。此外,-1082 AG 和 AA 基因型之間的差異可能是由于其他未知的基因或環(huán)境因素。
免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)的研究也有一些局限性。首先,涉及 IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 的研究數(shù)量很少。其次,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)只對(duì)不同國(guó)家進(jìn)行了亞組分析,而沒有在國(guó)家不同種族之間進(jìn)行分析,這可能掩蓋了種族差異引起的相關(guān)性。第三,IL-10-1082A/G(rs1800896)存在發(fā)表偏倚風(fēng)險(xiǎn),部分基因型數(shù)據(jù)是通過(guò)計(jì)算得到的,可能與原始數(shù)據(jù)存在差異。賊后,沒有發(fā)表偏倚表明 IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 的納入研究存在顯著的異質(zhì)性。
總之,免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)的研究結(jié)果表明,過(guò)度顯性基因模型 AA + GG與. IL-10-1082A/G(rs1800896)多態(tài)性的AG可能與PTB的基因易感性有關(guān),并可能具有保護(hù)作用。另一方面,IL-4-590C/T (rs2243250)、IL-10-592A/C (rs1800872) 和 IL-10-819T/C (rs1800871) 多態(tài)性與早產(chǎn)無(wú)關(guān)。由于納入研究的局限性和發(fā)表偏倚的風(fēng)險(xiǎn),未來(lái)需要在更大人群中進(jìn)行研究來(lái)證實(shí)免疫科基因檢測(cè)如何識(shí)別早產(chǎn)的易感性重大課題團(tuán)隊(duì)的研究結(jié)果。
Association of IL-4 and IL-10 Polymorphisms With Preterm Birth Susceptibility: A Systematic Review and Meta-Analysis.
Cao XL, Zhou XY, Xu NX, Chen SC, Xu CM.Front Immunol. 2022 Jul 4;13:917383. doi: 10.3389/fimmu.2022.917383. eCollection 2022.