【佳學基因檢測】腫瘤基因檢測需要包括重復或反復區(qū)域的分析嗎？

腫瘤基因檢測導讀：

重復序列大約占人類基因組的50%。這些序列高度變異，并已用于基因組連鎖圖譜繪制和使用微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI）測試診斷DNA錯配修復缺陷的癌癥。對于部分基因檢測機構來說，使用全基因組測序（WGS）和下一代測序（NGS）方法分析這些重復區(qū)域中的突變和變異仍然具有困難，因為它們所采用短讀序列技術在檢測序的比對方面存在困難。賊近的一項研究分析了約1000個WGS數(shù)據(jù)中的MS突變，這些數(shù)據(jù)覆蓋了23種癌癥類型，并確定了DNA修復和致癌途徑中反復受到MSI影響的基因，同時發(fā)現(xiàn)了頻繁顯示MSI的非編碼位點?？赊D座遺傳元素是人類基因組中的一種豐富組分，它們可以復制并將自身的副本插入到其他位置。這些轉座子在驅動基因組演化和多樣性方面起著重要作用。有幾項研究已經(jīng)使用癌癥WGS數(shù)據(jù)分析了轉座子介導的體細胞突變和結構突變（SV），并確定了每個腫瘤中有4-5個體細胞逆轉錄轉座子插入。這些體細胞逆轉錄轉座子插入趨向于發(fā)生在常在癌癥中發(fā)生突變的基因中，并可以改變它們的表達。

重復區(qū)域的突變與腫瘤的發(fā)生與惡化的關系

重復區(qū)域的突變與腫瘤的發(fā)生與惡化之間存在一定的關系。重復區(qū)域是基因組中的一部分，它們包含了重復的DNA序列。在正常情況下，重復區(qū)域的長度和序列都是穩(wěn)定的。然而，當重復區(qū)域發(fā)生突變時，可能會導致一系列的問題。

首先，重復區(qū)域的突變可能導致基因的功能異常。重復區(qū)域通常位于基因的調(diào)控區(qū)域或編碼區(qū)域，突變可能導致基因的表達水平異常或蛋白質結構的改變，從而影響細胞的正常功能。

其次，重復區(qū)域的突變可能導致基因組的不穩(wěn)定性。重復區(qū)域的突變可能導致DNA序列的重復次數(shù)發(fā)生改變，這種改變被稱為擴增或縮減。這種不穩(wěn)定性可能導致基因組的錯配修復機制失效，進而導致更多的突變積累。

賊重要的是，一些重復區(qū)域的突變已經(jīng)被證實與腫瘤的發(fā)生和惡化相關。例如，一些重復區(qū)域的擴增已經(jīng)與某些遺傳性腫瘤綜合征的發(fā)生相關，如亨廷頓病和法拉利病。此外，一些重復區(qū)域的突變也與某些腫瘤的發(fā)生和惡化相關，如結直腸癌和乳腺癌。

總的來說，重復區(qū)域的突變可能導致基因的功能異常、基因組的不穩(wěn)定性以及與腫瘤的發(fā)生和惡化。
 

將腫瘤基因檢測擴展到重復或復制區(qū)域為什么會增加檢測的全面性與正確性？

將腫瘤基因檢測擴展到重復或復制區(qū)域可以增加檢測的全面性與正確性的原因如下：

1. 增加檢測范圍：重復或復制區(qū)域是基因組中存在的重要部分，它們在細胞分裂和基因表達中起著重要作用。通過擴展檢測到這些區(qū)域，可以更全面地了解腫瘤基因組的變異情況。

2. 檢測潛在的致病變異：重復或復制區(qū)域的變異可能導致基因功能異常，進而引發(fā)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。通過檢測這些區(qū)域，可以發(fā)現(xiàn)潛在的致病變異，有助于更正確地評估腫瘤的風險和預后。

3. 提高檢測正確性：重復或復制區(qū)域通常具有高度相似的序列，這增加了檢測的難度。然而，隨著技術的進步，現(xiàn)代基因檢測方法可以通過采用更正確的測序技術和分析算法來克服這些挑戰(zhàn)，提高檢測的正確性。

4. 個性化治療指導：重復或復制區(qū)域的變異可能導致腫瘤對某些藥物的敏感性或耐藥性發(fā)生改變。因此，通過檢測這些區(qū)域，可以為患者提供更正確的個性化治療指導，選擇賊適合其腫瘤特征的治療方案。

綜上所述，將腫瘤基因檢測擴展到重復或復制區(qū)域包括在腫瘤基因檢測中，可以增加檢測的全面性與正確性。