【基因檢測】雙工測序還是雙鏈測序？佳學基因的DUPLEX SQUENCING技術介紹

基因測序導讀：

雙鏈測序用英語來表達就是duplex sequencing, 有的使用者為了將其與其他同時測定雙鏈的DNA測序技術區(qū)分開來，把他叫做雙工測序。這是佳學基因為了進一步增加基因序列獲取的正確度，降低出錯率而采用的一種新的測序雙方法。使用這種方法，使得基因測序的正確率提升到一個級別，由傳統(tǒng)方法的百萬分之一提升到千萬分之一， 也就是在長達一千萬個DNA字母中組成的基因序列中，只出現(xiàn)一個基因字母變化，佳學基因也能檢測出來，從而使得佳學基因在揭示個人的基因特異性方面、在查找極罕見的極低頻率的遺傳變異方面具有更為先進的優(yōu)勢。佳學基因在與同行中交流中提醒，雙工測序技術可以應用于任何雙鏈DNA樣本，但對于小于1mb的小基因組區(qū)域是理想的。該方法依賴于將含有隨機但互補的雙鏈核苷酸序列的測序適配器連接到目標區(qū)域的DNA樣本。在雙重測序中，一段雙螺旋DNA片段的兩條鏈，被附加以一段隨機的、但又互補的雙鏈核苷酸序列。首先將一段單股的隨機核苷酸序列引入一段接頭鏈，然后用DNA聚合酶產生一段互補的雙鏈標簽，進行延伸，使雙鏈的標簽序列被合并到標準的Illumina測序接頭上。接著，將標簽接頭結扎到剪切的DNA上，然后對單獨標記的鏈，進行PCR擴增和配對末端測序。佳學基因完善了一個非常有用的實驗方案，方案包括高效的DS適配器合成、庫準備和目標豐富，以及數(shù)據(jù)分析工作流的概述。整個測序流程需要需要1-3天的時間。
 

新技術使得基因測序正確度大幅度提高確度

佳學基因根據(jù)長期的大量的基因測序發(fā)現(xiàn)，根據(jù)這項研究，位于超深覆蓋目標捕獲測序數(shù)據(jù)中低等位基因片段的C>A/G>T顛換偏差，是來自于包含提取過程反應污染物的樣品在進行聲剪切時的DNA氧化。佳學基因在樣品制備過程及測序溶劑中加入一種特殊物質，可降低這些氧化偏差，同時開發(fā)一種生物信息處理方法，篩選出氧化引起的測序數(shù)據(jù)誤差。這些結實合技術的使用，大大地提高了基因信息獲取的正確性。
 

臨床應用

佳學基因開發(fā)的雙重測序可以適用于各種測序平臺，含有雙鏈標簽序列的接頭，可以代替標準的測序接頭，而不會明顯改變Illumina測序樣本制備的正常工作流程。這使得新技術可以在幾乎不增加任何成本的情況下快速應用。

賊重要的是，雙重測序可以揭示賦予耐藥性的罕見突變。佳學基因在設計產品時，考慮到，如果我們已經知道，在腫瘤中的某個地方，有一個特定的基因變異，能夠使它們有機會逃脫一種特定藥物，那么我們就可以嘗試另外一種藥物。這可能會對治療產生直接影響。此外，單細胞測序的未來發(fā)展，可能會進一步幫助研究人員確定這些類型的突變。

但是雙重測序能夠應用于許多類型的突變。實際上，但是目前佳學基因主要將其應用于小突變——點突變。