佳學基因MassARRAY SNP基因型技術———正確的基因序列獲取+基因解碼!
佳學基因MassArray分型技術
MassARRAYSNP基因分型技術是由美國Agena Bioscience, Inc.開發(fā)的一種新型DNA序列獲取技術。Agena Bioscience, Inc.原名為Sequenom Bioscience Division,位于美國圣地亞哥,與佳學基因創(chuàng)始人黃家學博士曾經(jīng)工作過的諾華制藥基因組學研究中心毗鄰。2005年至2008年之間正是Sequnenom公司大力發(fā)發(fā)展的公司。黃家學博士和Squenom的科學家保持密切的溝通和探討。并及時將其引入中國,開發(fā)了極具競爭爭力的基因檢測產(chǎn)品。
佳學基因MassArraySNP分型平臺通過PCR擴增跨越SNP位點的DNA序列,然后應用單一延伸引物(extension primer)擴增PCR產(chǎn)物,確保延伸引物只延長一個堿基。延伸產(chǎn)物用飛行質(zhì)譜(TOF, time of flight)進行分析,根據(jù)一個堿基的分子量差別對SNP進行分型,也可做SNP位點等位基因頻率計算。MassARRAY SNP基因型分析可以進行多重SNP分型,即一個反應可同時分型多個SNP位點。該技術分析正確,在分析數(shù)十至上百個SNP時具有價格優(yōu)勢。
佳學基因MassArray技術的先進性
MassARRAY飛行質(zhì)譜檢測系統(tǒng)基本原理為基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜 (MALDI-TOF MS) 技術。將制備好的樣品與芯片基質(zhì)共結晶,將該晶體放入質(zhì)譜儀的真空管,而后用瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發(fā),由于基質(zhì)分子經(jīng)輻射所吸收的能量,導致能量蓄積并迅速產(chǎn)熱,從而使基質(zhì)晶體升華,核酸分子就會解吸附并轉(zhuǎn)變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子,產(chǎn)生的離子多為單電荷離子,這些單電荷離子在加速電場中獲得相同的動能,進而在一非電場漂移區(qū)內(nèi)按照其質(zhì)荷比率加以分離,在真空小管中飛行到達檢測器,飛行時間與離子質(zhì)量成正比。MALDI產(chǎn)生的離子用飛行時間(Time-of-Flight,TOF)檢測器來檢測,離子質(zhì)量越小,飛行時間越短。理論上講,只要飛行管長度足夠,TOF 檢測器可檢測分子的質(zhì)量數(shù)是沒有上限的。
圖1 飛行時間質(zhì)譜檢測物質(zhì)分子量的原理
佳學基因MassArray技術的應用
MassARRAY SNP基因型分析在生物科學、醫(yī)學、農(nóng)業(yè)研究和應用等多個領域具有非常好的應用前景,為全世界的科學家們提供優(yōu)質(zhì)的解決方案,獲得了矚目的進展。以下是一些代表文獻:
技術特點
- 高性價比:在所有的SNP分型方法中,價格低。
- 高正確性:采用先進的飛行質(zhì)譜的分型技術,分析正確。
- 廣泛性:超過2000篇SCI文章,包括Nature, Science等先進雜志。
- 高效性:兩周即可提供完整的實驗報告。
設備儀器
分型方法 | 設備儀器 |
MassARRAY | MassARRAY Genetic Analysis System |
圖2 MassARRAY Genetic Analysis System平臺示意圖
樣品類型
所有類型樣品必須用冰袋寄至公司。冰塊應足量,以確保樣品寄至公司時,冰塊未有效融化。
- a)組織樣品(需提供≥100mg組織。)
- b)體外培養(yǎng)細胞(需提供≥106個細胞。)
- c)基因組DNA (需提供≥5μg 基因組DNA)
- d)全血(需提供≥2mL全血)
價格
SNP分型(或基因突變檢測)的費用根據(jù)需要分型的SNP位點,數(shù)目以及樣品數(shù)量的不同而制定。
提交數(shù)據(jù)
分型結果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飛行質(zhì)譜分析圖:
圖3 MassARRAY-SNP基因分型飛行質(zhì)譜部分分析圖
(責任編輯:佳學基因)