CIViC數(shù)據(jù)平臺(tái)的全稱
CIViC數(shù)據(jù)平臺(tái)的全稱是:Clinical Interpretation of Variants in Cancer。翻譯成中文就是癌癥基因序列變化的臨床解釋。CIViC是一個(gè)由腫瘤基因解碼專家共同搭建的一個(gè)開(kāi)放的網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)。
為什么要建立CIViC網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺(tái)?
正確醫(yī)學(xué)是指根據(jù)每個(gè)個(gè)體及其疾病的獨(dú)特特點(diǎn),來(lái)選擇和設(shè)計(jì)預(yù)防、干預(yù)和治療策略。對(duì)于癌癥來(lái)說(shuō),不同的癌癥患者個(gè)有不同的腫瘤驅(qū)動(dòng)基因,有不同的突變組合,每一個(gè)患者可能因?yàn)榇嬖谔囟ǖ耐蛔?,從而?duì)化 療藥物及靶向藥物存在著不同的的反應(yīng),從面產(chǎn)生不同的治療效果。由于關(guān)于腫瘤的基因解碼研究快速發(fā)展,而基因檢測(cè)結(jié)果的正確與否、以及如何選擇更更多的基因位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)需要依賴對(duì)各種突變序列的解釋。但是由于研究文獻(xiàn)雜亂而分散,而且研究和分析結(jié)果主要存在于各個(gè)機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫(kù)中,從而浪費(fèi)大量的人力、物力,做著重復(fù)性的工作。建立CIViC平臺(tái)的目的,就是集中基因信息解碼生態(tài)圈的資源,共同對(duì)癌癥中的基因序列變化進(jìn)行注釋、討論、和應(yīng)用。并且通過(guò)這個(gè)平臺(tái)傳播基因?qū)Π┌Y的發(fā)生、治療的知識(shí)。推進(jìn)正確醫(yī)學(xué)的發(fā)展。
如何訪問(wèn)CIViC網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺(tái)?
截至到2020年2月:CIViC平臺(tái)的網(wǎng)址是:https://civicdb.org/about。 大家點(diǎn)擊鏈接即可訪問(wèn)這一公開(kāi)網(wǎng)絡(luò)資源。
參與CIViC網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺(tái)的都有哪些牛人?
使用CIViC平臺(tái)的都有哪些機(jī)構(gòu)?
目前使用CIViC數(shù)據(jù)平臺(tái)有有很多全球性的大公司和國(guó)際知名研究機(jī)構(gòu)。
- Agilent's Alissa Clinical Informatics Platform
- Biogazelle
- BioGPS
- Cambridgene
- CancerStop Android Application
- CBioPortal
- CIViCmine
- DAPHNI – A platform for precision medicine of multiple myeloma
- Database of Curated Mutations (DoCM)
- ETH Nexus Personalized Health Technologies - Swiss Variant Interpretation Platform for Oncology
- Euformatics OmnomicsNGS
- Gemini
- Gene Cards
- Genoox
- GoldenHelix - VSClinical
- Google BigQuery
- International Cancer Genome Consortium (ICGC) Data Portal
- LifeMap Sciences TGex NGS Analysis & Interpretation Platform
- Medical Genomics Japan Variant Database (MGeND)
- Microsoft Research - Natural Language Processing
- MolecularMatch
- Monarch Initiative (via Wikidata)
- My Variant Info
- Monarch Iniative SEPIO - Scientific Evidence and Provenance Information Ontology
- NDEx - The Network Data Exchange
- OncoMX
- PathOS - Peter MacCallum Cancer Centre
- PDX Finder
- Smart Cancer Navigator
- SoftGenetics - Geneticist Assistant NGS Interpretative Workbench
- SolveBio
- TCGA Next-Gen Clustered Heat Map Compendium
- The Hyve
- UCSC Genome Browser (My Data -> Track Hubs -> Cancer Genomics Tracks)
- Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC)
- VarSome
- Wikidata