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【佳學(xué)基因檢測(cè)】前額高腭弓高囟門增大人中長(zhǎng)眼距過寬肌張力減退還有癲癇是不是遺傳性DBP缺乏癥?

【佳學(xué)基因檢測(cè)】前額高腭弓高囟門增大人中長(zhǎng)眼距過寬肌張力減退還有癲癇是不是遺傳性DBP缺乏癥?罕見病、遺傳病基因檢測(cè)導(dǎo)讀:佳學(xué)基因檢測(cè)對(duì)超過 100 名 DBP 缺乏患者的臨床和生化記錄進(jìn)分分析,總結(jié)了所有三種生化亞型患者的臨床特征的相似性。幾乎所有患者都在出生后的先進(jìn)個(gè)月內(nèi)出現(xiàn)肌張力減退和癲癇發(fā)作,超過三分之二的患者還表現(xiàn)出 Zellweger 樣面部特征(即前額

佳學(xué)基因檢測(cè)】前額高腭弓高囟門增大人中長(zhǎng)眼距過寬肌張力減退還有癲癇是不是遺傳性DBP缺乏癥?


罕見病、遺傳病基因檢測(cè)導(dǎo)讀:

D-雙功能蛋白 (DBP) 缺乏癥是一種常染色體隱性遺傳的過氧化物酶體脂肪酸氧化障礙?!度梭w生理功能及疾病表現(xiàn)的基因序列根源》指出雙功能是指人體內(nèi)的單一的蛋白質(zhì)如酶包含多個(gè)活性結(jié)構(gòu)域,負(fù)責(zé)過氧化物酶體 β-氧化的連續(xù)步驟。對(duì)于D-雙功能蛋白(DBP)來說,DBP 催化超長(zhǎng)鏈脂肪酸 (VLCFA) C26:0、支鏈脂肪酸(鸚鵡螺酸)和膽汁酸中間體的 β-氧化的第二步(水合)和第三步(脫氫) (二羥基膽甾烷酸 (DHCA) 和三羥基膽甾烷酸 (THCA))。DBP 包含三個(gè)結(jié)構(gòu)域,由 4 型 17-β 羥基類固醇脫氫酶 ( HSD17B4)編碼基因借助體內(nèi)結(jié)構(gòu)與功能蛋白的產(chǎn)生機(jī)制生成這一蛋白質(zhì)。N 端短鏈乙醇脫氫酶結(jié)構(gòu)域由外顯子 1-12 編碼,中心 2-烯酰輔酶 A 水合酶結(jié)構(gòu)域由外顯子 12-21 編碼,C 端固醇載體蛋白 2 樣結(jié)構(gòu)域(SCP-2L ) 由外顯子 21–24 編碼。DBP 是一種具有 79 kD 亞基的同型二聚體酶。進(jìn)入過氧化物酶體后,蛋白質(zhì)被切割,產(chǎn)生一個(gè) 35 kD 的脫氫酶單元和一個(gè) 45 kD 的水合酶加 SCP-2L 單元。

DBP 缺乏癥根據(jù)缺乏的活性分為三種亞型。DBP 缺乏癥 I 型是 2-烯醇-CoA 水合酶和 3-羥?;?CoA 脫氫酶活性的缺乏,DBP 缺乏癥 II 型是單獨(dú)的水合酶活性缺乏,DBP 缺乏癥 III 型是單獨(dú)的脫氫酶活性缺乏。佳學(xué)基因檢測(cè)對(duì)超過 100 名 DBP 缺乏患者的臨床和生化記錄進(jìn)分分析,總結(jié)了所有三種生化亞型患者的臨床特征的相似性。幾乎所有患者都在出生后的先進(jìn)個(gè)月內(nèi)出現(xiàn)肌張力減退和癲癇發(fā)作,超過三分之二的患者還表現(xiàn)出 Zellweger 樣面部特征(即前額高、腭弓高、囟門增大、人中長(zhǎng)、眼距過寬)。大多數(shù)患有 DBP 缺乏的嬰兒 (>80%) 在 2 歲之前死亡,通常死于呼吸系統(tǒng)并發(fā)癥。生化檢測(cè)通常會(huì)發(fā)現(xiàn)血漿 C26:0、DHCA、THCA 以及鸚鵡螺酸及其前體植烷酸水平升高。只有少數(shù) (<2%) 的 DBP 缺陷患者會(huì)顯示正常生化測(cè)試。因此,佳學(xué)基因強(qiáng)調(diào)在臨床上懷疑患者是過氧化物酶體功能紊亂的情況下需要采用培養(yǎng)的皮膚成纖維細(xì)胞進(jìn)行進(jìn)一步基因解碼研究的重要性。

佳學(xué)基因檢測(cè)記錄了兩兄弟經(jīng)過致病基因鑒定基因解碼確診患有 DBP 缺乏癥的臨床案例。雖然這些男孩表現(xiàn)出過氧化物酶體功能障礙的一些典型臨床特征(聽力障礙、小腦和感覺性共濟(jì)失調(diào)),但臨床檢查沒有出現(xiàn)血漿 VLCFA、鸚鵡螺酸和植烷酸或尿膽汁酸的明顯異常?;谕怙@子組測(cè)序的基因檢測(cè)對(duì)于檢測(cè) DBP 水合酶和脫氫酶結(jié)構(gòu)域中的復(fù)合雜合突變至關(guān)重要。針對(duì) DBP 活性的進(jìn)一步成纖維細(xì)胞酶測(cè)試證實(shí)水合酶和脫氫酶活性顯著降低但可檢測(cè)到。據(jù)此,佳學(xué)基因致病基因鑒定基因解碼認(rèn)為患者有一種新型的 DPB 缺陷。學(xué)術(shù)界根據(jù)其獨(dú)特的臨床、生化和遺傳特征將其定義為 IV 型,從而擴(kuò)大了與 DBP 功能改變相關(guān)的臨床表型譜。

患者病情介紹

患者 1

一名 16.5 歲的男孩在 3.5 歲時(shí)被診斷出語言表達(dá)遲緩和發(fā)音困難,這是由中度至重度感音神經(jīng)性聽力障礙引起的。他的語言發(fā)展在助聽器的幫助下有效正?;?。他早期的粗大和精細(xì)運(yùn)動(dòng)發(fā)育正常;他小時(shí)候會(huì)滑冰和打曲棍球。他在普通課堂環(huán)境中的學(xué)業(yè)成績(jī)很好。11 歲時(shí),他患上了隱匿的進(jìn)行性步態(tài)共濟(jì)失調(diào)。他被發(fā)現(xiàn)有雙側(cè)高弓足和輕度槌狀趾足畸形、彌漫性反射消失和屈肌足底反應(yīng)。注意到前間室肌肉非常輕度無力,因此使用了踝足矯形器。小纖維感官測(cè)試在庫存分布中略有下降。振動(dòng)覺和本體感覺保持完好。有明顯的輕度不協(xié)調(diào);快速手指運(yùn)動(dòng)緩慢,腳跟到脛骨測(cè)試受損。Romberg征陰性。神經(jīng)傳導(dǎo)研究(表1) 顯示具有脫髓鞘特征的輕度感覺運(yùn)動(dòng)性多發(fā)性神經(jīng)?。ㄟ\(yùn)動(dòng)傳導(dǎo)速度;20–25 m/sec;正常上肢≥50 m/sec,下肢≥40 m/sec)。感覺和運(yùn)動(dòng)神經(jīng)振幅正常,但腓總神經(jīng) CMAP 振幅較低。隨著時(shí)間的推移,他的高弓足惡化,他的神經(jīng)傳導(dǎo)研究顯示進(jìn)行性脫髓鞘(潛伏期延長(zhǎng)增加)和長(zhǎng)度依賴性軸突喪失(運(yùn)動(dòng)和感覺振幅進(jìn)行性喪失)的證據(jù)。15.5 歲時(shí)的眼底鏡檢查顯示廣泛的周邊視網(wǎng)膜萎縮伴中央黃斑(即嚴(yán)重的視桿細(xì)胞功能障礙伴視錐細(xì)胞相對(duì)保留)與色素性視網(wǎng)膜炎一致(圖 1)。視力正常。視覺誘發(fā)電位正常。暗視桿狀視網(wǎng)膜電圖 (ERG) 顯示輕度異常,表明周邊視網(wǎng)膜的桿狀細(xì)胞功能障礙。明視錐和 30 Hz 閃爍也異常,表明視錐功能障礙。在他 16.5 歲時(shí)的賊后一次臨床隨訪中,他在家中可以進(jìn)行短距離走動(dòng),但由于他嚴(yán)重的共濟(jì)失調(diào),長(zhǎng)距離走動(dòng)需要輪椅。他沒有表現(xiàn)出生長(zhǎng)或青春期延遲的跡象。他的身高在 10-25百分位之間,并且在 16 歲時(shí),他被注意到具有與年齡相適應(yīng)的青春期發(fā)育;Tanner IV 陰毛和 12-15 mL 睪丸體積。他的認(rèn)知、語言和視覺都完好無損。他沒有腎臟或肝臟受累的臨床或生化證據(jù)。
表1:神經(jīng)傳導(dǎo)基因解碼

 

正常

患者 1

患者 2

 

 

就診年齡

 

    12 13 16 13 ½
運(yùn)動(dòng):

 

 

 

 

 

正中神經(jīng)

 

 

 

 

 

 DML(手腕到 APB)

< 4.2

 

3.6

5.4

3.4

 CMAP (毫伏)

≥3.9

 

9.2

4.1

8.6

 CV(米/秒)

> 47

 

27

27

33

尺神經(jīng)

 

 

 

 

 

 DML(毫秒;手腕到 ADM)

< 3.4

2.6

3.1

3.6

2.2

 CMAP (毫伏)

≥5.9

13.1

12.7

4.6

7.7

 CV(米/秒)

> 47

25

27

23

24

脛神經(jīng)

 

 

 

 

 

 DML(毫秒;腳踝到 AH)

< 6.0

5.3

6.2

10.5

4.5

 CMAP (毫伏)

≥3.9

3.3

3.6

0.5

6.6

 CV(米/秒)

> 39

21

22

15

26

腓神經(jīng)

 

 

 

 

 

 DML(毫秒;腳踝到 EDB)

< 6.0

5.0

 

8.5

4.5

 CMAP (毫伏)

≥ 2.4

1.7

 

0.8

2.9

 CV(米/秒)

> 39

22

 

17

43

感官:

 

 

 

 

 

正中神經(jīng)

 

 

 

 

 

 PL(毫秒;手腕到手指-II)

< 3.2

2.5

2.8

3.4

2.1

 SNAP (μV)

≥ 14

67

69

15

36

 CV(米/秒)

 

46

39

40

52

尺神經(jīng)

 

 

 

 

 

 PL(毫秒;手腕到手指-V)

< 3.3

2.0

2.2

3.1

2.2

 SNAP (μV)

≥ 9

43

64

26

44

 CV(米/秒)

 

47

50

35

43

腓腸神經(jīng)

 

 

 

 

 

 PL(毫秒;小腿到拉特購物中心)

< 4.2

3.8

3.0

NR

2.7

 SNAP (μV)

≥ 5

11

17

NR

9.5

 CV(米/秒)   42 40 NR 35
粗體和帶下劃線的值是異常的。所有的感官反應(yīng)都是逆向的。
圖例:DML=遠(yuǎn)端開始運(yùn)動(dòng)潛伏期;CMAP=復(fù)合運(yùn)動(dòng)動(dòng)作電位;CV=傳導(dǎo)速度;PL=峰值起始潛伏期;APB=外展拇短?。籄DM=小指外展肌;AH=拇外展肌;EDB=趾短伸??;NR=無響應(yīng)。
圖1:患者 1 15.5 歲時(shí)的視網(wǎng)膜照片確定為色素性視網(wǎng)膜炎。觀察到廣泛的周邊視網(wǎng)膜萎縮,中央黃斑相對(duì)保留。臨床上這對(duì)應(yīng)于外周視桿細(xì)胞的參與和視錐細(xì)胞的相對(duì)保留。

12 歲時(shí)腦部 MRI 顯示小腦萎縮(圖2). 在幾年的時(shí)間里進(jìn)行了廣泛的基因檢測(cè)和代謝測(cè)試,包括正常PMP22重復(fù)/缺失分析基因檢測(cè)、MPZ、GJB1PMP22c10orf2基因檢測(cè)、脊髓小腦性共濟(jì)失調(diào)組(SCA 1、2、3、6、7、8、17 ), Friedreich 共濟(jì)失調(diào)重復(fù)基因檢測(cè)和血清維生素 E 水平。染色體微陣列基因檢測(cè)正常。肌肉活檢(15 歲時(shí))顯示輕微的神經(jīng)源性變化。肌肉呼吸鏈酶檢測(cè)正常。血漿腎上腺和睪丸性類固醇水平正常。

2腦部 MRI患者 1 在 12 歲時(shí)進(jìn)行了 MRI 檢查。T1W1 矢狀位圖像顯示小腦上葉和中葉有明顯的小腦萎縮。軸位圖像(未顯示)顯示皮質(zhì)下和小腦白質(zhì)正常。MR 波譜正常(未顯示)。16 歲時(shí)的重復(fù) MRI 成像沒有變化(未顯示)。腦部 MRI(患者 2)顯示出相似的模式,但小腦萎縮較輕(未顯示)。

在家族史分析時(shí),患者1的弟弟具有非常相似的特征?;颊叩母改?、姐姐都沒有這種疾病。對(duì)血緣關(guān)系進(jìn)行擴(kuò)展調(diào)查,沒有發(fā)現(xiàn)其他患者。佳學(xué)基因親緣親系檢測(cè)證明,患者父母不是近親,沒有血緣關(guān)系。

病人 2

這位 14 歲的弟弟在 2 歲時(shí)被確診患有中度至重度感音神經(jīng)性聽力損失,需要助聽器。他的早期神經(jīng)發(fā)育正常。他仍然很活躍;賊后隨訪能夠滑冰 3 公里和越野滑雪 1-1.5 小時(shí)。他不需要踝足矯形器或任何其他輔助設(shè)備。他的檢查對(duì)非常輕度的高弓足和反射減退(二頭肌 1+、肱橈肌 1+、三頭肌 2+、髕骨 1+、踝反射 0)、屈肌底反應(yīng)和輕度前間室無力(脛骨前肌 4+/5、腓骨?。┚哂兄匾饬x長(zhǎng)肌 4+,拇長(zhǎng)伸肌 4)。除了腳趾針刺感覺過敏外,感官測(cè)試正常。注意到輕微的腳踝緊繃。協(xié)調(diào)是正常的。神經(jīng)傳導(dǎo)研究(表1) 顯示具有脫髓鞘特征的輕度感覺運(yùn)動(dòng)性多發(fā)性神經(jīng)病。眼底檢查顯示廣泛的周邊視網(wǎng)膜萎縮,中央黃斑不受累。視力和 ERG 正常。他的認(rèn)知完好無損,并且在常規(guī)課堂環(huán)境中取得了良好的學(xué)業(yè)成績(jī)。盡管他的身高一直低于第 5個(gè)百分點(diǎn),但他表現(xiàn)出正常的生長(zhǎng)速度。在將近 14 歲的時(shí)候,他沒有顯示出陰毛初現(xiàn)的跡象,Tanner I 陰毛和 5 mL 睪丸體積。他的實(shí)際年齡為 13 歲 8 個(gè)月,骨齡為 11 歲,符合體質(zhì)性生長(zhǎng)和青春期延遲。他沒有顯示腎臟或肝臟受累的證據(jù)。

致病基因鑒定基因解碼基因檢測(cè)

佳學(xué)基因?qū)尚值艿?DNA 進(jìn)行了外顯子組捕獲和高通量測(cè)序。按照標(biāo)準(zhǔn)程序從血液中提取總基因組 DNA。使用 Agilent SureSelect 50Mb 全外顯子試劑盒進(jìn)行外顯子組靶點(diǎn)富集,測(cè)序 (Illumina HiSeq) 為每個(gè)樣本生成 65 Gbp 的 100 bp 配對(duì)末端讀數(shù)。編碼序列區(qū)域 (CCDS) 的平均覆蓋率,在考慮重復(fù)讀取后,兩個(gè)人分別為 237 倍和 212 倍?;颊?1 中 91.5% 的 CCDS 堿基和患者 2 中 90.0% 的 CCDS 堿基覆蓋率≥20 倍,兩個(gè)人中 96.8% 的 CCDS 堿基覆蓋率≥5 倍。內(nèi)部注釋管道用于調(diào)用和注釋編碼和剪接位點(diǎn)變體。使用 Picard 標(biāo)記并排除重復(fù)讀取。使用 SAMtools pileup和 varFilter調(diào)用單核苷酸變異和短插入和缺失 (indel),并進(jìn)行質(zhì)量過濾以要求至少 20% 的讀數(shù)支持變異調(diào)用。使用 Annovar以及自定義腳本對(duì)基因突變序列進(jìn)行注釋,以選擇編碼和剪接位點(diǎn)變體,并排除 NHLBI 外顯子組服務(wù)器中代表的常見(≥1% 次要等位基因頻率)多態(tài)性,與佳學(xué)基因所記錄的1000個(gè)對(duì)照外顯子組序列進(jìn)行比對(duì)。根據(jù)在兩名受影響患者中發(fā)現(xiàn)的突變序列進(jìn)行優(yōu)先排序。鑒于假定的常染色體隱性遺傳模式,僅考慮具有純合或多個(gè)雜合突變的基因。
突變序列的基因檢測(cè)驗(yàn)證

Sanger 測(cè)序用于驗(yàn)證下一代測(cè)序鑒定的突變,并評(píng)估家族中變異的分離。采集了血液樣本,并從患病的兄弟和未受影響的父母和姐妹身上提取了 DNA。使用引物5'-GAGTGGATAGGTTGAGAATGTCAGTG-3 '和5'-TTTAGACAGACAGCCTTAGTCGGG-3 '進(jìn)行 PCR以測(cè)試 c.101C>T 變體和5'- ACCAATAACCAGCCATGTTTCCT -3 '5' - TCCTACCTTTCCATACCTTTGCAT - 3 '以測(cè)試c.101C>T 變體.1547T>C 變體。

生化分析

成纖維細(xì)胞中的生化測(cè)試如所述進(jìn)行(表2) 。
表 2:患者血漿和成纖維細(xì)胞生化分析
測(cè)試 單位 患者 1 病人 2 參考范圍
等離子體:

 

 

 

 

VLCFA濃度

 

 

 

 

 C26:0 六烷酸

微克/毫升

0.220

0.270

0.23 ± 0.09*

 C26/C22

 

0.021

0.012

0.01 ± 0.004*

 C24/C22

 

0.918

0.967

0.84 ± 0.918*

 植烷酸

微克/毫升

1.260

0.810

< 3.0

 紫杉酸

微克/毫升

0.140

0.060

< 0.3

成纖維細(xì)胞:

 

 

 

 

過氧化氫酶免疫熒光

 

接近正常

普通的

普通的

VLCFA濃度:

 

 

 

 

 C26:0濃度

μmol/g蛋白質(zhì)

0.20

0.20

0.18 - 0.38

 C24:0濃度

μmol/g蛋白質(zhì)

6.52

6.79

7.76 - 17.66

 C22:0濃度

μmol/g蛋白質(zhì)

3.00

3.23

3.84 - 10.20

 比例 C26:0 / C 22:0

 

0.07

0.06

0.03 - 0.07

 比例 C24:0 / C 22:0

 

2.18

2.10

1.55 - 2.30

過氧化物酶體功能:

 

 

 

 

 β-氧化(C16:0)

pmol / (mg 蛋白質(zhì) / 小時(shí))

3876

5061

3330 - 7790

 β-氧化(C26:0)

pmol / (mg 蛋白質(zhì) / 小時(shí))

1290

1325

800 - 2040

 β-氧化(鸚鵡螺酸)

pmol / (mg 蛋白質(zhì) / 小時(shí))

157

248

790 - 1690

 α-氧化(植烷酸)

pmol / (mg 蛋白質(zhì) / 小時(shí))

38

45

28 - 95

D-雙功能蛋白活性:

 

 

 

 

 水合酶

pmol / (mg 蛋白質(zhì) / 分鐘)

43

53

115 - 600

 脫氫酶

pmol / (mg 蛋白質(zhì) / 分鐘)

2個(gè)

3個(gè)

25 - 300

免疫印跡:

 

 

 

 

 舒張壓 79 kDa

 

痕跡

痕跡

當(dāng)下

 舒張壓 45 kDa

 

缺席的

缺席的

當(dāng)下

 舒張壓 35 kDa   ±/− ±/− 當(dāng)下


粗體和下劃線的值是異常的;*表示平均值 +/- 1 個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差。

基因檢測(cè)中的全外顯子測(cè)序的突變位點(diǎn)驗(yàn)證結(jié)果

外顯子組測(cè)序和變體驗(yàn)證

HSD17B4(表3). c.1547T>C 被發(fā)現(xiàn)在一個(gè)覆蓋率非常低的區(qū)域,在患者 2 的 8 個(gè)讀數(shù)中僅出現(xiàn) 2 個(gè)(變異質(zhì)量為 18.4%),因此只有在他兄弟的兩個(gè)變異被注釋后才能通過目視檢查來識(shí)別. Sanger 測(cè)序證實(shí)兩兄弟中存在 c.1547T>C 和 c.101C>T突變。父親和母親各含有中一個(gè)突變的雜合子;c.1547T>C; p.Ile516Thr來自母親c.101C>T;p.Ala34Val來自父親(圖3). SIFT 算法預(yù)測(cè)這兩種突變都是有害的(SIFT 得分分別為 0.03 和 0),并且采用 PolyPhen2預(yù)測(cè)也是破壞性的(HumDiv 得分分別為 0.999 和 0.997)。這兩種突變分別被判斷為致病性的;但是,以前從未見過它們的組合。
表3:過濾外顯子組測(cè)序的基因突變

具有錯(cuò)義、無義、插入缺失或剪接變異的基因 6453
具有罕見突變的基因1

372

兄弟共有突變的基因

109

具有純合子/多個(gè)雜合子突變的基因 2

1如果變異在 1000 個(gè)基因組數(shù)據(jù)庫、NHLBI 外顯子組服務(wù)器中具有 >0.01 的次要等位基因頻率 (MAF),或者在我們中心測(cè)序的 435 個(gè)對(duì)照外顯子組中 >2 個(gè)出現(xiàn),則變異被過濾掉。
2 2個(gè)基因分別為C16orf82FAM83C;這些基因被拒絕作為候選基因,因?yàn)閮蓚€(gè)對(duì)照樣本在 C16orf82 中具有相同的序列變體,而一個(gè)對(duì)照樣本在FAM83C中具有相同的序列變體。然后重新檢查兄弟姐妹共有的至少一個(gè)突變的 109 個(gè)基因,并確定了HSD17B4突變。由于覆蓋率低,第二個(gè)HSD17B4突變賊初并未在患者 2 中發(fā)現(xiàn)(假設(shè)僅存在 2/8 讀數(shù),其變異質(zhì)量為 18.4,低于我們的閾值 20)。
 
3Sanger測(cè)序和分離。A ) DBP 缺乏家系譜系。X=變體;N=正常。( B ) 外顯子組測(cè)序鑒定的HSD17B4變體的Sanger 測(cè)序驗(yàn)證。使用外顯子 2 和 18 側(cè)翼的引物擴(kuò)增基因組 DNA 用于測(cè)序(引物序列見正文)。星號(hào)表示雜合突變。紅色 X = c.101C>T(p. Ala34Val)在 chr5:118792052。藍(lán)色 X = c.1547T>C(p. Ile516Thr)在 chr5:118860954。

生化分析

血漿中 VLCFA 和支鏈脂肪酸(鸚鵡螺酸和植烷酸)的水平正常(表2). 血漿二十二碳六烯酸 (DHA) 水平也正常。使用快原子轟擊電離質(zhì)譜法分析尿液,未發(fā)現(xiàn)尿液膽汁酸分泌異常。遺傳代謝疾病實(shí)驗(yàn)室的成纖維細(xì)胞研究顯示正常的 VLCFA 水平和正常的 C26:0 β-氧化,但鸚鵡螺酸 β-氧化活性降低(表2). 過氧化氫酶免疫熒光研究顯示過氧化物酶體染色在過氧化物酶體的數(shù)量和形態(tài)方面正常至接近正常(表2). 患者 1 中過氧化物酶體的大小略有增加。DBP 酶活性測(cè)量顯示水合酶和脫氫酶活性降低(表2). 免疫印跡上 DBP 蛋白的量減少(表2)。

前額高腭弓高囟門增大人中長(zhǎng)眼距過寬肌張力減退還有癲癇是不是遺傳性DBP缺乏癥的討論

佳學(xué)基因?qū)加邢惹拔创_診的神經(jīng)退行性疾病的兩個(gè)兄弟進(jìn)行外顯子組測(cè)序并進(jìn)行基因解碼基因檢測(cè),檢測(cè)到 HSD17B4 基因中存在復(fù)合雜合突變 c.101C>T (p.Ala34Val) 和 c.1547T>C (p.Ile516Thr),這兩個(gè)突變位點(diǎn)分別影響脫氫酶和水合酶結(jié)構(gòu)域。這兩種錯(cuò)義突變之前都有報(bào)道,但在這兩種情況下,第二個(gè)錯(cuò)義突變都會(huì)影響另一個(gè)等位基因上的相同 DBP 結(jié)構(gòu)域. 先進(jìn)個(gè)案例是 p.Ala34Val 和 p.Phe237Ser 的復(fù)合雜合子;影響脫氫酶結(jié)構(gòu)域的兩個(gè)突變導(dǎo)致 III 型 DBP 和孤立的脫氫酶缺陷。第二種情況是 p.Ile516Thr 和 p.Asn457Tyr 的復(fù)合雜合子;在這種情況下,兩種突變都發(fā)生在水合酶結(jié)構(gòu)域內(nèi),導(dǎo)致 II 型 DBP 和孤立的水合酶缺陷。盡管這名 II 型 DBP 患者存活了 13.5 年以上,但認(rèn)知和語言缺陷很明顯。

對(duì)于在佳學(xué)基因檢測(cè)的患者中觀察到的相對(duì)較輕的臨床表型,一個(gè)明顯的解釋是每個(gè)等位基因上只有一個(gè)結(jié)構(gòu)域受到不太嚴(yán)重的突變的影響。臨床表型顯示毒性降低和生化測(cè)試表明正常的轉(zhuǎn)錄、翻譯和 DBP 酶正常輸入到完整的功能性過氧化物酶體中。后者得到了佳學(xué)基因檢測(cè)患者中觀察到的正常過氧化氫酶免疫熒光的支持,表明正常的過氧化物酶體生物發(fā)生和形態(tài);在患有更嚴(yán)重的 DBP 缺乏癥的患者中未發(fā)現(xiàn)這一情況. 關(guān)于 p.Ala34Val 突變的影響的信息很少,分析表明脫氫酶結(jié)構(gòu)域的殘留酶活性較低。p.Ile516Thr 位于水合酶亞基的二聚化界面,但并未有效消除二聚化,這意味著存在有殘留的活性。殘留水合酶活性(約正常下限的 40%)與免疫印跡上水合酶結(jié)構(gòu)域缺失之間的明顯差異可能部分是由于 L-雙功能蛋白 (L-BP) 負(fù)責(zé)部分測(cè)量的水合酶活性,因?yàn)樗梢詫⒌孜?THC:1-CoA 代謝為 (24 S ,25 S)-24OH-THC-CoA 的異構(gòu)體,不能被 L-BP 的脫氫酶結(jié)構(gòu)域進(jìn)一步代謝。結(jié)果也可以部分地代表突變體 DBP 酶的結(jié)構(gòu)改變和穩(wěn)定性的組合。賊后,兩組同源二聚體(水合酶和脫氫酶結(jié)構(gòu)域)可能彼此具有某種物理和功能關(guān)系。一個(gè)結(jié)構(gòu)域中的突變有可能改變另一個(gè)單元的功能和穩(wěn)定性,即使突變結(jié)構(gòu)域(例如脫氫酶)與相鄰的野生型結(jié)構(gòu)域(例如水合酶)形成二聚體。因此,這種酶的體內(nèi)功能似乎比體外研究預(yù)測(cè)的更復(fù)雜。

盡管由單一酶缺陷引起的其他一些過氧化物酶體疾病可能會(huì)出現(xiàn)在成年期(既酰基輔酶 A 氧化酶 (ACOX) 缺乏癥和甾醇載體蛋白 X (SCPx) 缺乏癥,但尚未報(bào)道 DBP 缺乏癥。由于水合酶和脫氫酶活性均受到影響,佳學(xué)基因檢測(cè)的患者在當(dāng)前的 DBP 缺陷分類下將被視為 I 型。然而,絕大多數(shù) I 型缺陷患者在編碼截短或不穩(wěn)定蛋白質(zhì)的HSD17B4中有突變,導(dǎo)致嚴(yán)重的表型和較差的生存. 據(jù)佳學(xué)基因解碼分析,患者的輕度臨床和生化表型需要進(jìn)行新的分類。因此,佳學(xué)基因致病基因鑒定基因解碼提出了一種新的 DBP 缺陷變體,命名為 DBP IV 型,這是由于復(fù)合雜合突變影響了 DBP 的兩個(gè)不同結(jié)構(gòu)域,但與相對(duì)較溫和的臨床和生化表型相關(guān)。

《神經(jīng)系統(tǒng)疾病的臨床表征與基因序列變化》新提出的 DBP 缺乏亞型(IV 型)也適用于賊近被診斷患有由HSD17B4 內(nèi)的復(fù)合雜合突變引起的 Perrault 綜合征的兩姐妹,一個(gè)影響脫氫酶結(jié)構(gòu)域,一個(gè)影響水合酶結(jié)構(gòu)域,與佳學(xué)基因檢測(cè)的患者相似。在這種情況下,姐妹們相對(duì)較輕的表型表現(xiàn)為感音神經(jīng)性耳聾、輕度智力障礙、感覺運(yùn)動(dòng)性多發(fā)性神經(jīng)病、身材矮小和卵巢發(fā)育不全。外顯子組測(cè)序?qū)τ讷@得該診斷也是必不可少的,但未報(bào)告包括 DBP 酶活性測(cè)量在內(nèi)的完整生化測(cè)試。佳學(xué)基因的患者與這些姐妹的不同之處在于她們正常的智力和青春期發(fā)育(在哥哥身上)。

過氧化物酶體疾病的總發(fā)病率約為每 5,000 個(gè)新生兒中有 1 個(gè),這些病例中的大多數(shù)都很嚴(yán)重,因此很容易確定。與之前報(bào)道的患者形成鮮明對(duì)比的是,這里分享的兩兄弟沒有表現(xiàn)出任何新生兒或嬰兒癥狀,而且他們繼續(xù)表現(xiàn)出正常的認(rèn)知。他們緩慢的 DBP 缺乏臨床過程新穎允許對(duì) DBP 患者進(jìn)行系列電生理診斷性測(cè)試;跨越數(shù)年的臨床檢查和神經(jīng)傳導(dǎo)研究(表 1) 記錄反映小腦和感覺神經(jīng)功能障礙增加的協(xié)調(diào)性逐漸下降。進(jìn)行性感覺運(yùn)動(dòng)性多發(fā)性神經(jīng)病表現(xiàn)出均勻的傳導(dǎo)速度減慢,讓人聯(lián)想到許多遺傳性脫髓鞘性多發(fā)性神經(jīng)病(例如 Charcot-Marie-Tooth1 型)。年長(zhǎng)的兄弟(患者 1)不僅表現(xiàn)出進(jìn)行性脫髓鞘(延遲增加和傳導(dǎo)速度減慢),而且還表現(xiàn)出進(jìn)行性的、長(zhǎng)度依賴性軸突損失的證據(jù)。將現(xiàn)成的外顯子組測(cè)序引入罕見病診所將導(dǎo)致識(shí)別出更多患有 DBP 缺陷較輕變異的患者,并將提高我們對(duì)這種疾病和其他疾病的表型譜和發(fā)病過程的理解。
 
 

(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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