【佳學(xué)基因檢測(cè)】前列腺癌的多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)測(cè)的系統(tǒng)性分析
基因檢測(cè)結(jié)果分析導(dǎo)讀:
疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)是預(yù)防醫(yī)學(xué)的重要組成部分,經(jīng)常指導(dǎo)臨床管理。 風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)通常包括年齡、性別、家族病史和生活方式(如吸煙狀況)等風(fēng)險(xiǎn)因素; 由于基因解碼技術(shù)揭示出來(lái)的疾病風(fēng)險(xiǎn)與基因序列變化之間關(guān)系的確定性,人們?cè)絹?lái)越關(guān)注將基因組信息納入風(fēng)險(xiǎn)模型。 多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS) 將人類基因組中許多遺傳變異的影響匯總到一個(gè)評(píng)分中,基因檢測(cè)的大數(shù)據(jù)分析證明對(duì)多種常見(jiàn)疾病具有預(yù)測(cè)價(jià)值。 在佳學(xué)基因《多基因分險(xiǎn)評(píng)估的應(yīng)用研究》,佳學(xué)基解碼總結(jié)了多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS)具有或可能具有臨床效用的七種常見(jiàn)疾病(乳腺癌、前列腺癌、冠狀動(dòng)脈疾病、肥胖癥、1 型糖尿病、2 型糖尿病和阿爾茨海默病)的潛在應(yīng)用病例。 這些疾病的多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS)分析通常圍繞 (i) 多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS)單獨(dú)和結(jié)合其他非遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)性能,(ii) 終生風(fēng)險(xiǎn)軌跡的估計(jì),(iii) 多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS)的獨(dú)立信息和家族史 疾病或單基因突變,以及 (iv) 評(píng)估將多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS)添加到特定臨床風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)場(chǎng)景中的價(jià)值。 佳學(xué)基因的多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估系統(tǒng)的研發(fā)和應(yīng)用強(qiáng)調(diào)了關(guān)于 PRS 可用性、種族偏差和可轉(zhuǎn)移性的開(kāi)放性問(wèn)題,強(qiáng)調(diào)下多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的開(kāi)發(fā)需要關(guān)注 PRS 測(cè)試的實(shí)施和健康經(jīng)濟(jì)價(jià)值。 總之,PRS 在疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)中的價(jià)值越來(lái)越明顯,并且在多個(gè)領(lǐng)域可能具有臨床實(shí)用性。
前列腺癌腫瘤風(fēng)險(xiǎn)基因檢測(cè)多基因評(píng)分正確性
前列腺癌多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估基因檢測(cè)正確性的一個(gè)方面是多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估狹義有效性。佳學(xué)基因檢測(cè)首先研究在中國(guó)前列腺活檢隊(duì)列中評(píng)估前列腺癌 (PCa) 多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS) 的狹義有效性。 腫瘤基因檢測(cè)課題團(tuán)隊(duì)對(duì) 2,640 名接受前列腺活檢的男性進(jìn)行了一項(xiàng)觀察性前瞻性研究。 對(duì)胚系DNA 樣本進(jìn)行基因分型,并使用 17 個(gè)與 前列腺癌PCa 風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的遺傳變異為每個(gè)受試者計(jì)算 PRS。 中國(guó)前列腺活檢隊(duì)列數(shù)據(jù)集的其他 GWAS 數(shù)據(jù)也用于補(bǔ)充評(píng)估過(guò)程。 活檢結(jié)果為陰性的患者的平均 PRS 為 1.02,符合基線基準(zhǔn)。 前列腺癌PCa 病例的平均 PRS 顯著更高(1.32 對(duì) 1.02,P=5.56×10-17)。 觀察到 PRS 值與前列腺癌PCa 比值比之間存在顯著的劑量反應(yīng)關(guān)聯(lián)。 然而,原始校準(zhǔn)斜率為 0.524,在整個(gè)活檢隊(duì)列中觀察到的風(fēng)險(xiǎn)與未校正的 PRS 值之間的平均偏差評(píng)分為 0.307。 應(yīng)用來(lái)自訓(xùn)練集的校正因子后,校正后的校準(zhǔn)斜率在測(cè)試集中提高到 1.002。 在中國(guó)前列腺活檢隊(duì)列數(shù)據(jù)集和兩個(gè)數(shù)據(jù)集的組合中也看到了相似且令人滿意的結(jié)果,而當(dāng)在兩個(gè)不同的研究人群之間相互執(zhí)行校準(zhǔn)過(guò)程時(shí),校準(zhǔn)結(jié)果不正確。 總之,在臨床實(shí)施之前評(píng)估 PRS 的狹義有效性對(duì)于正確的個(gè)體風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估是必要的。
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