基因檢測在臨床應(yīng)用中的困境與出路

盡管基因信息在疾病的發(fā)生、演變、及治療中的作用各不相同，但是由于基因?qū)θ梭w的控制作用，基因信息在疾病、診斷與治療中應(yīng)用的正確度、可信度將直接影響醫(yī)學(xué)從業(yè)人員的水平。

基因信息在疾病診斷的應(yīng)用以三種產(chǎn)品形式出現(xiàn)：基因測序、基因檢測和基因解碼。

基因測序從本質(zhì)上只是一種獲取基因序列的技術(shù)，其產(chǎn)品與表現(xiàn)形式為PCR檢測、一代測序、二代測序、芯片檢測，產(chǎn)生的結(jié)果為基因分型結(jié)果。項目名稱常常為全基因測序、全外顯子檢測、芯片檢測、醫(yī)學(xué)全外顯子檢測。但是由于基因序列本身并沒有診斷和臨床應(yīng)用價值，以基因測序為本質(zhì)內(nèi)容的檢測常常忽略了測序范圍選擇的合理性與更多性、分型結(jié)果與臨床意義的匹配程度?；驕y序常常用來進行科研服務(wù)。

目前臨床上常常采用基因檢測。基因檢測的特點是根據(jù)臨床的需要或者是醫(yī)生的假設(shè)對患者的特定序列、特定位點的存在情況進行檢測，并將檢測結(jié)果與假設(shè)情形進行驗證，從而幫助臨床診斷與治療。但是基因檢測在邏輯上、設(shè)計上及疾病發(fā)生的客觀實際上都存在著嚴重的缺陷。

首先，位點的選擇不合乎臨床實際：

我們之所以選擇檢測某個位點，是因為在過去的臨床研究、科學(xué)實驗研究中，發(fā)現(xiàn)某一個位點在某個病人身上出現(xiàn)，于是我們?nèi)z測我們面前的這個患者是否具有同樣的突變。首先即使是患同樣疾病的不同患者，進入臨床研究的數(shù)量是極為有限的。其次，并不是每一個測過基因序列、找到過位點的都會進入數(shù)據(jù)庫，其三，也是更為重要的一點是我們的病人是一個獨特的個體，他的基因序列是沿著血緣關(guān)系傳遞下來的，有超過95%的可能是導(dǎo)致這個患者產(chǎn)生疾病的基因突變沒有被研究過、沒有進入數(shù)據(jù)庫。因此，用已經(jīng)報道的基因突序列來檢測我們臨床上的病人十有八九的結(jié)果是陰性結(jié)果。根據(jù)已經(jīng)發(fā)表的序列設(shè)計開展基因檢測從邏輯上和實踐上都有缺陷。

數(shù)據(jù)庫比對的策略存在嚴重缺陷

一般的基因檢測機構(gòu)即使是進行全部基因序列測定，由于在分析變異序列時采用的是數(shù)據(jù)庫比對策略，也不能滿足診斷和治療的要求。

由于納入研究的病人數(shù)量有限，而且全基因測序、全外顯子測序技術(shù)并沒有用在每一個患者的檢測分析上，很多導(dǎo)致一個疾病發(fā)生的突變并沒有被檢測出來，進入數(shù)據(jù)庫的病例也只是少量的病例。而每一個基因都會有數(shù)百萬個突變的可能，這些突變可能絕大多數(shù)沒有被列入目前世界上任何一個數(shù)據(jù)庫里，因此目前采用數(shù)據(jù)庫比對的方法進行基因檢測即使是進行了全基因測序、全外顯子測序也無法對罹患基因病的患者找到病因，產(chǎn)生了大量意義未明的檢測結(jié)果。

佳學(xué)基因采用基因解碼方法進行致病基因鑒定

• 佳學(xué)基因普遍采用全外顯子、全基因測序的方法，完整獲得患者的全部基因序列，不丟掉任何一個突變序列。其他機構(gòu)用選點的方法設(shè)計芯片檢測，采用PANEL的方法檢測特定范圍內(nèi)的基因，都有可能因為疾病表征展示不全、多種疾病表征相互混雜、病人主訴不清、檢測指標不全導(dǎo)致真正的致病基因未被包含在內(nèi)，造成基因信息獲取不全，遺漏真正導(dǎo)致疾病發(fā)生的基因。
• 采用基因解碼方法，而不是數(shù)據(jù)庫比對方法，不僅可以輕松找到數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)記錄的位點，還可以發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫中沒有記錄的新型位點，特別適合對現(xiàn)有病因研究不太清楚、缺乏模型動物的疾病病理分析，可以進行大量原創(chuàng)性研究與發(fā)現(xiàn)。
• 致病基因鑒定基因解碼在神經(jīng)系統(tǒng)疾病比如自閉癥、系統(tǒng)性發(fā)育障礙、神經(jīng)肌肉系統(tǒng)疾病、腎臟功能疾病、心血管疾病、腫瘤病理的分析中具有獨特的優(yōu)勢。在新型藥物靶點的尋找、創(chuàng)新性藥物治療方案方面具有明顯的優(yōu)勢。在解釋常規(guī)藥物治療效果差異方面可提供非常有價值的信息。

基因解碼與基因檢測的區(qū)別：

1. 獲得的基因序列不同：基因解碼普遍采用全基因測序和全外顯子測序，獲得的基因位點數(shù)常常以億為單位；基因檢測常采用PCR、芯片、一代測序，獲取的基因位點數(shù)從一個位點到百萬個位點不同。因此基因檢測的價格常常變化大，無法形成統(tǒng)一的質(zhì)量標準。
2. 分析解讀方法不同：基因解碼采用基因序列變化功能分析法，可以分析受檢者的任意變異序列，基因檢測是采用數(shù)據(jù)庫比對法，只能檢測在數(shù)據(jù)庫中有記錄的、并非來自于醫(yī)生正在診治的患者的突變序列。
3. 基因解碼檢出率更高：基因解碼對遺傳病、基因病的檢出率要比一代測序基因檢測高出數(shù)千倍，比芯片法基因檢測高出數(shù)萬倍，比PCR法高千萬倍到上億倍。
4. 基因解碼正確率更高：基因解碼可以將普通遺傳病患者的致病基因定位到特定的基因坐標上，而基因檢測只能檢查患者是否存在已經(jīng)研究過的發(fā)病原因。
5. 基因解碼可以發(fā)現(xiàn)受檢者的獨特原因，做原創(chuàng)性發(fā)現(xiàn)和研究，而基因檢測只能驗證前人研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)過的結(jié)果。
6. 基因解碼可以根據(jù)發(fā)病原因設(shè)計治療方案，基因檢測不能為患者創(chuàng)新治療方案。
7. 基因解碼結(jié)果可以指導(dǎo)基因矯正，而基因檢測結(jié)果不能用于基因矯正。
8. 基因檢測一般用于疾病風(fēng)險檢測，基因解碼可以用于致病基因鑒定。