【佳學(xué)基因檢測】耳聾和近視基因檢測都出現(xiàn)基因檢測怎么做？

遺傳病基因檢測導(dǎo)讀：

在兒科、眼科及耳鼻喉科會(huì)遇到一種《遺傳病臨床診斷與檢測指南》稱之為耳聾和近視 (DFNMYP) 綜合征的疾病。該病的特征是雙側(cè)先天性或語前耳聾（感音神經(jīng)性聽力損失或聽神經(jīng)病譜系障礙）和高度近視（>-6 屈光度）。 在佳學(xué)基因收集的經(jīng)過基因檢測和分子診斷確診診斷的個(gè)體中，聽力損失是進(jìn)行性的，嚴(yán)重程度從中度到重度不等。 前庭測試正常。 近視是在嬰兒期或幼兒期被診斷出來的。這種病在國際上及醫(yī)學(xué)界又叫做Deafness and Myopia、High Myopia-Sensorineural Deafness Syndrome、Deafness and Myopia Syndrome、DFNMYP、High Myopia-Sensorineural Hearing Loss Syndrome、High Myopia and Sensorineural Deafness、Deafness, Cochlear, Plus、Myopia and Deafness?；驒z測項(xiàng)目名稱會(huì)是耳聾和近視基因分析、高度近視感覺神經(jīng)性耳聾綜合征全基因測序檢測、耳聾和近視綜合征分子診斷、DFNMYP遺傳測試、高度近視感覺神經(jīng)性聽力喪失綜合征致病基因鑒定基因解碼、高度近視與感覺神經(jīng)性耳聾基因查體、耳聾耳蝸Plus高通量測序基因檢測、近視和耳聾分子檢查。
 

DFNMYP的臨床特征

耳聾和近視 (DFNMYP) 綜合征的特征是雙側(cè)先天性或語前耳聾（感音神經(jīng)性聽力損失或聽神經(jīng)病譜系障礙）和高度近視（>-6 屈光度）。在迄今為止報(bào)告的分子確診診斷的個(gè)體中，聽力損失是進(jìn)行性的，嚴(yán)重程度從中度到重度不等。前庭測試正常。近視是在嬰兒期或幼兒期被診斷出來的。

DFNMYP診斷/測試

通過在分子遺傳學(xué)檢測中鑒定SLITRK6中的雙等位基因致病變異，在先證者中進(jìn)行致病基因鑒定基因解碼基因檢測。

DFNMYP的治療

對癥治療：對于聽力損失：使用聽力康復(fù)設(shè)備，包括助聽器和振動(dòng)觸覺助聽器；患有重度至極度感音神經(jīng)性聽力損失和聽神經(jīng)病譜系障礙的個(gè)體可考慮人工耳蝸植入術(shù)；參加適當(dāng)?shù)穆犃φ系K早期干預(yù)和教育計(jì)劃。針對近視：常規(guī)矯正屈光不正。

監(jiān)測：至少每年進(jìn)行一次耳鼻喉科和聽力學(xué)評估；定期進(jìn)行言語和語言評估以監(jiān)測語言發(fā)展；定期進(jìn)行眼科評估以監(jiān)測高度近視的潛在并發(fā)癥；由熟悉遺傳性耳聾形式的臨床遺傳學(xué)家進(jìn)行年度評估。

應(yīng)避免的藥物/環(huán)境：已知的聽力損失環(huán)境因素（例如，大聲噪音）和耳毒性藥物。關(guān)于耳毒性藥物，可以通過用藥指導(dǎo)基因解碼進(jìn)行明確。

親屬及家人的疾病風(fēng)險(xiǎn)的評估：如果已知家族中的SLITRK6致病變異，分子遺傳學(xué)檢測可用于明確風(fēng)險(xiǎn)同胞的遺傳狀態(tài)。如果尚未確定分子診斷，則應(yīng)考慮對有風(fēng)險(xiǎn)的同胞進(jìn)行臨床聽力學(xué)和眼科評估。

遺傳咨詢

DFNMYP 綜合征以常染色體隱性方式遺傳。在受孕時(shí)，患者每個(gè)已出生或嘗未出生的兄弟姐妹都有 25% 的機(jī)會(huì)受累，有 50% 的機(jī)會(huì)成為無癥狀攜帶者，以及 25% 的機(jī)會(huì)不受影響且不是攜帶者。如果在受影響的家庭成員中發(fā)現(xiàn)了SLITRK6致病性變異，則可以對高危親屬進(jìn)行攜帶者檢測，并對高危妊娠進(jìn)行產(chǎn)前檢測。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾綜合征診斷

提示性發(fā)現(xiàn)

具有以下情況的個(gè)體應(yīng)懷疑耳聾和近視 (DFNMYP) 綜合征：

• 中度至重度、雙側(cè)、先天性或語前感音神經(jīng)性聽力損失或聽神經(jīng)病譜系障礙（感音神經(jīng)性聽力損失源于內(nèi)耳或聽神經(jīng)的問題）。聽覺神經(jīng)病譜系障礙的特征是正常的外毛細(xì)胞功能（存在耳聲發(fā)射 [OAE] 和/或耳蝸微音），這表明聽力損失是由異常的內(nèi)毛細(xì)胞、突觸或聽神經(jīng)功能引起的，可以通過聽覺腦干反應(yīng) (ABR) 測試缺失或異常。

• 高度近視（g>-6屈光度）

• 無畸形面部外觀和正常顳骨結(jié)構(gòu)

• 無神經(jīng)、結(jié)締組織或其他眼部表現(xiàn)

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾確定性診斷

沒有為 DFNMYP 綜合征建立正式的臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)。

DFNMYP 的診斷是在具有上述提示性發(fā)現(xiàn)的先證者中確立的；在分子遺傳學(xué)檢測中鑒定出SLITRK6中的雙等位基因致病變異（見表 1）證實(shí)了診斷。

分子遺傳學(xué)檢測方法可包括單基因檢測、使用多基因檢測包和更全面的致病基因鑒定基因解碼基因組檢測：

• 單基因檢測。首先進(jìn)行SLITRK6的序列分析。如果只發(fā)現(xiàn)一個(gè)或沒有發(fā)現(xiàn)致病變異，可以考慮基因靶向缺失/重復(fù)分析。

• 可以考慮包括SLITRK6和其他有可能導(dǎo)致臨床表征的基因組成的基因檢測包。注意：(1) 基因檢測包中包含的基因和用于每個(gè)基因的測試的診斷靈敏度因?qū)嶒?yàn)室而異，并且可能會(huì)隨著時(shí)間而改變。(2) 一些多基因檢測包中可能包括與病癥無關(guān)的基因；因此，臨床醫(yī)生需要確定哪個(gè)多基因組賊有可能以賊合理的成本確定疾病的遺傳原因，同時(shí)限制對不確定意義的變異的識別和無法解釋潛在表型的基因致病變異。(3) 在一些實(shí)驗(yàn)室中，panel 選項(xiàng)可能包括定制實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)的 panel 和/或定制的以表型為重點(diǎn)的外顯子組分析，其中包括臨床醫(yī)生指定的基因。(4) 面板中使用的方法可能包括序列分析、刪除/重復(fù)分析和/或其他基于非測序的測試。

• 可以考慮更全面的基因組測試（如果可用），包括外顯子組測序、線粒體測序和基因組測序。此類測試可能提供或提示先前未考慮的診斷（例如，不同基因或?qū)е骂愃婆R床表現(xiàn)的基因的突變）。致病基因鑒定基因解碼是這一類測試的典型代表。

表1：用于耳聾和近視綜合癥的分子遺傳學(xué)檢測

1.有關(guān)染色體位點(diǎn)和蛋白質(zhì)的信息，請參見表 A. 基因和數(shù)據(jù)庫。

2.有關(guān)在該基因中檢測到的等位基因變異的信息，請參閱分子遺傳學(xué)。

3.序列分析檢測良性、可能良性、意義不確定、可能致病或致病的變異。變異可能包括小的基因內(nèi)缺失/插入和錯(cuò)義、無義和剪接位點(diǎn)變異；通常，不會(huì)檢測到外顯子或全基因缺失/重復(fù)。有關(guān)解釋序列分析結(jié)果時(shí)需要考慮的問題，請單擊此處。

4.基因靶向缺失/重復(fù)分析檢測基因內(nèi)缺失或重復(fù)。使用的方法可能包括定量 PCR、遠(yuǎn)程 PCR、多重連接依賴性探針擴(kuò)增 (MLPA) 和設(shè)計(jì)用于檢測單外顯子缺失或重復(fù)的基因靶向微陣列。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾的臨床特征

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾臨床描述

佳學(xué)基因收集的賊初的耳聾和近視 (DFNMYP) 綜合征的病例 來自土耳其、希臘和阿米什血統(tǒng)三個(gè)家族的九名僅有耳聾和近視的個(gè)體；發(fā)現(xiàn)所有九個(gè)都是SLITRK6致病變異的純合子。

感音神經(jīng)性聽力損失 (SNHL)在所有受影響的個(gè)體中都是雙側(cè)的，一個(gè)是先天性的，8/9 是語言前的。SNHL 是進(jìn)步的，所有人都需要助聽器。聽力損失的嚴(yán)重程度從中度 (2/9) 到重度 (5/9) 到重度 (2/9)。

來自內(nèi)婚阿米什人人群的另外九名受影響個(gè)體的感音神經(jīng)性聽力損失在成年早期從中度發(fā)展為重度]。根據(jù)佳學(xué)基因高度近視感覺神經(jīng)性耳聾病案集，這是一種聽覺神經(jīng)病譜障礙，其特征是中耳肌肉反射 (MEMR) 和耳聲發(fā)射 (OAE) 缺失、耳蝸微音 (CM) 大且延長、聽性腦干反應(yīng) (ABR) 不同步以及進(jìn)行性純音聽力損失。

受影響的人有正常的粗大運(yùn)動(dòng)發(fā)育。沒有人有平衡問題、眩暈或頭暈。來自每個(gè)家庭的一個(gè)受影響的個(gè)體的前庭測試和顳骨 CT 是正常的。

有 7 名可獲得相關(guān)數(shù)據(jù)的人在嬰兒期或幼兒期被診斷出近視。所有七個(gè)人的近視都很嚴(yán)重（范圍：-6 至 -11 屈光度）并且需要矯正鏡片。雖然沒有近視治療或并發(fā)癥的詳細(xì)信息，但在報(bào)告時(shí)沒有在任何報(bào)告的個(gè)體中觀察到高度近視的潛在并發(fā)癥。

DFNMYP 綜合征患者的壽命似乎沒有改變；然而，經(jīng)過分子學(xué)確診的年齡賊大的人只有 30 多歲。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾基因型-表型相關(guān)性

迄今為止，所有報(bào)告的 DFNMYP 綜合征患者都具有純合 無義 SLITRK6變體。臨床表型沒有顯著差異與特定基因型相關(guān)。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾患病率

由于該綜合征的罕見性，尚未確定患病率估計(jì)值。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾遺傳相關(guān)（等位基因）疾病

在沒有任何其他耳聾和近視綜合征發(fā)現(xiàn)的情況下，作為單個(gè)腫瘤發(fā)生的散發(fā)性腫瘤（包括乳頭狀甲狀腺腫瘤）可能在SLITRK6中具有不存在于種系中的體細(xì)胞致病變異。在這些情況下，這些腫瘤的易感性是不可遺傳的 [ Heiliger et al 2012 ]。有關(guān)詳細(xì)信息，請參閱分子遺傳學(xué)、癌癥和良性腫瘤。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾的鑒別診斷

需要特別考慮的耳聾和近視疾病包括：

• 斯蒂克勒綜合征，一種臨床可變的結(jié)締組織疾病，其特征是眼、聽、骨骼和口面部異常。眼部檢查結(jié)果通常包括高度近視伴白內(nèi)障和視網(wǎng)膜脫離。聽力損失是傳導(dǎo)性和感覺神經(jīng)性的。聽力損失的嚴(yán)重程度是可變的，可能是進(jìn)行性的。Stickler 綜合征，由COL2A1、 COL11A1或COL11A2突變引起，以常染色體顯性方式遺傳；由COL9A1、 COL9A2或COL9A3突變引起的 Stickler 綜合征是常染色體隱性遺傳方式。盡管近視和感音神經(jīng)性聽力損失是 DFNMYP 綜合征的一部分，但患有 DFNMYP 綜合征的個(gè)體并不表現(xiàn)出傳統(tǒng)上在 Stickler 綜合征患者中看到的骨骼和顱面表現(xiàn)。

• Donnai-Barrow 綜合征 (DBS)，一種多發(fā)性先天性異常綜合征，其特征為典型的顱面特征、眼部表現(xiàn)、感音神經(jīng)性聽力損失、大腦異常、智力障礙和先天性膈疝和/或臍膨出。高度近視通常伴有視網(wǎng)膜脫離、進(jìn)行性視力喪失和虹膜缺損。聽力損失可能是進(jìn)行性的且嚴(yán)重程度不同。顱面部的一系列表現(xiàn)通常包括明顯的眼距過寬、大的前囟門、寬的中間縫、前發(fā)際的寡婦峰、凹陷的鼻梁、短鼻子和后旋耳。DBS可由LRP2突變引起，呈常染色體隱性遺傳方式。與 DFNMYP 綜合征患者相比，DBS 患者除了近視和聽力損失外，還有多種先天性異常以及顱面和神經(jīng)系統(tǒng)異常。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾的治療

初步診斷后的評估

為了確定被診斷患有耳聾和近視 (DFNMYP) 綜合征的個(gè)體的疾病程度和需求，建議進(jìn)行以下評估（如果尚未完成）：

• 感音神經(jīng)性聽力損失和聽神經(jīng)病譜系障礙的聽力學(xué)評估

• 近視和其他眼部合并癥的眼科評估

• 通過早期干預(yù)/教育計(jì)劃對聽力受損者進(jìn)行評估，包括兒童基線言語和語言評估

• 咨詢臨床遺傳學(xué)家和/或遺傳咨詢師

針對癥狀的治療

適當(dāng)?shù)闹委煱ㄒ韵聝?nèi)容：

• 根據(jù)需要實(shí)施聽力康復(fù)設(shè)備，包括助聽器和振動(dòng)觸覺聽力工具

• 考慮對重度至重度感音神經(jīng)性聽力損失和聽神經(jīng)病譜系障礙患者進(jìn)行人工耳蝸植入 (CI)。雖然在耳聾和近視綜合征患者中沒有 CI 的報(bào)道，但在聽神經(jīng)病譜系障礙兒童中有 CI 的良好結(jié)果報(bào)道 [ Breneman et al 2012 ]。

• 參加針對聽障人士的早期干預(yù)計(jì)劃和教育計(jì)劃，以賊大限度地提高長期言語和語言成果

• 屈光不正的常規(guī)矯正

日常監(jiān)測

以下是合適的：

• 至少每年進(jìn)行一次耳鼻喉科和聽力學(xué)評估

• 定期言語和語言評估以監(jiān)測語言發(fā)展

• 定期眼科評估以監(jiān)測高度近視的潛在并發(fā)癥，包括白內(nèi)障、青光眼和視網(wǎng)膜脫離

• 由熟悉遺傳性耳聾形式的臨床遺傳學(xué)家進(jìn)行年度評估

要避免情況

有聽力損失的人應(yīng)避免以下情況：

• 聽力損失的已知環(huán)境因素（例如，嘈雜的噪音）

• 耳毒性藥物

風(fēng)險(xiǎn)親屬的評估

評估先證者的年長和年幼的同胞是合適的，以便盡早確定哪些人會(huì)受益于及時(shí)治療聽力損失和近視。評估可以包括：

• 如果已知家族中的SLITRK6致病性變異， 則進(jìn)行分子遺傳學(xué)檢測；

• 如果尚未建立分子診斷，則進(jìn)行臨床聽力學(xué)和眼科評估。

有關(guān)為遺傳咨詢目的對高危親屬進(jìn)行檢測的相關(guān)問題，請參閱遺傳咨詢。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾遺傳咨詢

遺傳咨詢是向個(gè)人和家庭提供有關(guān)遺傳疾病的性質(zhì)、模式和影響的信息的過程，以幫助他們做出明智的醫(yī)療和個(gè)人決定。下一節(jié)涉及遺傳風(fēng)險(xiǎn)評估以及使用家族史和基因檢測來闡明家庭成員的遺傳狀況；它無意解決所有可能出現(xiàn)的個(gè)人、文化或倫理問題，也無意替代遺傳學(xué)專業(yè)人士的咨詢。-ED。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾遺傳方式

耳聾和近視 (DFNMYP) 綜合征以常染色體隱性方式遺傳。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾家庭成員的風(fēng)險(xiǎn)情況

先證者的父母

• 受影響兒童的父母是專性雜合子（即，一種SLITRK6 致病性變異的攜帶者）。

• 盡管在一些攜帶者父母 中報(bào)告了早期和成年發(fā)病的低度近視（<-3 屈光度） ，但 SLITRK6雜合子沒有發(fā)生聽力損失或 DFNMYP 綜合征的高度近視特征的風(fēng)險(xiǎn)。

先證者的同胞

• 在受孕時(shí)，受累個(gè)體的每個(gè)同胞都有 25% 的機(jī)會(huì)受累，有 50% 的機(jī)會(huì)成為無癥狀攜帶者，以及 25% 的機(jī)會(huì)不受影響且不是攜帶者。

• 雜合子（攜帶者）通常沒有癥狀，也沒有發(fā)生疾病的風(fēng)險(xiǎn)。

先證者的后代。DFNMYP 綜合征患者的后代是 SLITRK6 致病性變異的專性雜合子（攜帶者）。

其他家庭成員。先證者父母的每個(gè)同胞都有50% 的風(fēng)險(xiǎn)成為SLITRK6致病性變異的攜帶者。

高度近視感覺神經(jīng)性耳聾攜帶者檢測

對高危親屬進(jìn)行攜帶者檢測需要事先鑒定家族中的SLITRK6致病變異。

相關(guān)遺傳咨詢問題

有關(guān)為早期診斷和治療目的評估高危親屬的信息，請參閱管理、高危親屬評估。

生育計(jì)劃

• 確定遺傳風(fēng)險(xiǎn)、闡明攜帶者狀態(tài)以及討論產(chǎn)前/植入前基因檢測可用性的賊佳時(shí)間是在懷孕前。

• 向受影響的、攜帶者或有成為攜帶者風(fēng)險(xiǎn)的年輕人 提供遺傳咨詢（包括討論對后代的潛在風(fēng)險(xiǎn)和生殖選擇）是適當(dāng)?shù)摹?/p>

DNA庫是 DNA（通常從白細(xì)胞中提?。┑拇鎯?chǔ)，以備將來使用。由于檢測方法以及我們對基因、等位基因變異和疾病的理解在未來可能會(huì)得到改善，因此應(yīng)考慮對受影響個(gè)體的 DNA 進(jìn)行儲(chǔ)存。

產(chǎn)前檢測和植入前基因檢測

一旦在受影響的家庭成員中發(fā)現(xiàn)了SLITRK6致病變異，就可以對風(fēng)險(xiǎn)增加的妊娠進(jìn)行產(chǎn)前檢測和植入前基因檢測。

醫(yī)療專業(yè)人員和家庭內(nèi)部對使用產(chǎn)前檢查的看法可能存在差異。雖然大多數(shù)中心將使用產(chǎn)前檢測視為個(gè)人決定，但討論這些問題可能會(huì)有所幫助。

分子遺傳學(xué)

表A:耳聾和近視綜合癥：基因和數(shù)據(jù)庫

數(shù)據(jù)是從以下標(biāo)準(zhǔn)參考文獻(xiàn)中匯編的：來自HGNC的基因；來自O(shè)MIM的染色體位點(diǎn)；來自UniProt的蛋白質(zhì)。有關(guān)提供鏈接的數(shù)據(jù)庫（基因座特定、HGMD、ClinVar）的描述，請單擊此處。

表 B:耳聾和近視綜合癥的 OMIM 條目（在 OMIM 中查看全部）

基因結(jié)構(gòu)。 SLITRK6包含兩個(gè)外顯子；外顯子1 是非編碼的。全長轉(zhuǎn)錄本跨越 6.6 kb (6,562 bp) 的基因組DNA。cDNA NM_032229.2包含 4199 bp ，編碼 841 個(gè)氨基酸。有關(guān)基因和蛋白質(zhì)信息的詳細(xì)摘要，請參見表 A，基因。

致病變異。在 DFNMYP 綜合征中描述了三種SLITRK6致病變異，都是無意義的。在阿米什人中不止一次觀察到 c.1240C>T 變體。

表 2：SLITRK6致病變異

正?；虍a(chǎn)物。SLITRK基因家族編碼六種神經(jīng)元跨膜蛋白——主要存在于神經(jīng)組織中——調(diào)節(jié)神經(jīng)突生長和突觸發(fā)育。

SLITRK6有一個(gè)細(xì)胞外 N 末端結(jié)構(gòu)域，其中包含兩個(gè)與 SLIT 結(jié)構(gòu)域高度同源的富含亮氨酸的結(jié)構(gòu)域；它還具有一個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域和一個(gè)細(xì)胞內(nèi) C 末端，帶有兩個(gè)與 NTRK-神經(jīng)營養(yǎng)蛋白家族的受體位點(diǎn)同源的保守酪氨酸磷酸化位點(diǎn)。SLITRK6在內(nèi)耳中的表達(dá)促進(jìn)感覺神經(jīng)元的神經(jīng)支配和存活。

與在發(fā)育中的小鼠大腦中廣泛表達(dá)的SLITRK家族的其他成員不同， SLITRK6在胚胎和出生后生命期間在聽覺系統(tǒng)中差異表達(dá)；在內(nèi)耳中表達(dá)賊強(qiáng)，而在丘腦和外側(cè)膝狀體核中表達(dá)適度。

異?；虍a(chǎn)物。報(bào)道的致病性變異（損害 SLITRK6 的細(xì)胞表面表達(dá)和突觸誘導(dǎo)活性）不會(huì)觸發(fā)無意義介導(dǎo)的mRNA衰變，產(chǎn)生截短的產(chǎn)物，并且預(yù)計(jì)會(huì)導(dǎo)致功能喪失。然而，不能排除由于細(xì)胞內(nèi) C 末端結(jié)構(gòu)域丟失而誤導(dǎo)至細(xì)胞內(nèi)空間的毒性功能獲得機(jī)制的可能性。

癌癥和良性腫瘤

使用芯片 CGH分析人類乳頭狀甲狀腺癌 (PTC) 的拷貝數(shù)變化。與正常組織相比，在 16% 的 PTC 樣本中檢測到SLITRK6缺失。在甲狀腺腫瘤轉(zhuǎn)基因小鼠模型的 PTC 樣本中未檢測到缺失。