【佳學(xué)基因檢測(cè)】基因檢測(cè)如何改善三陰性乳腺癌的治療方案
乳腺癌不同亞型的基因檢測(cè)導(dǎo)讀:
《乳腺癌不同亞型的基因檢測(cè)對(duì)治療的幫助作用》總結(jié)了現(xiàn)有的治療方案、治療藥物及其在治療三陰性乳腺癌患者中的療效,并討論了一些新的臨床前研究和靶向治療方案,旨在為三陰性乳腺癌治療方案和靶點(diǎn)提供新的思路和方向。
基因檢測(cè)明確三陰型乳腺癌后的治療方案:
《乳腺癌基于基因檢測(cè)結(jié)果的個(gè)性化治療》通過(guò)對(duì)對(duì)587例三陰性乳腺癌患者的腫瘤樣本進(jìn)行了基因表達(dá)譜分析,并將三陰性乳腺癌分為六個(gè)亞型:基底樣1型(BL1)、基底樣2型(BL2)、間充質(zhì)型(M)、間充質(zhì)干細(xì)胞樣(MSL)、免疫調(diào)節(jié)(IM)和管腔雄激素受體(LAR)。致病基因鑒定基因解碼研究人員還進(jìn)行了基因分析,比較了現(xiàn)有的三陰性乳腺癌乳腺癌細(xì)胞系,將三陰性乳腺癌細(xì)胞分為六種不同的亞型,從而為三陰性乳腺癌的臨床治療提供了一個(gè)正確的細(xì)胞模型。
三陰型乳腺癌的基因檢測(cè)分型及其個(gè)性化治療方案
TNBC亞型 | 遺傳異常 | 細(xì)胞系 | 亞型相關(guān)性(p值) | 組織學(xué) | 基因檢測(cè)結(jié)果 |
基底樣1型 | 細(xì)胞周期基因表達(dá) | HCC2157 | 0.66 (0.00) | DC | BRCA1; STAT4; UTX |
DNA修復(fù)基因(ATR-BRCA途徑) | HCC1599 | 0.62 (0.00) | DC | BRCA2; TP53; CTNND1; TOP2B; CAMK1G | |
增殖基因 | HCC1937 | 0.28 (0.00) | DC | BRCA1; TP53; MAPK13; MDC1 | |
HCC1143 | 0.26 (0.00) | IDC | TP53 | ||
HCC3153 | 0.24 (0.00) | DC | BRCA1 | ||
MDA-MB-468 | 0.19 (0.06) | DC | PTEN; RB1; SMAD4; TP53 | ||
HCC38 | 0.19 (0.01) | CDKN2A; TP53 | |||
基底樣2型 | 生長(zhǎng)因子信號(hào)通路(EGFR、MET、NGF、Wnt/β-連環(huán)蛋白、IGF-1R) | SUM149PT | 0.30 (0.00) | INF | BRCA1 |
糖酵解,糖異生 | CAL-851 | 0.25 (0.00) | IGA | RB1; TP53 | |
肌上皮標(biāo)志物的表達(dá) | HCC70 | 0.24 (0.04) | DC | PTEN; TP53 | |
HCC1806 | 0.22 (0.00) | ASCC | CDKN2A; TP53; UTX | ||
HDQ-P1 | 0.18 (0.17) | IDC | TP53 | ||
免疫調(diào)節(jié)型 | 髓質(zhì)BC(預(yù)后良好的罕見(jiàn)TNBC)的免疫細(xì)胞過(guò)程(CTLA4、IL2、IL7途徑、抗原處理/呈遞)基因特征 | HCC1187 | 0.22 (0.00) | DC | TP53; CTNNA1; DDX18; HUWE1; NFKBIA |
DU4475 | 0.17 (0.00) | DC | APC; BRAF; MAP 2 K4; RB1 | ||
間充質(zhì)型 | 細(xì)胞運(yùn)動(dòng) | BT-549 | 0.21 (0.00) | IDC | PTEN; RB1; TP53 |
細(xì)胞分化 | CAL-51 | 0.17 (0.00) | AC | PIK3CA | |
生長(zhǎng)因子信號(hào)傳導(dǎo) | CAL-120 | 0.09 (0.00) | AC | TP53 | |
急診室 | |||||
間充質(zhì)干細(xì)胞型 | 類(lèi)似于M+ | HS578T | 0.29 (0.00) | CS | CDKN2A; HRAS; TP53 |
低增殖 | MDA-MB-157 | 0.25 (0.00) | MBC | NF1; TP53 | |
血管生成基因 | SUM159PT | 0.14 (0.00) | ANC | PIK3CA; TP53 HRAS | |
MDA-MB-436 | 0.13 (0.00) | IDC | BRCA1; TP53 | ||
MDA-MB-231 | 0.12 (0.00) | IDC | BRAF; CDKN2A; KRAS; NF2; TP53; PDGFRA | ||
管腔雄激素受體 | 雄激素受體基因 | MDA-MB-453 | 0.53 (0.00) | AC | PIK3CA; CDH1; PTEN |
管腔基因表達(dá)模式 | SUM185PE | 0.39 (0.00) | DC | PIK3CA | |
分子頂分泌亞型 | HCC2185 | 0.34 (0.00) | AC | PIK3CA | |
CAL-148 | 0.32(0.00) | AC | PIK3CA; RB1; TP53; PTEN | ||
MFM-223 | 0.31 (0.00) | PIK3CA; TP53 |
《腫瘤850基因檢測(cè)》的大數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示三陰性乳腺癌腫瘤樣本的基因表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn)基底樣1型,即BL1亞型中細(xì)胞周期調(diào)節(jié)和DNA修復(fù)相關(guān)基因的異常表達(dá),這些基因包括MYC、PIK3CA、CDK6、AKT2、KRAS、FGFR1、IGF1R、CCNE1和CDKN2A/B的高擴(kuò)增,以及BRCA2、PTEN、MDM2、RB1和TP53等DNA修復(fù)相關(guān)基因的高雜合或純合缺失)。三陰性乳腺癌中的基底樣1型可能的治療藥物包括聚ADP核糖聚合酶(PARP)抑制劑和基因毒性藥物。三陰性乳腺癌中的基底樣1型。三陰性乳腺癌中的基底樣2型(BL2亞型)具有信號(hào)通路的異常激活,如EGFR、MET、NGF、Wnt/β-連環(huán)蛋白和IGF-1R通路,潛在的靶向治療藥物包括mTOR抑制劑和生長(zhǎng)因子抑制劑(拉帕替尼、吉非替尼和西妥昔單抗)。
三陰性乳腺癌中的間充質(zhì)型(M亞型)具有高度激活的細(xì)胞遷移相關(guān)信號(hào)通路(由肌動(dòng)蛋白調(diào)節(jié))、細(xì)胞外基質(zhì)-受體相互作用通路和分化通路(Wnt通路、間變性淋巴瘤激酶通路、轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子(TGF)-β信號(hào)),因此也被稱(chēng)為化生性乳腺癌。三陰性乳腺癌中的間充質(zhì)型(M亞型)具有肉瘤樣或鱗狀上皮細(xì)胞樣組織特征,易對(duì)化療藥物產(chǎn)生耐藥性。因此,三陰性乳腺癌中的間充質(zhì)型患者者可以使用mTOR抑制劑或靶向上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化的藥物治療。
與M亞型相比,三陰性乳腺癌中的間充質(zhì)干細(xì)胞亞型表達(dá)低水平的細(xì)胞增殖相關(guān)基因和高水平的干細(xì)胞相關(guān)基因,這些基因包括ABCA8、PRORC、ENG、ALDHA1、PER1、ABCB1、TERT2IP、BCL2、BMP2和THY、HOX基因(HOXA5、HOXA10、MES1、MES2、MEOX1、MEOX2和MSX1)和間充質(zhì)干細(xì)胞特異性標(biāo)記物(BMP2、ENG、ITGAV、KDR、NGFR、NT5E、PDGFR、THY1和VCAM1)。三陰性乳腺癌中的間充質(zhì)干細(xì)胞亞型的基因解碼暗示患者可能接受PI3K抑制劑、Src拮抗劑或抗血管生成藥物治療。基因解碼研究還表表明,一種Abl/Src抑制劑達(dá)沙替尼可用于治療M型和MSL型乳腺癌患者。
IM亞型顯著豐富了免疫細(xì)胞相關(guān)基因和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,如Th1/Th2途徑、NK細(xì)胞途徑、B細(xì)胞受體信號(hào)途徑、樹(shù)突狀細(xì)胞(DC)途徑、T細(xì)胞受體信號(hào)途徑、白細(xì)胞介素(IL)-12途徑和IL-7途徑。具有基因解碼能力的臨床大夫考慮,IM亞型與乳腺髓樣癌高度相似。建議使用PD1、PDL1、CTLA-4和其他免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療IM亞型乳腺癌患者。
LAR亞型的基因表達(dá)譜與其他TNBC亞型顯著不同。盡管LAR亞型不表達(dá)ER受體,但它確實(shí)具有高度激活的激素相關(guān)信號(hào)通路(包括類(lèi)固醇合成、卟啉代謝和雄激素/雌激素代謝)。值得注意的是,雄激素受體(AR)在LAR亞型乳腺癌中高度表達(dá),其mRNA水平是其他TNBC亞型的9倍。免疫組織化學(xué)還檢測(cè)AR的高表達(dá),以及大量AR下游代謝標(biāo)記物及其輔助激活劑(DHCR24、ALCAM、FASN、FKBP5、APOD、PIP、SPDEF和CLDN8)在LAR亞型中的表達(dá)。以腫瘤的發(fā)生與惡變機(jī)理做為分析基礎(chǔ)的基因解碼建議LAR亞型乳腺癌患者進(jìn)行抗AR治療。
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