【佳學(xué)基因檢測】癲癇基因檢測測對測全了,對照這個表逐個檢查!
癲癇基因檢測如果要想增加找到致病基因突變的機率并根據(jù)突變匹配創(chuàng)新藥物,為什么一定要測序全部基因,并通過基因解碼方法而不僅僅是數(shù)據(jù)庫比對方法來分析突變?
癲癇是一種復(fù)雜的神經(jīng)系統(tǒng)疾病,其發(fā)病機制涉及多種基因和環(huán)境因素的相互作用。為了增加找到致病基因突變的機率,并根據(jù)突變匹配創(chuàng)新藥物,需要采用全基因組測序并結(jié)合基因解碼分析方法,而不僅僅依賴于數(shù)據(jù)庫比對方法。以下是幾個主要原因:
1. 捕獲潛在新的致病基因和突變
僅依賴數(shù)據(jù)庫比對方法,只能檢測到已知的與癲癇相關(guān)的基因和突變。但事實上,癲癇的發(fā)病機制仍有許多未知的方面,存在著大量潛在的新致病基因和突變有待發(fā)現(xiàn)。全基因組測序可以不受限制地檢測全部編碼區(qū)和非編碼區(qū)的變異,從而有機會發(fā)現(xiàn)癲癇的新的致病基因位點和突變類型。
2. 捕獲結(jié)構(gòu)變異和復(fù)雜突變
數(shù)據(jù)庫比對方法主要側(cè)重于檢測單個堿基的變異,但對于結(jié)構(gòu)變異(如基因缺失、插入、重復(fù)、倒位等)和復(fù)雜突變(如多個堿基連續(xù)變異)的檢測能力有限。而全基因組測序配合基因解碼分析可以高效、正確地檢測到這些復(fù)雜的變異形式,這對于全面揭示癲癇的分子遺傳學(xué)機制至關(guān)重要。
3. 發(fā)現(xiàn)潛在致病機制
基因解碼分析不僅可以正確定位突變位置,還可以預(yù)測突變對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能的影響,以及對信號通路、代謝網(wǎng)絡(luò)等的潛在影響。通過這種方式,有望發(fā)現(xiàn)癲癇發(fā)生的新的分子機制,為開發(fā)創(chuàng)新靶向藥物奠定基礎(chǔ)。
4. 個體化正確治療
不同個體的癲癇可能源于不同的基因突變,對應(yīng)的賊佳治療方案也會不同。全基因組測序結(jié)合基因解碼分析,可以為每個患者正確識別出致病基因突變,從而為制定個體化的靶向治療方案提供依據(jù),實現(xiàn)真正的正確醫(yī)療。
5. 促進藥物研發(fā)
對于已知的致病基因突變,可以通過基因解碼預(yù)測其對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的影響,從而設(shè)計出能夠矯正這些異常的小分子藥物。同時,對于新發(fā)現(xiàn)的致病基因和新機制,也為開發(fā)創(chuàng)新靶向藥物提供了新的途徑。
總的來說,全基因組測序結(jié)合基因解碼分析不僅有助于發(fā)現(xiàn)癲癇的新致病位點和新機制,還可以促進正確醫(yī)學(xué)在癲癇診療領(lǐng)域的應(yīng)用,為每一位患者匹配賊佳的靶向治療方案,從而提高癲癇的治療效果。因此,這種全面、深入的基因檢測分析方法,是提高致病基因檢出率、促進創(chuàng)新藥物開發(fā)的關(guān)鍵所在。
以發(fā)育性癲癇性腦病說明癲癇基因檢測必須包括的基因
發(fā)育性和癲癇性腦?。―EE)所涉及的基因可以歸為多個功能類別,涵蓋了離子/遞質(zhì)/小分子轉(zhuǎn)運、突觸功能調(diào)節(jié)、細胞生長、分裂和增殖、細胞代謝、細胞內(nèi)運輸和信號傳導(dǎo)、以及基因轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)生物合成/降解等。這些信息可在《神經(jīng)系統(tǒng)疾病及其對應(yīng)的基因、基因突變位點列》。
《神經(jīng)系統(tǒng)疾病的致病基因查找》特別關(guān)注那些已在體內(nèi)和體外模型中廣泛研究其對神經(jīng)元興奮性和癲癇發(fā)生影響的基因產(chǎn)物。這些研究提供了更具針對性的治療目標(biāo),以恢復(fù)功能紊亂的網(wǎng)絡(luò),并且這些功能可以通過生理測試進行評估。此外,《神經(jīng)系統(tǒng)疾病的致病基因查找》也簡要討論了其他發(fā)育性和癲癇性腦病(DEE)相關(guān)基因,特別是那些與遷移障礙相關(guān)的基因,盡管它們的作用機制更為復(fù)雜,涉及多個細胞過程,在設(shè)計安全有效的治療方法之前需要更深入的了解。
神經(jīng)元回路主要由谷氨酸能興奮性神經(jīng)元和抑制性GABA能神經(jīng)元形成。在皮質(zhì)回路中,谷氨酸能神經(jīng)元負責(zé)計算任務(wù),而GABA能神經(jīng)元則控制和組織網(wǎng)絡(luò)的活動,并且對于活動節(jié)律的產(chǎn)生至關(guān)重要,而活動節(jié)律是大腦節(jié)律的基礎(chǔ)。膠質(zhì)細胞在維持神經(jīng)元穩(wěn)態(tài)和保護方面起著重要作用,同時也與突觸功能密切相關(guān)。在神經(jīng)元中,體細胞樹突區(qū)域接收大部分突觸輸入,并將這些輸入集成到生成動作電位的軸突初始段中。動作電位的傳播到突觸前末梢會引發(fā)神經(jīng)遞質(zhì)的釋放。反向傳播的動作電位到達體細胞樹突區(qū)域,涉及到樹突計算和突觸輸入的調(diào)節(jié)。離子通道對于神經(jīng)元亞區(qū)域和神經(jīng)信號傳導(dǎo)至關(guān)重要。因此,與許多發(fā)育性和癲癇性腦?。―EE)相關(guān)的通道病并不奇怪。
基因解碼過程中,使用各種實驗系統(tǒng)對突變進行功能分析對于揭示詳細的病理機制和闡明基因型-表型相關(guān)性至關(guān)重要,這反過來又可以促進診斷、遺傳咨詢、管理和治療方法的開發(fā)。使用電生理學(xué)技術(shù)的功能分析甚至可以識別離子通道特性的細微變化。實驗方法包括體外和體內(nèi)系統(tǒng)。
體外實驗系統(tǒng)通常采用不表達目標(biāo)蛋白的內(nèi)源性細胞,以簡化對其功能的分析。這些系統(tǒng)通常使用人類細胞系(例如,轉(zhuǎn)染的人類胚胎腎細胞)或者相對較少見的非洲爪蟾卵母細胞注射目標(biāo)cRNA,后者可實現(xiàn)大量表達,盡管人類細胞系背景通常更受青睞。另一種體外系統(tǒng)是轉(zhuǎn)染/轉(zhuǎn)導(dǎo)神經(jīng)元的原代培養(yǎng)物,它提供了真實的神經(jīng)元細胞背景,可用于評估對神經(jīng)元和網(wǎng)絡(luò)特性的影響。體內(nèi)/離體系統(tǒng)則使用生物體或者從中獲得的制劑(例如腦切片),其復(fù)雜性和實際的病理生理條件更接近大腦回路,并提供了體內(nèi)表型的信息。用于生成遺傳變異模型的動物主要是小鼠和大鼠,因為早期的定點誘變技術(shù)可以利用胚胎干細胞中的同源重組來輕松進行基因操作。盡管近年來基因組編輯方法(例如CRISPR-Cas9)可以用于生成其他哺乳動物的突變體模型,但小鼠仍然是先進的遺傳變異模型生物體。高通量研究通常不適用于哺乳動物模型,無論是用于研究變異的功能效應(yīng)還是藥物篩選。相比之下,更簡單的動物模型,特別是斑馬魚,可以進行相對較大規(guī)模的篩選。然而,從這些簡化系統(tǒng)中獲得的發(fā)現(xiàn)需要在哺乳動物模型中進行驗證。誘導(dǎo)多能干細胞(iPSC)分化成的神經(jīng)元越來越多地用于研究人類神經(jīng)元突變,因為它們具有患者的遺傳背景。它們可用于研究單細胞水平的神經(jīng)元特性,或者可以誘導(dǎo)產(chǎn)生類似于大腦的體外微型器官(腦類器官),這代表了研究大腦發(fā)育的出色綜合實驗系統(tǒng)。然而,正如在SCN1A突變研究中觀察到的那樣,這些神經(jīng)元特性的巨大變異性使得研究變得困難,并且可重復(fù)性仍然是一個問題。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)