【佳學(xué)基因檢測】遺傳性眼病基因檢測
遺傳性眼病是由于人體內(nèi)的基因物質(zhì)發(fā)生改變導(dǎo)致的眼部疾病，基因物質(zhì)改變引起的眼科疾病容易在二胎和后代中再次出現(xiàn)。由于部分眼病不易在早期發(fā)現(xiàn)，是影響眼眼的重要疾病，不僅影響生活，部分也會影響智力的發(fā)育，產(chǎn)生連帶效應(yīng)。我國發(fā)病率高、人數(shù)多，僅單基因眼病患者就占總?cè)丝诘?%。
遺傳性眼病有 600 余種，而且由于診斷正確性、及時性和可及性的出現(xiàn)，疾病類型和發(fā)病率還在不斷升高。具遺傳特點的眼科疾病，對眼的結(jié)構(gòu)和功能危害嚴(yán)重，且多為雙眼發(fā)病，大多數(shù)隨者病情發(fā)展，視力逐漸遭到破壞，賊終導(dǎo)致失明。我國近幾年的調(diào)查結(jié)果表明，遺傳性眼病約占兒童盲目和視力損傷的 1/3，占盲目和嚴(yán)重視力損傷的 80%，嚴(yán)重危害人類健康。
佳學(xué)基因為臨床遺傳性眼病提供綜合檢測方案，靈活運用二代測序(NGS)測序、Sanger 測序、SNP- array、MLPA、Q-PCR 等多種分子檢測平臺，檢測相關(guān)致病基因的點突變、大片段缺失/重復(fù)、拷貝數(shù)變異等多種基因變異類型，實現(xiàn)全面、正確的分子診斷服務(wù)。
產(chǎn)品優(yōu)勢
1. 個性化解決方案
根據(jù)患者不同情況，推薦個性化檢測方案，更好的節(jié)約時間成本。
2. 更正確的檢測技術(shù)
優(yōu)化設(shè)計加密探針，提高捕獲效率，獲得更多的基因變異信息。
3. 更全面的檢測類型
全譜突變類型新一代測序，外顯子測序可同時完成SNV和單外顯子水平CNV的檢測及驗證，有效提高檢測率。
4. 更專業(yè)的遺傳分析和解讀
采用基因解碼技術(shù)，在數(shù)據(jù)庫比對和生物信息分析基礎(chǔ)上，采用結(jié)構(gòu)功能分析法，提高疾病檢出率與正確率。
5. 先進(jìn)的臨床專家團(tuán)隊
攜手國際國內(nèi)多學(xué)科專家，對檢測結(jié)果進(jìn)行正確解讀并提供有效防治方案。
6. 更貼心的遺傳咨詢服務(wù)
醫(yī)學(xué)/遺傳學(xué)專業(yè)人員提供一對一遺傳咨詢服務(wù)。
佳學(xué)基因遺傳性眼病基因檢測內(nèi)容
佳學(xué)基因視力系統(tǒng)檢測包運用多種分子診斷技術(shù)對目前已知的與眼科遺傳病相關(guān)的 2851 個基因進(jìn)行檢測，涵蓋眼前節(jié)（結(jié)膜、角膜、虹膜、瞳孔和晶狀體）異常、眼底（鞏膜、脈絡(luò)膜、視網(wǎng)膜和黃斑）異常、眼部附屬器（眼瞼、眼框和淚腺）異常以及其他異常等多種遺傳性眼病。為臨床診斷、治療方案選擇、預(yù)后判斷、優(yōu)生優(yōu)育提供科學(xué)依據(jù)。
| 大類 | 細(xì)分類別 | 疾病 | 相關(guān)基因 | 說明 |
| 眼 前 節(jié) 異 常 | 角膜疾病 94個基因 | 角膜營養(yǎng)不良 | AGBL1/CHST6/COL8A2等 | 雙眼對稱,進(jìn)程緩慢,不常伴有其他疾病。 |
| FUCHS內(nèi)皮角膜營養(yǎng)不良 | COL8A2/SLC4A11等 | 年齡較大時發(fā)病。 | ||
| 脆角膜綜合征 | ZNF469/PRDM5 | |||
| 晶狀體疾病 121個基因 | 白內(nèi)障 | ABCA3/ABHD12/ABHD5等 | 顯性遺傳約占73%,隱性遺傳約占23%。 | |
| 青少年白內(nèi)障伴小角膜和糖尿 | SLC16A12 | |||
| 晶狀體異位 | ADAMTS10/ADAMTSL4等 | |||
| 單純性晶狀體異位 | ADAMTSL4/FBN1 | 通常具雙側(cè)性且出現(xiàn)連續(xù)兩代以上發(fā)病。 | ||
| 虹膜疾病 13個基因 | 無虹膜 | PAX6/BDNF/CYP1B1 等 | 一般雙眼受累。發(fā)生率約為人口的十萬分之一。 | |
| 眼 底 異 常 | 視網(wǎng)膜疾病 307個基因 | 視網(wǎng)膜色素變性 | ABCA4/ABHD12/AIPL1等 | RPGR基因因含有高GC區(qū)域,需要一代測序補測。 |
| Usher綜合征(視網(wǎng)膜色素變 性一感音神經(jīng)性耳聾綜合征) | ABHD12/CDH23/CIB2等 | 主要表現(xiàn)為先天性感音神經(jīng)性聾、漸進(jìn)性視網(wǎng)膜色素變性而 致視野縮小視力障礙。 | ||
| Bardet-Biedl 綜合征 | ABCC8/ALMS1/ARL6等 | |||
| Refsum 病(遺傳性運動失調(diào)性 多發(fā)性神經(jīng)炎) | PEX7/PHYH等 | 視網(wǎng)膜色素變性,視力下降,視野縮小,晶狀體混濁等眼部 表現(xiàn)。 | ||
| 白點狀眼底 | RDH5/RHO等 | 非進(jìn)行性視網(wǎng)膜病變。 | ||
| Leber 先天性黑朦 | ABCA4/AHI1/AIPL1等 | 分為嬰兒型和少年型。常伴智力低下/聽力障礙,需與眼- 腎綜合征鑒別。 | ||
| Senior-Loken綜合征(眼-腎 綜合征) | CEP290/IQCB1等 | 重點關(guān)注基因IQCB1,眼底及視功能損害與先天性黑朦相似, 但有腎功能不全。 | ||
| Joubert綜合征 | AHI1/ARL13B/B9D1等 | 主要表現(xiàn)為視網(wǎng)膜發(fā)育不良或缺失,也有部分脈絡(luò)膜脫失。 | ||
| Norrie 病 | NDP | MLPA+測序 | ||
| 滲出性玻璃體視網(wǎng)膜病 | FZD4/LRP5等 | 多兩側(cè)同時發(fā)病但輕重不一定相等。 | ||
| 視錐一視桿營養(yǎng)不良 | RAX2/RIMS1/RLBP1等 | |||
| 夜盲 | CABP4/CACNA1F/CDH23等 | 慢性進(jìn)展。 | ||
| 先天性靜止性夜盲 | CABP4/CACNA1F等 | 男性患者多于女性。 | ||
| 黃斑疾病 68個基因 | 黃斑變性 | ABCA4/APOE/ARMS2等 | 少年型黃斑變性(Stargardt 病)AR遺傳為主,6-20歲前 起病,主要表現(xiàn)為視力下降,但不會失明;卵黃型黃斑變性 (Best病)AD遺傳,多在6歲前起病,一般為雙側(cè)性,有 家族史96%基因測序可檢測到;散發(fā)50%-70%基因測序 可檢測到。 | |
| 黃斑營養(yǎng)不良 | ABCA4/ANO5等 | 明確遺傳因素的黃斑疾病。 | ||
| 脈絡(luò)膜疾病 18個基因 | 無脈絡(luò)膜 | CHM | MLPA+測序 | |
| 其 他 結(jié) 構(gòu) 異 常 | 眼瞼疾病 160個基因 | 瞼裂狹小 | COLEC11/FOXL2等 | |
| Treacher Collin 綜合征(特雷 徹.柯林斯綜合征) | TCOF1/POLR1D/POLR1C | 下眼瞼呈V字型缺陷或下垂、眼睛下垂、部分患者有斜視現(xiàn) 象。 | ||
| 眼球疾病 70個基因 | 小眼畸形 | ALDH1A3/ALX1/BCOR等 | 分為單純型小眼球和伴發(fā)其他部位畸形的小眼球,又稱先天 性小眼球。 | |
| 單純性裂開性小眼畸形 | ABCB6/GDF3等 | |||
| 無眼畸形 | BCOR/SOX2等 | 捕獲測序+SNP-array | ||
| 發(fā)育異常 526個基因 | Stickler 綜合征 | COL11A1/COL11A2等 | 常見皮爾羅賓氏癥,晶狀體、玻璃體、視網(wǎng)膜受損,常發(fā)近 視和青光眼。近視發(fā)生率大于75%,通常是先天性高度近視, 多于6歲前出現(xiàn)。 | |
| Peters 異常 | CYP1B1/PAX6等 | 晶狀體、虹膜、角膜發(fā)育異常。80%患者雙眼發(fā)病,超過50% 患者會同時伴有青光眼。 | ||
| Axenfeld-Rieger 綜合征 | FOXC1/PITX2 | 虹膜和角膜等發(fā)育異常,常發(fā)青光眼。一般發(fā)病在5~30 歲,多見于青少年期。 | ||
| 神 經(jīng) 性 疾 病 | 眼動異常 437個基因 | 眼球震顫 | ABCB7/ADCK3/AIPL1等 | |
| 進(jìn)行性眼外肌麻痹伴線粒體 DNA 缺失綜合征 | POLG/POLG2等 | MLPA+捕獲測序 | ||
| 先天性眼外肌纖維化 | KIF21A等 | 應(yīng)與眼外肌麻痹進(jìn)行鑒別診斷。 | ||
| X連鎖先天性眼球震顫 | FRMD7/GPR143 | |||
| 視神經(jīng)疾病 核/線粒體基 因 | Leber遺傳性視神經(jīng)病 | G3460A/ G11778A/T14484C 線粒體基因組 | 捕獲測序 | |
| 視神經(jīng)萎縮 | AAAS/ABHD12/ACO2等 線 粒體基因組 | 捕獲測序 | ||
| 其 他 疾 病 | 青光眼 37個基因 | 青光眼 | ACVR1C/ADAMTS10/ADAMTS 17等 | |
| 原發(fā)性開角型青光眼 | OPTN/MYOC等 | 好發(fā)于30歲以下男性。 | ||
| 色素異常 62個基因 | 白化病 | AP3B1/ASIP/BLOC1S3等 | 眼皮膚白化病(AR為主)在近親通婚的家族,其發(fā)生率會偏 高;眼白化病(XL連鎖遺傳)基因測序約占43%(男性約 占90%),大片段缺失/重復(fù)約占48%。 | |
| Hermansky-Pudlak 綜合征 (白化病,出血性素質(zhì)) | AP3B1/BLOC1S3/BLOC1S6 等 | 呈現(xiàn)眼部白化病。 | ||
| WAARDENBURG 綜合征 | EDN3/EDNRB等 | 約1/3為基因突變,活嬰中發(fā)病率約 1/4000。 | ||
| 屈光異常 218個基因 | 近視 | ABCA4/ADAMTS10/BMP2K等 | 單純性近視屬于多基因遺傳病,高度近視屬于染色體隱性遺 傳,兩者預(yù)后差異大。 | |
| 眼科腫瘤 35個基因 | 視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤 | RB1 | MLPA+cfNDA測序 |
佳學(xué)基因近視相關(guān)基因檢測內(nèi)容
全球范圍內(nèi)近視變得越來越普遍，高度近視患者占全球人口的0.5%~5.0%。2019年中國全國青少年總體近視率為50.2%，眼科疾病是《人體基因序列變化與疾病表征》中的一個重要內(nèi)容，是基因解碼致力于人類健康的一個基本項目。佳學(xué)基因提供全面的218個近視相關(guān)基因檢測其中包括27個單純近視相關(guān)基因、44個無眼外表型相關(guān)基因以及149個伴眼外觀表型相關(guān)基因，以輔助近視正確防控及診斷治療。
| 分類 | 疾病 | 基因 |
| 單純近視 | 近視 | MYP1/SCO2等28個基因 |
| 無眼外表型近視 | 全色盲、視錐細(xì)胞營養(yǎng)不良、先天性黑朦等 | CNGB3/KCNV2/TULP1等46個基因 |
| 伴眼外觀表型近視 | Alagille 綜合征、眼-耳腎綜合征、溶酶體儲積癥等 | JAG1/COL4A5/ LAMP2等169個基因 |
基因治療與遺傳性眼病
基因治療是在全面正確地找到具有遺傳病性眼病的基因序列列變化后，采用新型基因治療技術(shù)，對導(dǎo)致疾病發(fā)生的基因突變進(jìn)行替換修改，從而恢復(fù)患者的正功能的治療方法。其有效性、安全性已在動物實驗中得到驗證，這也為基因治療的臨床應(yīng)用提供了豐富的理論基礎(chǔ)。
| Table1 Completed retinal degeneration gene theapy trials as of August 2018 |
| NCTID | Dystrophy | Subretinal injcion | Phase |
| 00643747 | LCA2 | tgAAG76 (rAAV 2/2.hRPE65p.hRPE65) | 1,1I |
| 01496040 | LCA2 | rAAV2/4. hRPE65 | 1,11 |
| 00821340 | LCA2 | rAAV2-hRPE65 | 一 |
| 00999609 | LCA2 | Voretigene neparvovec-zyl (AAV2-hRPE65v2-101) | 1 |
| 00749957 | LCA2 | rAAV2-CB-hRPE65 | 1,11 |
| 02077361 | CHM | rAAV2.REPI | 1,1I |
| 01461213 | CHM | rAAV2.REPI | 1,1I |
| 01301443 | Wet AMD | RetinoSuat (lentivirus with endostatin/angiostatin) | 一 |
| 01494805 | Wet AMD | rAAVsF1-1 | |
| Ila | |||
| 01024998 | Wet AMD | AAV2-sFLT01 | 一 |
| 01267422 | LHON | rAAV2-ND4 | NA |
| Tble2 Rctinal dcgencation gcne theapy urials in progress |
| NCTID | Dbcae | Injoction location | henention | Pbuse |
| 02946879 | LCA2 | Subrdinul | AAV OPTIRPE65 | L1I |
| 00516477 | LCA2 | Subrctinul | Vorctigcne ncpunocc-ryl (MV2ARPE65v2-10I) | |
| 01208389 | LCA2 | Subrctinal | Vercigoe noponwn7yQ(W24BPE6B2.1010 | L1I |
| 00481546 | LCA2 | Subrctinul | rAV2- CBSB-HRPF65 | |
| 02781480 | LCA2 | Subrdinul | AAV RPE65 | LII |
| 03140969 | LCA10 | Intravircal | QR.110 | L1I |
| 02064569 | LHON | Intro iureal | G5010 | L1 |
| 03293524 | UHON | Itrv iteal | GS0I0 fAAV22-ND4 | 0 |
| 03153293 | LHON | Intravitrcal | tAAV2-ND4 | |
| 02161380 | LHON | latravitreal | sAAV2-PIND4v2 | |
| 03428178 | LHON | Intravireal | tAAV2-ND4 | NA |
| 03507686 | CHM | Subctinul | AAV2-REPI | |
| 03496012 | CHM | Subrtinal | AAV2-REPI | |
| 03584165 | CHM | Subrdinul | AAV2-REPI | NA |
| 02341807 | CHM | Subrdinul | AAV2-CHM | LI |
| 03326336 | RP | Iotravitead | GS030-DP (fopgnctics withrMV2.7m8-CAG-Chrim sonR-dTomao) | L.1 |
| 02556736 | RP | Intravited | RST-001 fopgadics with chunnelrhodopin-2) | L1 |
| 03374657 | RP | Subrdinal | CPK8S0(sCAAVS-RLBPI) | 1,1 |
| 03328130 | RP | Subrdtinal | AMV25-hPDB6B | L1 |
| 03252847 | XIinkod RP | Subrdinul | AAVRPGR | L1 |
| 03116113 | KinledRP | Subrdinal | AAVRPGR | 11 |
| 03316560 | KinkedRP | Subrdtinal | tAAV2YFCB-RPGR(ORFI5 gcne) | n |
| 02416622 | Klnked RS | Intavited | rAAV2YFCB-bRS1 | |
| 02317887 | Xrinled RS | Iotrvitrd | AAV8-dRSIRBPRS ; | L1 |
| 01482195 | MERTK-asociutod | Subrtinal | AAV2-VMD2-bMERTK | |
| etinul divcae | ||||
| 03066758 | Wa AMD | Subrtinal | RGX-314(MAV8 with gene cncoding anti-VEGF monoclo | 1 |
| nal antibody fmagment) | ||||
| 01024998 | Wd AMD | Intravitreal | AAV2-4FLTOI | |
| 03585556 | Wa AMD | Intravitread | AAVCAGCD59 | |
| 01678872 | Wet AMD | Subrtinl | RctnoSat (entiviros wih cndostatin/angiotatin) | |
| 03144999 | Dry AMD | Ihtravitredl | AAVCAGsCD59 | |
| 03284268 | Rctinobastonu | btravitead | VCN01 (oncolytic adenovirnus) |
2019年《Molecular Diagnosis & Therapy》期刊中發(fā)表一篇關(guān)于神經(jīng)視網(wǎng)膜退化基因治療進(jìn)展，這一經(jīng)過同行審議的文章中統(tǒng)計了截止2018年8月已完成9項視網(wǎng)膜退化基因治療臨床試驗，還有30項臨床試驗正在進(jìn)行中。眼球因其特殊的生理及解剖學(xué)特點使之成為基因治療的理想器官。因此基因治療為之前無法治療的遺傳性眼病如神經(jīng)視網(wǎng)膜退化患者提供了治療選擇。
案例分享
患者介紹：
男，58歲；受檢者 9 歲起有夜盲，21 歲開始視力下降。受檢者母親高度近視。
檢測結(jié)果：
視網(wǎng)膜色素變性是一種嚴(yán)重的遺傳性視網(wǎng)膜變性，主要影響視桿細(xì)胞。它通常會導(dǎo)致早發(fā)性夜盲癥和周邊視力喪失，通常會導(dǎo)致患者在30至40歲時失明。在視網(wǎng)膜色素變性3型中，受影響的男性具有嚴(yán)重的表型，而攜帶者女性則表現(xiàn)出廣泛的臨床特征，從有效無癥狀到嚴(yán)重的視網(wǎng)膜變性。
| 基因(參考轉(zhuǎn)錄本) | 核苷酸/氨基酸變化 | 合子狀態(tài) | 變異分類 | 疾病/表型 | 遺傳模式 | 變異來源 |
| RPGR/NM_001034853.1 | c.2614dup/p.E872G*207 | 半合子 | LP | 視網(wǎng)膜色素變性3型 | XR | N/A |
根據(jù)佳學(xué)基因檢測結(jié)果，該患者在c.2614坐標(biāo)處具有一個重復(fù)突變，從而使其基因序列與健康人有區(qū)別造成疾病的發(fā)生。
(責(zé)任編輯：佳學(xué)基因)
