【佳學(xué)基因-基因檢測】什么是全外顯子組測序?
全外顯子組測序,簡稱全外顯子測序。這個概念或者是名詞主要是用來定義高通量測序的范圍。使用該名詞,如果有效按照技術(shù)指標(biāo),它應(yīng)當(dāng)是對一個基因組的全部外顯子的基因序列進(jìn)行獲取。它是在兒科基因檢測、罕見病基因檢測、致病基因鑒定過程中的一個測序質(zhì)量要求。應(yīng)當(dāng)注意的是全外顯子測序或者全外顯子測序本身不能找疾病發(fā)生的原因。它還需要接合其他基因技術(shù)。我們首先來介紹一下外顯子測序技術(shù)。全外顯子組測序哪里做?
首先了解下外顯子,它是真核生物基因的一部分,在轉(zhuǎn)錄過程中發(fā)生剪接(Splicing)后仍會被保存下來,并可在蛋白質(zhì)生物合成過程中被表達(dá)為蛋白質(zhì)。全外顯子組則是所有外顯子序列的合集。當(dāng)存在影響蛋白結(jié)構(gòu)的變異時,全外顯子測序就利用目標(biāo)序列捕獲技術(shù)對蛋白編碼序列進(jìn)行高通量測序,找出結(jié)構(gòu)變異。全外顯子測序技術(shù)?
人類基因中大約有180,000外顯子,占人類基因組的1%,約30MB。相比于人類全基因組重測序,全外顯子組測序成本低,效率高,尤其是對已知的單基因病的研究,同時對于復(fù)雜疾病及癌癥等的致病基因和易感基因的確定也有廣泛應(yīng)用。擴(kuò)展全外顯子組測序的價格?
既然如此,那么只用全外顯子測序來檢測基因突變,尋找治病原因豈不是經(jīng)濟(jì)又高效?全外顯子測序是對具有蛋白編碼功能的外顯子進(jìn)行的測序技術(shù),也就是說它檢測的是編碼蛋白質(zhì)部分的基因的突變情況。人們研究發(fā)現(xiàn),對于單核苷酸突變(SNV)和小片段插入/缺失突變(indel)檢測,全外顯子測序結(jié)果和全基因組測序結(jié)果是相近的,只不過全基因組測序結(jié)果相對質(zhì)量高且均一;至于拷貝數(shù)變異(cnv)以及染色體結(jié)構(gòu)變異(sv),全外顯子組測序就沒有全基因組測序那么高效了。全外顯子組測序哪里做?
雖然目前全外顯子測序依靠著經(jīng)濟(jì)、正確高效的優(yōu)勢被青睞,但全基因組測序在檢測導(dǎo)致疾病發(fā)生的潛在基因突變方面更加強大。隨著測序技術(shù)的快速發(fā)展以及全基因組測序成本的降低,在將來的科學(xué)研究和臨床醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域,綜合利用全基因組測序和全外顯子測序的方法,對重大疾病以及腫瘤的致病機(jī)制和正確治療方面將會有著廣闊前景。醫(yī)學(xué)全外顯子組測序哪里做?
全外顯子測度需檢區(qū)別于檢測包,基因檢測panel.html">PANEL、基因檢測大PANLE、基因測序PANEL。全外顯子測序是致病基因鑒定基因解碼對測序的基本要求,致病基因鑒定基因解碼的出發(fā)點是通過一次檢測,增大獲得、找到突變基因、明確基因原因的可能性。而檢測包或者是檢測PANEL則是人為地、主觀選擇部分基因序列,在選擇基因范圍內(nèi)查找導(dǎo)致疾病發(fā)生的原因。因此,在很多情況下,采用基因檢測包、基因檢測PANEL檢測結(jié)果是陰性的時候,還需再做基于全外顯測序的致病基因鑒定基因解碼。醫(yī)學(xué)全外顯子組測序哪里做?