【佳學(xué)基因-基因檢測】人全基因組重測序簡介
人類基因組測序是什么?人全基因組重測序又是什么?
首先介紹下背景,人類基因組含有約30億個(gè)堿基對,其中包含了大約有2-3萬個(gè)基因。為了解讀人類全部遺傳信息,美國科學(xué)家于1985年率先提出人類基因組計(jì)劃,并在1990年正式啟動,中國也在1999年加入此計(jì)劃;在2000年完成了人類基因組工作草圖,賊終在2005年完成測序工作。當(dāng)人類基因組計(jì)劃完成后,人們開始尋求生命起源、認(rèn)識個(gè)體間差異的原因、研究疾病發(fā)生機(jī)制等一系列有關(guān)于人類生命活動相關(guān)的科學(xué)研究,尋找解決各種困擾人類生命健康問題的方法。
既然人類基因組已經(jīng)測序完成,那么我們就可以通過利用高通量測序平臺對人的不同個(gè)體或群體進(jìn)行全基因組測序,這種測序成為人全基因組重測序,其目的是在個(gè)體或群體水平上進(jìn)行生物信息分析,全面挖掘DNA水平的遺傳變異,為篩選疾病的致病及易感基因,研究發(fā)病及遺傳機(jī)制提供重要信息。
人重測序主要應(yīng)用于腫瘤的研究、單基因病以及復(fù)雜疾病的研究。在遺傳病研究中,通過全基因組測序與全外顯子測序找到遺傳病的致病原因,即突變位點(diǎn),闡明發(fā)病機(jī)理,從而對染色體綜合征、單基因病和多基因病進(jìn)行全面研究。在腫瘤研究中,其主要目的則是發(fā)掘腫瘤易感基因,找到驅(qū)動基因,研究腫瘤從原發(fā)到反復(fù)的進(jìn)化,了解腫瘤測演化,以及對細(xì)胞系藥物的敏感性都有全面的研究。
全基因組測序對融合基因的檢測、基因拷貝變異、染色體結(jié)構(gòu)變異以及病毒整合位點(diǎn)的檢測也有獨(dú)特的分析?;蛉诤显诨蚪M中非常普遍,也是一些癌癥類型的標(biāo)志。全基因組測序在發(fā)現(xiàn)全新的基因融合斷裂點(diǎn)方面更勝一籌,測序深度和更長的測序序列實(shí)現(xiàn)了在融合鏈接單元單堿基的分辨率,為研究融合的機(jī)制提供了線索。對于基因拷貝變異(CNV)的研究中發(fā)現(xiàn),腫瘤發(fā)展和耐藥性通常是由潛在的基因擴(kuò)增和刪除驅(qū)動的。染色體結(jié)構(gòu)的變異也是疾病及腫瘤形成的根本原因。通過全基因組測序技術(shù)繪制病毒基因組中病毒整合位點(diǎn)全景圖,為解析病毒整合致癌機(jī)制提供了線索。
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