【佳學(xué)基因檢測】腫瘤850靶向藥物基因檢測為何要包括基質(zhì)金屬肽酶7(MMP7)基因
腫瘤基因檢測中如何增加和排除基因檢測位點
根據(jù)腫瘤基因檢測如何增加靶向藥物選擇的可能性的?,國際有很高知名度基因檢測科學(xué)性證據(jù)雜志《Front Oncol》在第. 2022 Jun 17;12:916907.期發(fā)表了一篇標(biāo)題為《腫瘤850靶向藥物基因檢測為何要包括基質(zhì)金屬肽酶7(MMP7)基因》的可以產(chǎn)生多種癌癥的基因突變列表文章。該基因領(lǐng)域的臨床應(yīng)用研究由Nana Meng , Yaguang Li, Pengcheng Jiang, Xuefeng Bu, Jifei Ding, Yan Wang , Xiaodong Zhou, Feng Yu, Yongjun Zhang, Jie Zhang, Leizhou Xia 完成。
基因信息數(shù)據(jù)庫索引號:
基因大數(shù)據(jù)表簽: 35785154和 doi: 10.3389/fonc.2022.916907. eCollection 2022.
基因解碼研究關(guān)鍵詞:
MMP7,生物信息學(xué),癌相關(guān)成纖維細(xì)胞,泛癌,預(yù)后腫瘤浸潤性免疫細(xì)胞
國際基因解碼證據(jù)鏈條標(biāo)簽:
MMP7; bioinformatics; cancer-associated fibroblasts; pan-cancer; prognosis; tumor-infiltrating immune cells.
基因檢測臨床研究與應(yīng)用結(jié)果介紹:
癌癥內(nèi)科學(xué)對腫瘤基因檢測的依賴性研究表明:越來越多的證據(jù)表明基質(zhì)金屬肽酶7(MMP7)在各種腫瘤中具有致癌作用。然而,沒有基于大量臨床數(shù)據(jù)對MMP7與不同癌癥之間的關(guān)系進(jìn)行系統(tǒng)的泛癌分析。佳學(xué)基因腫瘤與癌基因解碼研究搜索了TIMER2、GEPIA2、UALCAN、cBioPortal、String、Metascape和其他web數(shù)據(jù)庫。通常,與配對正常對照組相比,MMP7在大多數(shù)癌癥基因組圖譜(TCGA)癌癥類型中的表達(dá)顯著上調(diào),但在浸潤性乳腺癌(BRCA)、腎嫌色癥(KICH)、腎透明細(xì)胞癌(KIRC)、肝細(xì)胞癌(LIHC)和皮膚皮膚黑色素瘤(SKCM)的腫瘤組織中表達(dá)下調(diào)。MMP7蛋白在結(jié)腸癌、肺腺癌(LUAD)和子宮內(nèi)膜體癌(UCEC)的原發(fā)腫瘤組織中的表達(dá)顯著高于正常組織,在乳腺癌、透明細(xì)胞腎癌和卵巢癌的原發(fā)腫瘤組織中的表達(dá)顯著低于正常組織。此外,MMP7表達(dá)基因檢測與病理分期、臨床結(jié)果、腫瘤突變負(fù)荷(TMB)和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(TSI)密切相關(guān)。在大多數(shù)TCGA癌癥類型中檢測到基因擴(kuò)增。此外,基因檢測大數(shù)據(jù)分析表明:錯義突變是腫瘤中MMP7基因改變的主要類型。MMP7表達(dá)與腫瘤相關(guān)成纖維細(xì)胞(CAF)在大多數(shù)TCGA癌癥中呈顯著正相關(guān)。MMP7的表達(dá)也與某些特定腫瘤類型中樹突狀細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的浸潤呈正相關(guān)。通過腫瘤發(fā)生、發(fā)展的信號傳導(dǎo)通路分析(KEGG)途徑和基因本體(GO)方法進(jìn)行的功能富集分析表明,RNA處理和DNA損傷檢查點可能揭示MMP7的發(fā)病機(jī)制?;蚪獯a在設(shè)計基因檢測位點與解讀基因檢測結(jié)果時所采用的這種泛癌分析為MMP7在不同癌癥類型中的致瘤作用提供了一個清晰的全景。此外,MMP7可能是此類癌癥的潛在藥物治療靶點。為靶向藥物治療與尋找靶向藥物提供了新的路徑。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)