【佳學基因檢測】腫瘤850靶向藥物基因檢測為何要包括基質金屬肽酶7(MMP7)基因
腫瘤基因檢測中如何增加和排除基因檢測位點
根據(jù)腫瘤基因檢測如何增加靶向藥物選擇的可能性的?,國際著名基因檢測科學性證據(jù)雜志《Front Oncol》在第. 2022 Jun 17;12:916907.期發(fā)表了一篇標題為《腫瘤850靶向藥物基因檢測為何要包括基質金屬肽酶7(MMP7)基因》的可以產(chǎn)生多種癌癥的基因突變列表文章。該基因領域的臨床應用研究由Nana Meng , Yaguang Li, Pengcheng Jiang, Xuefeng Bu, Jifei Ding, Yan Wang , Xiaodong Zhou, Feng Yu, Yongjun Zhang, Jie Zhang, Leizhou Xia 完成。
基因信息數(shù)據(jù)庫索引號:
基因大數(shù)據(jù)表簽: 35785154和 doi: 10.3389/fonc.2022.916907. eCollection 2022.
基因解碼研究關鍵詞:
MMP7,生物信息學,癌相關成纖維細胞,泛癌,預后腫瘤浸潤性免疫細胞
國際基因解碼證據(jù)鏈條標簽:
MMP7; bioinformatics; cancer-associated fibroblasts; pan-cancer; prognosis; tumor-infiltrating immune cells.
基因檢測臨床研究與應用結果介紹:
癌癥內(nèi)科學對腫瘤基因檢測的依賴性研究表明:越來越多的證據(jù)表明基質金屬肽酶7(MMP7)在各種腫瘤中具有致癌作用。然而,沒有基于大量臨床數(shù)據(jù)對MMP7與不同癌癥之間的關系進行系統(tǒng)的泛癌分析。佳學基因腫瘤與癌基因解碼研究搜索了TIMER2、GEPIA2、UALCAN、cBioPortal、String、Metascape和其他web數(shù)據(jù)庫。通常,與配對正常對照組相比,MMP7在大多數(shù)癌癥基因組圖譜(TCGA)癌癥類型中的表達顯著上調(diào),但在浸潤性乳腺癌(BRCA)、腎嫌色癥(KICH)、腎透明細胞癌(KIRC)、肝細胞癌(LIHC)和皮膚皮膚黑色素瘤(SKCM)的腫瘤組織中表達下調(diào)。MMP7蛋白在結腸癌、肺腺癌(LUAD)和子宮內(nèi)膜體癌(UCEC)的原發(fā)腫瘤組織中的表達顯著高于正常組織,在乳腺癌、透明細胞腎癌和卵巢癌的原發(fā)腫瘤組織中的表達顯著低于正常組織。此外,MMP7表達基因檢測與病理分期、臨床結果、腫瘤突變負荷(TMB)和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(TSI)密切相關。在大多數(shù)TCGA癌癥類型中檢測到基因擴增。此外,基因檢測大數(shù)據(jù)分析表明:錯義突變是腫瘤中MMP7基因改變的主要類型。MMP7表達與腫瘤相關成纖維細胞(CAF)在大多數(shù)TCGA癌癥中呈顯著正相關。MMP7的表達也與某些特定腫瘤類型中樹突狀細胞和巨噬細胞的浸潤呈正相關。通過腫瘤發(fā)生、發(fā)展的信號傳導通路分析(KEGG)途徑和基因本體(GO)方法進行的功能富集分析表明,RNA處理和DNA損傷檢查點可能揭示MMP7的發(fā)病機制?;蚪獯a在設計基因檢測位點與解讀基因檢測結果時所采用的這種泛癌分析為MMP7在不同癌癥類型中的致瘤作用提供了一個清晰的全景。此外,MMP7可能是此類癌癥的潛在藥物治療靶點。為靶向藥物治療與尋找靶向藥物提供了新的路徑。
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