【佳學(xué)基因檢測】在溶組織內(nèi)阿米巴中建立基于定量 RNAi 的正向遺傳學(xué)和生長所需基因的鑒定

腫瘤基因檢測龍頭企業(yè)國產(chǎn)

在高峰論壇中博士醫(yī)師年度雙基練習(xí)體會(huì)到《Int J Nanomedicine》在?2021; 16: 3217–3240發(fā)表了一篇題目為《在溶組織內(nèi)阿米巴中建立基于定量 RNAi 的正向遺傳學(xué)和生長所需基因的鑒定》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Liyu Zhang, Meng Wang, Zeen Zhu, Chenxi Ding, Shengquan Chen, Haibin Wu, Ying Yang, Fengyu Che, Qiao Li, and Hui Li,等完成。促進(jìn)了腫瘤的正確治療與個(gè)性化用藥的發(fā)展，進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了基因信息檢測與分析的重要性。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

溶組織內(nèi)阿米巴,正向遺傳學(xué),深度測序分析

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果

雖然溶組織內(nèi)阿米巴仍然是一種全球重要的病原體，但它的研究卻大大不足。 E. histolytica 的易處理性歷來是有限的，這主要是由于其基因組的挑戰(zhàn)性特征。為了實(shí)現(xiàn)正向遺傳學(xué)，我們構(gòu)建并驗(yàn)證了先進(jìn)個(gè)全基因組溶組織大腸桿菌 RNAi 敲低突變體庫。該文庫允許 Illumina 深度測序分析，以定量鑒定選擇后富集或耗盡的突變體。我們開發(fā)了一種新的分析流程來正確定義和量化基因片段。我們使用該庫在 E. histolytica 中進(jìn)行了先進(jìn)次 RNAi 篩選，并確定了緩慢生長 (SG) 突變體。在 SG 突變體中靶向的基因中，許多具有與細(xì)胞生長或代謝途徑中的作用一致的注釋功能。一些靶向基因被注釋為假設(shè)的或缺少注釋的域，支持正向遺傳學(xué)在發(fā)現(xiàn)無法從數(shù)據(jù)庫中收集的功能信息方面的力量。雖然通過序列分析無法預(yù)測 SG1 和 SG2 突變體中靶向的蛋白質(zhì)的定位，但我們通過實(shí)驗(yàn)表明 SG1 定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞表面，而 SG2 定位于細(xì)胞質(zhì)。 SG1 的過表達(dá)導(dǎo)致生長增加，而截?cái)嗤蛔凅w的表達(dá)不會(huì)導(dǎo)致生長增加，因此有助于定義該蛋白質(zhì)的功能域。賊后，除了建立正向遺傳學(xué)之外，我們還發(fā)現(xiàn)了不尋常的溶組織大腸桿菌 RNAi 途徑的新細(xì)節(jié)。這些研究極大地提高了溶組織大腸桿菌的易處理性，并開辟了應(yīng)用遺傳學(xué)來提高對(duì)這一重要病原體的了解的可能性。

腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

?Entamoeba histolytica,forward genetics, deep sequencing analysis