【佳學(xué)基因檢測】在乳腺癌細胞中獲得多西紫杉醇耐藥性期間外顯子組的逐步進化

腫瘤基因檢測哪家機構(gòu)賊好導(dǎo)讀

根據(jù)腫瘤基因檢測全面性的標準與實施方案知悉《Ann Oncol》在?2015 Aug; 26(8): 1589–1604發(fā)表了一篇題目為《在乳腺癌細胞中獲得多西紫杉醇耐藥性期間外顯子組的逐步進化》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Management of patients with advanced prostate cancer: recommendations of the St Gallen Advanced Prostate Cancer Consensus Conference (APCCC)?等完成。促進了腫瘤的正確治療與個性化用藥的發(fā)展，進一步強調(diào)了基因信息檢測與分析的重要性。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

乳腺癌,多西他賽耐藥,紫杉烷,外顯子組測序

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果

背景：乳腺癌患者對紫杉烷類治療的耐藥性是一個主要的臨床問題，可以通過深入了解導(dǎo)致乳腺癌細胞對紫杉烷類藥物耐藥的基因組改變來解決。在目前的研究中，我們使用全外顯子組測序來發(fā)現(xiàn)體細胞基因組改變，在乳腺癌細胞系中獲得多西紫杉醇耐藥性的過程中跨越進化階段。結(jié)果：兩種人乳腺癌體外模型（MCF-7 和 MDA-MB-231 ) 通過將細胞暴露于 18 種逐漸增加的多西紫杉醇濃度來開發(fā)逐步獲得多西紫杉醇抗性的方法。在此過程中在五個連續(xù)階段進行的全外顯子組測序用于識別與獲得多西紫杉醇抗性相關(guān)的單點突變事件、插入/缺失和拷貝數(shù)改變。使用基于網(wǎng)絡(luò)的方法進一步優(yōu)先考慮經(jīng)歷正選擇和具有可能具有功能的特征的獲得性編碼變異。發(fā)現(xiàn)許多基因組變化正在進行進化選擇，其中一些可能是功能性的。在抗性進展的五個階段中，大多數(shù)抗性相關(guān)基因組變異似乎出現(xiàn)在有效抗性細胞的中間，對應(yīng)于 MDA-MB-231 的第 31 代（5 nM 多西紫杉醇）和 MCF-7 的第 16 代（1.2 nM 多西紫杉醇），并且細胞也分別表現(xiàn)出生長速率降低或停滯的時期。 MCF-7 細胞在 7 號染色體上獲得了多個拷貝數(shù)增益，包括 ABC 轉(zhuǎn)運蛋白基因，包括 ABCB1 和 ABCB4，以及 DMTF1、CLDN12、CROT 和 SRI。對于 MDA-MB-231，在涉及 30 多個基因的 X 染色體上觀察到大量拷貝數(shù)丟失。在這些基因中，CASK、POLA1、PRDX4、MED14 和 PIGA 被應(yīng)用的基于網(wǎng)絡(luò)的基因排序方法高度優(yōu)先考慮。在較高的多西紫杉醇濃度下，MCF-7 亞克隆在 E2F4 中表現(xiàn)出拷貝數(shù)丟失，并且編碼這一重要轉(zhuǎn)錄因子的基因在 MCF-7 抗性細胞中被下調(diào)。結(jié)論我們對獲得性多西紫杉醇抗性進化的研究確定了幾種可能的基因組變化解釋多西紫杉醇耐藥性的發(fā)展。有趣的是，賊相關(guān)的抗性相關(guān)變化似乎起源于向有效抗性細胞系進化的中途。我們的數(shù)據(jù)表明，沒有單一的基因組事件足以預(yù)測對多西他賽的耐藥性，但需要影響多個途徑的基因組改變共同建立賊終的耐藥階段。電子補充材料本文的在線版本（doi:10.1186/s12864-016-2749-4 ) 包含補充材料，可供授權(quán)用戶使用。關(guān)鍵詞：乳腺癌、多西紫杉醇耐藥性、紫杉烷、外顯子組測序

腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

?Breast cancer, Docetaxel resistance, Taxane, Exome sequencing