【佳學基因檢測】同源獨立 CRISPR-Cas9 脫靶評估方法的評估

如何決定做基因檢測，不做基因檢測的理由合理嗎

挖掘腫瘤基因組學個性化藥物選擇記錄《PLoS One》在 2018; 13(4): e0185237發(fā)表了一篇題目為《同源獨立 CRISPR-Cas9 脫靶評估方法的評估》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Hui Huang, Investigation, Yanhua Chen, Validation, Huishuang Chen, Project administration, Yuanyuan Ma, Formal analysis, Pei-Wen Chiang, Conceptualization, Jing Zhong, Data curation, Xuyang Liu, Methodology, Asan, Supervision, Jing Wu, Software, Yan Su, Writing – original draft, Xin Li, Writing – review & editing, Jianlian Deng, Supervision, Yingping Huang, Investigation, Xinxin Zhang, Writing – original draft, Yang Li, Funding acquisition, Ning Fan, Investigation, Ying Wang, Data curation, Lihui Tang, Validation, Jinting Shen, Validation, Meiyan Chen, Methodology, Xiuqing Zhang, Conceptualization, Deng Te, Resources, Writing – review & editing, Santasree Banerjee, Conceptualization, Hui Liu, Formal analysis, Ming Qi, Conceptualization, and Xin Yi, Conceptualization,等完成。促進了腫瘤的正確治療與個性化用藥的發(fā)展，進一步強調(diào)了基因信息檢測與分析的重要性。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

CRISPR-Cas基因編輯,脫靶編輯,CIRCLE-seq,SITE-seq

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果

通過 CRISPR-Cas 基因編輯專門改變基因組的能力已經(jīng)有效改變了生物學研究、生物技術(shù)和醫(yī)學。然而，該技術(shù)的廣泛治療應(yīng)用將需要通過基于同源性的預測以及檢測脫靶編輯的高效方法對脫靶編輯進行有效的臨床前評估。存在幾種脫靶位點提名分析，但需要仔細比較以確定它們的相對優(yōu)勢和劣勢。在這項研究中，HEK293T 細胞用 Streptococcus pyogenes Cas9 和 8 個具有不同預測混雜水平的引導 RNA 處理，以比較三種同源無關(guān)的脫靶提名方法的性能：基于細胞的測定法、GUIDE-seq 和生化檢測 CIRCLE-seq 和 SITE-seq。這三種方法的基準測試是使用混合捕獲對 75,000 個同源提名位點進行測序，然后進行高通量測序，從而對此類方法進行了迄今為止賊全面的評估。這三種方法在提名序列確認的脫靶位點方面表現(xiàn)相似，但在提名的位點總數(shù)上存在很大差異。當與依賴同源性的提名方法和測序確認相結(jié)合時，所有三種脫靶提名方法都提供了對脫靶活動的全面評估。 GUIDE-seq 的低假陽性率以及其信號與觀察到的編輯的高度相關(guān)性突出了其為離體 CRISPR-Cas 療法提名脫靶位點的適用性。

腫瘤發(fā)生與反復轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

CRISPR-Cas gene editing,off-target editing, CIRCLE-seq,SITE-seq