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【佳學(xué)基因檢測】基因檢測CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性顯示消化道癌的潛在風(fēng)險

【佳學(xué)基因】基因檢測CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性顯示消化道癌的潛在風(fēng)險。消化系統(tǒng)腫瘤風(fēng)險基因檢測導(dǎo)讀:消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的研究結(jié)果表明,CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性可能會

佳學(xué)基因檢測】基因檢測CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性顯示消化道癌的潛在風(fēng)險



消化系統(tǒng)腫瘤風(fēng)險基因檢測導(dǎo)讀:

背景:

Caveolin-1 (CAV1) 是caveolae 的重要結(jié)構(gòu)成分,通過復(fù)雜的細(xì)胞信號通路調(diào)節(jié)細(xì)胞過程,并影響致瘤性。然而,CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性在消化道癌癥中的作用仍然沒有定論。進(jìn)行meta分析評估CAV1多態(tài)性對消化道癌易感性的影響,為正確治療提供依據(jù)。

方法:

使用PubMed、EMBASE、Google Scholar和CNKI的數(shù)據(jù)庫檢索截至2020年6月已發(fā)表的關(guān)于CAV1(rs7804372)多態(tài)性和消化道癌易感性的研究。兩名研究人員分別進(jìn)行了研究篩選、數(shù)據(jù)提取和方法學(xué)質(zhì)量評估。納入和排除標(biāo)準(zhǔn)。使用 Review Manager 5.3 軟件進(jìn)行薈萃分析。

結(jié)果:

納入了 6 項病例對照研究,包括 2477 名消化道癌癥患者和 2477 名健康對照。匯總結(jié)果顯示,CAV1 rs7804372(T29107A)多態(tài)性增加了該等位基因發(fā)生消化道癌的風(fēng)險(T vs. A:優(yōu)勢比(OR)1.33,95%置信區(qū)間(CI):1.15-1.53??,P ?< . 01), 純合子 ( TT vs. AA : OR 1.72, 95% CI: 1.31–2.26, P ?< .01), 雜合子 ( TA vs. AA : OR 1.47, 95% CI: 1.21–1.78, P ?< .01) , 顯性 ( TT vs. TA + AA: OR 1.32, 95% CI: 1.18–1.48, P ?< .01) 和隱性比較模型 ( TT + TA vs. AA : OR 1.61, 95% CI: 1.26–2.07, P ?< .01)。

結(jié)論:

消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的研究結(jié)果表明,CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性可能會改變消化道癌的發(fā)生,并且CAV1 (rs7804372) 的T等位基因或TT基因型的存在可能會增加消化道癌的風(fēng)險。

關(guān)鍵詞: CAV1,消化道癌,薈萃分析,多態(tài)性

 

1.簡介

隨著全球老齡化和不健康生活方式的發(fā)展,惡性腫瘤的發(fā)病率逐年增加。在全球范圍內(nèi),消化系統(tǒng)惡性腫瘤的發(fā)病率位居癌癥發(fā)病率前列。消化系統(tǒng)癌癥,特別是食管癌、胃癌、結(jié)直腸癌和肝細(xì)胞癌,是全球關(guān)鍵的流行病學(xué)健康問題。與其他癌癥相比,消化道癌患者不僅需要接受手術(shù)、放療、化療等綜合治療,還面臨胃腸道功能障礙引起的營養(yǎng)不良、腹瀉、便秘等不良反應(yīng),以及身體機能和自我調(diào)節(jié)等不良反應(yīng)。人工造口引起的圖像變化。這些問題顯著影響消化道癌患者的預(yù)后。

Caveolin-1 (CAV1) 是小窩的主要膜蛋白,是質(zhì)膜內(nèi)陷的支架蛋白。 CAV1是細(xì)胞膜凹腔的重要結(jié)構(gòu)成分,通過復(fù)雜的細(xì)胞信號通路調(diào)節(jié)細(xì)胞過程,并影響致瘤性。Caveolin-1基因家族的結(jié)構(gòu)和功能在不同物種中高度保守,表明其對維持細(xì)胞功能至關(guān)重要。CAV1 通過磷酸化/去磷酸化信號與各種信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子相互作用。它在膽固醇和脂質(zhì)轉(zhuǎn)運、膜轉(zhuǎn)運、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞粘附中起重要作用。此外,CAV1參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡、遷移、血管生成等多種信號通路的調(diào)控,與多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、侵襲和轉(zhuǎn)移有關(guān)。 CAV1 的致癌作用已在幾種腫瘤中得到證實,這表明 CAV1 是一種新的腫瘤治療靶點。多項研究探討了 CAV1 多態(tài)性與乳腺癌、食管癌、結(jié)直腸癌、胃癌、易感性之間的關(guān)系]肝細(xì)胞癌、和其他癌癥。然而,CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性和對消化道癌的易感性的結(jié)果仍然存在爭議。因此,進(jìn)行這項薈萃分析以驗證CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性對消化道癌易感性的貢獻(xiàn),為正確的臨床治療提供證據(jù)。

 

2.方法

由于消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的手稿是薈萃分析,因此不需要進(jìn)行倫理審查。該薈萃分析是按照系統(tǒng)評價和薈萃分析的先進(jìn)報告項目指南(PRISMA 聲明)進(jìn)行的。

2.1. 搜索策略和選擇標(biāo)準(zhǔn)

通過PubMed、EMBASE、Google Scholar、CNKI、萬方和VIP數(shù)據(jù)庫在線檢索CAV1(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌易感性相關(guān)的文獻(xiàn),檢索時間為2020年6月。檢索時使用以下術(shù)語有價值的文章:[(CAV1) 或 (Caveolin-1) 或 (caveolin)] 和 [rs7804372 OR T29107A] [多態(tài)性或基因型或突變或變體] 和 [口腔或食道或胃或肝細(xì)胞或結(jié)腸直腸]。人工審查檢索到的文章的參考文獻(xiàn)以識別其他合格的文章。
1.所有已發(fā)表的研究都必須探索 CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性與消化道癌之間的關(guān)聯(lián);
2.病例對照研究;
3.可以直接獲取或計算病例和對照中的基因型分布;
4.可以直接獲取全文。
薈萃分析根據(jù)以下標(biāo)準(zhǔn)排除了研究:
1.動物或細(xì)胞系研究;
2.系統(tǒng)回顧、薈萃分析和重復(fù)報告;
3.基因型數(shù)據(jù)分布不可用。
 

2.2. 數(shù)據(jù)提取

使用指定的數(shù)據(jù)提取表,兩名研究者獨立完成研究篩選、數(shù)據(jù)提取、整理,對有爭議的部分進(jìn)行討論和協(xié)商,賊終達(dá)成共識。數(shù)據(jù)提取主要包括先進(jìn)作者姓名、發(fā)表年份、樣本量、腫瘤分化程度、臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況。New Castle-Ottawa 量表用于評估每項研究的質(zhì)量。

2.3. 統(tǒng)計分析

Review Manager 5.3軟件用于分析CAV1基因多態(tài)性的五種遺傳模型,包括等位基因(T vs. A)、純合子(TT vs. AA)、雜合子(TA vs AA)、顯性(TT vs. TA + AA)和隱性比較模型(TT + TA與AA),其中TT是野生型等位基因的純合子,TA是雜合子,AA是突變等位基因的純合子。CAV1之間的比較(rs7804372) 多態(tài)性和消化道癌使用匯總優(yōu)勢比 (OR) 和 95% 置信區(qū)間 (CI) 表示。采用χ 2檢驗和I 2統(tǒng)計量判斷研究間是否存在異質(zhì)性;P >.10和I 2 ?<50%可以認(rèn)為研究結(jié)果之間不存在統(tǒng)計學(xué)異質(zhì)性,選擇固定效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)整合;P≤.10和I 2 ≥50%可以認(rèn)為研究結(jié)果之間存在統(tǒng)計學(xué)異質(zhì)性,采用隨機效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)整理。對照組的 Hardy-Weinberg 平衡使用 χ2評估測試,并比較對照組的預(yù)期和實際基因型頻率。在這項薈萃分析中,P值≤.05 被認(rèn)為具有統(tǒng)計學(xué)意義。

 

3. 結(jié)果

3.1 注冊研究的特征

根據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn),共納入病例對照研究6項,其中消化道腫瘤患者2477例,健康對照2477例?;颊逿基因位點陽性率為74.22%,健康對照組為68.21%(表???1和???2)。

表1:納入研究的主要特征

先進(jìn)作者

 

種族

 

癌癥類型

 

案例/對照

 

測試方法

 

張 2014

 

亞洲人

 

胃癌

 

412/412

 

光譜法

 

林 2014

 

亞洲人

 

胃癌

 

358/358

 

逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)

 

王 2014

 

亞洲人

 

食道癌

 

427/427

 

逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)

 

許 2013

 

亞洲人

 

肝細(xì)胞癌

 

298/298

 

逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)

 

鮑 2011

 

亞洲人

 

口腔癌

 

620/620

 

逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)

 

楊 2010

 

亞洲人

 

大腸癌

 

363/362

 

逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)

 

 

表 2:納入研究中對照和病例的等位基因頻率和基因型分布。

   

對照

病例

先進(jìn)作者

 

n

 

TT

 

AT

 

AA

 

T

 

A

 

TT

 

AT

 

AA

 

T

 

A

 

張 2014

 

824

 

210

 

136

 

66

 

556

 

268

 

239

 

134

 

39

 

612

 

212

 

林 2014

 

756

 

192

 

133

 

33

 

517

 

199

 

188

 

135

 

35

 

511

 

205

 

王 2014

 

854

 

221

 

166

 

40

 

608

 

246

 

259

 

143

 

25

 

661

 

193

 

許 2013

 

596

 

152

 

98

 

48

 

402

 

194

 

166

 

93

 

39

 

425

 

171

 

鮑 2011

 

1240

 

306

 

206

 

108

 

818

 

422

 

363

 

193

 

64

 

919

 

321

 

楊 2010

 

724

 

179

 

120

 

63

 

478

 

246

 

216

 

117

 

29

 

549

 

175

 

總計

 

4954

 

1260

 

859

 

358

 

3379

 

1575

 

1431

 

815

 

231

 

3677

 

1277

 

 

3.2. 異質(zhì)性檢驗

χ 2檢驗和I 2統(tǒng)計量用于評估納入研究的異質(zhì)性。結(jié)果表明,雜合比較模型(TA vs AA)和顯性比較模型( TT vs TA + AA)存在統(tǒng)計學(xué)異質(zhì)性,固定效應(yīng)模型用于評估這些比較的合并OR和95% CI。在等位基因( T vs A)、純合比較模型(TT vs AA)和隱性比較模型(TT + TA vs AA )中未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計異質(zhì)性),隨機效應(yīng)模型用于評估這些比較的合并 OR 和 95% CI。

3.3. 敏感性分析和發(fā)表偏倚

進(jìn)行敏感性分析,以評估每項研究對整體結(jié)果的影響,方法是逐個排除每項研究。結(jié)果表明,沒有獨立研究對匯總的 OR 產(chǎn)生顯著影響。漏斗圖用于評估發(fā)表偏倚。漏斗圖沒有顯示出任何明顯的不對稱性(圖???1)。

圖1:發(fā)表偏倚的漏斗圖。漏斗圖用于評估研究的發(fā)表偏倚。漏斗圖的形狀沒有顯示主導(dǎo)模型中顯著不對稱的任何證據(jù)。

3.4. CAV1(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌易感性的Meta分析

關(guān)于CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性與消化道癌之間關(guān)系的薈萃分析結(jié)果總結(jié)在(表???

(表3和圖2–6) 總體匯總結(jié)果顯示,等位基因 ( T vs A : OR 1.33, 95% CI: 1.15–1.53, P ?< .01)、純合子 ( TT vs AA : OR 1.72 ) 中CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性的風(fēng)險增加, 95% CI: 1.31–2.26, P ?< .01), 雜合子 ( TA vs AA : OR 1.47, 95% CI: 1.21–1.78, P ?< .01), 顯性 ( TT vs TA + AA : OR 1.32, 95 % CI:1.18–1.48,P ?< .01)和隱性比較模型(TT + TA vs AA: OR 1.61, 95% CI: 1.26–2.07, P ?< .01)。

表3:Cav-1 rs7804372基因多態(tài)性與消化系統(tǒng)腫瘤易感性的Meta分析

   

關(guān)聯(lián)測試

異質(zhì)性檢驗

基因型

 

n

 

OR (95%CI)

 

Z

 

P

 

χ 2

 

P

 

I2

 

T與A

 

9908

 

1.33

 

3.92

 

<.01

 

12.83

 

<.01

 

61%

 

TT 與 AA

 

3280

 

1.72

 

3.90

 

<.01

 

10.60

 

<.01

 

53%

 

助教與機管局

 

2263

 

1.47

 

3.92

 

<.01

 

5.75

 

.33

 

13%

 

TT 與 (TA+AA)

 

4954

 

1.32

 

4.87

 

<.01

 

6.80

 

.24

 

26%

 

(TT+TA) 與 AA

 

4954

 

1.61

 

3.81

 

<.01

 

9.33

 

.10

 

46%

 

 

圖 2:等位基因T與A基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示等位基因比較模型中消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( T vs A:優(yōu)勢比 1.33,95% 置信區(qū)間:1.15-1.53??,P ?< .01)觀察到納入的研究(I 2 ?= 61%,P ?= .03)。結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)多態(tài)性T等位基因攜帶者的風(fēng)險是A等位基因攜帶者的1.33倍。

圖 3:TT與AA基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示,純合比較模型中消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TT與AA:優(yōu)勢比 1.72,95% 置信區(qū)間:1.31-2.26,P ?< .01)。觀察到納入研究的異質(zhì)性(I 2 ?= 53%,P ?= .06)。結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)多態(tài)性TT基因型攜帶者的風(fēng)險是AA基因型攜帶者的1.72倍。

圖 4:TA 與 AA基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示,在雜合比較模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TA與AA:優(yōu)勢比 1.47,95% 置信區(qū)間:1.21–1.78,P ?< .01)。在納入的研究中未觀察到異質(zhì)性(I 2 ?= 13%,P ?= .33)。結(jié)果顯示,CAV1(rs7804372)多態(tài)性TA基因型攜帶者的風(fēng)險是AA基因型攜帶者的1.47倍。

圖 5:TT 與(TA + AA)基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示,在顯性比較模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TT vs TA + AA:優(yōu)勢比 1.32,95% 置信區(qū)間:1.18-1.48,P ?< .01)。觀察到納入研究的異質(zhì)性(I 2 ?= 26%,P ?= 0.24)。結(jié)果顯示,CAV1(rs7804372)多態(tài)性TT基因型攜帶者的風(fēng)險是(TA+AA)基因型攜帶者的1.31倍。

圖 6:( TT + TA ) 與AA基因型的森林圖。總體匯總結(jié)果顯示,在隱性比較模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TT + TA與AA:優(yōu)勢比 1.61,95% 置信區(qū)間:1.26–2.07,P ?< .01)。在納入的研究中未觀察到異質(zhì)性(I 2 ?= 46%,P ?= .10)。結(jié)果顯示,CAV1(rs7804372)多態(tài)性(TT + TA)基因型攜帶者的風(fēng)險比AA高1.61倍基因型攜帶者。
 

4 討論

CAV1 是構(gòu)成小窩蛋白的完整膜蛋白的關(guān)鍵成分之一。據(jù)報道,它與食道癌、前列腺癌、結(jié)腸癌、乳腺癌、膀胱癌、肺癌、等有關(guān), 可以促進(jìn)或抑制腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。

根據(jù)癌癥數(shù)據(jù)庫中BioMuta-單核苷酸變異的結(jié)果,已記錄了CAV1多態(tài)性的45個修飾殘基和2個修飾功能殘基,其中一些已被報道與消化道癌癥相關(guān)。

Yang等新穎報道了CAV1(rs7804372)多態(tài)性與結(jié)直腸癌的相關(guān)性。他們的結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)與結(jié)直腸癌的高易感性相關(guān),與吸煙狀況對結(jié)直腸癌易感性有共同影響,CAV1 (rs7804372)多態(tài)性的A等位基因可能作為早期診斷的潛在生物標(biāo)志物,預(yù)測和癌癥治療的目標(biāo)。Zhang等報道了CAV1(rs7804372)多態(tài)性與胃癌的相關(guān)性,他們的結(jié)果表明CAV1(rs7804372) 多態(tài)性增加了胃癌的易感性和風(fēng)險。接受CAV1 (rs7804372) TT單倍型的患者比具有AT或AA單倍型的患者具有更高的胃癌風(fēng)險和易感性。Bau等報道CAV1(rs7804372)與口腔癌有關(guān),CAV1的A等位基因(rs7804372)對預(yù)防癌癥的發(fā)生起保護(hù)作用,T等位基因可能是一個危險因素。CAV1 (rs7804372)的TT基因型可能與口腔癌的風(fēng)險有關(guān)。此外,王等對于食道癌也得出了同樣的結(jié)論。雖然得到了不同的結(jié)論,但林等人。報道??CAV1(rs7804372)多態(tài)性與胃癌易感性之間沒有相關(guān)性。Hsu 等人在臺灣人群中評估了CAV1基因的六個單核苷酸多態(tài)性與肝細(xì)胞癌風(fēng)險之間的關(guān)系。未觀察到rs7804372多態(tài)性與肝細(xì)胞癌之間存在顯著關(guān)聯(lián)。由于CAV1之間的結(jié)果不一致(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌易感性,消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊團(tuán)隊全面檢索了所有已發(fā)表的關(guān)于消化道癌CAV1(rs7804372)多態(tài)性的研究,并進(jìn)行了薈萃分析,以獲得它們之間的綜合相關(guān)性。

在消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的研究中,賊終納入了六項研究。為了更詳細(xì)地概述CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性與消化道癌之間的關(guān)系,使用了五種遺傳模型。消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的研究結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌的風(fēng)險有關(guān),并影響消化道癌的易感性。CAV1 (rs7804372)的T等位基因、TT基因型和TA會增加患消化道癌的風(fēng)險。這意味著CAV1(rs7804372)多態(tài)性可以被視為消化道癌早期診斷、發(fā)展和預(yù)后預(yù)測的潛在生物標(biāo)志物。

由于CAV1(rs7804372)基因多態(tài)性與消化系統(tǒng)腫瘤關(guān)系的研究報道較少,數(shù)據(jù)庫檢索和數(shù)據(jù)收集的局限性, CAV1(rs7804372)基因多態(tài)性與年齡、性別、臨床病理特征的關(guān)系沒有進(jìn)行分析。需要更大樣本的進(jìn)一步研究來確認(rèn)CAV1(rs7804372)基因多態(tài)性與消化系統(tǒng)腫瘤之間的關(guān)系。

總之,消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊證實CAV1 (rs7804372) 可以作為消化道癌的有價值的遺傳易感性標(biāo)志物。CAV1(rs7804372)等位基因T的存在比等位基因A的存在消化道癌的風(fēng)險更高。靶向等位基因A對于消化道癌癥的早期診斷、預(yù)后預(yù)測和治療具有潛在價值。


 

CAV1 rs7804372 (T29107A) polymorphism might be a potential risk for digestive cancers: A protocol for systematic review and meta analysis.

Chen P, Zhang YL, Xue B, Wang JR.

Medicine (Baltimore). 2021 Jun 18;100(24):e26186. doi: 10.1097/MD.0000000000026186.

PMID: 34128850 

 

 

 

(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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