【佳學(xué)基因檢測】基因檢測CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性顯示消化道癌的潛在風(fēng)險
消化系統(tǒng)腫瘤風(fēng)險基因檢測導(dǎo)讀:
背景:
Caveolin-1 (CAV1) 是caveolae 的重要結(jié)構(gòu)成分,通過復(fù)雜的細(xì)胞信號通路調(diào)節(jié)細(xì)胞過程,并影響致瘤性。然而,CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性在消化道癌癥中的作用仍然沒有定論。進(jìn)行meta分析評估CAV1多態(tài)性對消化道癌易感性的影響,為正確治療提供依據(jù)。
方法:
使用PubMed、EMBASE、Google Scholar和CNKI的數(shù)據(jù)庫檢索截至2020年6月已發(fā)表的關(guān)于CAV1(rs7804372)多態(tài)性和消化道癌易感性的研究。兩名研究人員分別進(jìn)行了研究篩選、數(shù)據(jù)提取和方法學(xué)質(zhì)量評估。納入和排除標(biāo)準(zhǔn)。使用 Review Manager 5.3 軟件進(jìn)行薈萃分析。
結(jié)果:
納入了 6 項病例對照研究,包括 2477 名消化道癌癥患者和 2477 名健康對照。匯總結(jié)果顯示,CAV1 rs7804372(T29107A)多態(tài)性增加了該等位基因發(fā)生消化道癌的風(fēng)險(T vs. A:優(yōu)勢比(OR)1.33,95%置信區(qū)間(CI):1.15-1.53??,P ?< . 01), 純合子 ( TT vs. AA : OR 1.72, 95% CI: 1.31–2.26, P ?< .01), 雜合子 ( TA vs. AA : OR 1.47, 95% CI: 1.21–1.78, P ?< .01) , 顯性 ( TT vs. TA + AA: OR 1.32, 95% CI: 1.18–1.48, P ?< .01) 和隱性比較模型 ( TT + TA vs. AA : OR 1.61, 95% CI: 1.26–2.07, P ?< .01)。
結(jié)論:
消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的研究結(jié)果表明,CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性可能會改變消化道癌的發(fā)生,并且CAV1 (rs7804372) 的T等位基因或TT基因型的存在可能會增加消化道癌的風(fēng)險。
關(guān)鍵詞: CAV1,消化道癌,薈萃分析,多態(tài)性
1.簡介
隨著全球老齡化和不健康生活方式的發(fā)展,惡性腫瘤的發(fā)病率逐年增加。在全球范圍內(nèi),消化系統(tǒng)惡性腫瘤的發(fā)病率位居癌癥發(fā)病率前列。消化系統(tǒng)癌癥,特別是食管癌、胃癌、結(jié)直腸癌和肝細(xì)胞癌,是全球關(guān)鍵的流行病學(xué)健康問題。與其他癌癥相比,消化道癌患者不僅需要接受手術(shù)、放療、化療等綜合治療,還面臨胃腸道功能障礙引起的營養(yǎng)不良、腹瀉、便秘等不良反應(yīng),以及身體機能和自我調(diào)節(jié)等不良反應(yīng)。人工造口引起的圖像變化。這些問題顯著影響消化道癌患者的預(yù)后。
Caveolin-1 (CAV1) 是小窩的主要膜蛋白,是質(zhì)膜內(nèi)陷的支架蛋白。 CAV1是細(xì)胞膜凹腔的重要結(jié)構(gòu)成分,通過復(fù)雜的細(xì)胞信號通路調(diào)節(jié)細(xì)胞過程,并影響致瘤性。Caveolin-1基因家族的結(jié)構(gòu)和功能在不同物種中高度保守,表明其對維持細(xì)胞功能至關(guān)重要。CAV1 通過磷酸化/去磷酸化信號與各種信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子相互作用。它在膽固醇和脂質(zhì)轉(zhuǎn)運、膜轉(zhuǎn)運、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞粘附中起重要作用。此外,CAV1參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡、遷移、血管生成等多種信號通路的調(diào)控,與多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、侵襲和轉(zhuǎn)移有關(guān)。 CAV1 的致癌作用已在幾種腫瘤中得到證實,這表明 CAV1 是一種新的腫瘤治療靶點。多項研究探討了 CAV1 多態(tài)性與乳腺癌、食管癌、結(jié)直腸癌、胃癌、易感性之間的關(guān)系]肝細(xì)胞癌、和其他癌癥。然而,CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性和對消化道癌的易感性的結(jié)果仍然存在爭議。因此,進(jìn)行這項薈萃分析以驗證CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性對消化道癌易感性的貢獻(xiàn),為正確的臨床治療提供證據(jù)。
2.方法
由于消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的手稿是薈萃分析,因此不需要進(jìn)行倫理審查。該薈萃分析是按照系統(tǒng)評價和薈萃分析的先進(jìn)報告項目指南(PRISMA 聲明)進(jìn)行的。
2.1. 搜索策略和選擇標(biāo)準(zhǔn)
通過PubMed、EMBASE、Google Scholar、CNKI、萬方和VIP數(shù)據(jù)庫在線檢索CAV1(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌易感性相關(guān)的文獻(xiàn),檢索時間為2020年6月。檢索時使用以下術(shù)語有價值的文章:[(CAV1) 或 (Caveolin-1) 或 (caveolin)] 和 [rs7804372 OR T29107A] [多態(tài)性或基因型或突變或變體] 和 [口腔或食道或胃或肝細(xì)胞或結(jié)腸直腸]。人工審查檢索到的文章的參考文獻(xiàn)以識別其他合格的文章。
1.所有已發(fā)表的研究都必須探索 CAV1 rs7804372 (T29107A) 多態(tài)性與消化道癌之間的關(guān)聯(lián);
2.病例對照研究;
3.可以直接獲取或計算病例和對照中的基因型分布;
4.可以直接獲取全文。
薈萃分析根據(jù)以下標(biāo)準(zhǔn)排除了研究:
1.動物或細(xì)胞系研究;
2.系統(tǒng)回顧、薈萃分析和重復(fù)報告;
3.基因型數(shù)據(jù)分布不可用。
2.2. 數(shù)據(jù)提取
使用指定的數(shù)據(jù)提取表,兩名研究者獨立完成研究篩選、數(shù)據(jù)提取、整理,對有爭議的部分進(jìn)行討論和協(xié)商,賊終達(dá)成共識。數(shù)據(jù)提取主要包括先進(jìn)作者姓名、發(fā)表年份、樣本量、腫瘤分化程度、臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況。New Castle-Ottawa 量表用于評估每項研究的質(zhì)量。
2.3. 統(tǒng)計分析
Review Manager 5.3軟件用于分析CAV1基因多態(tài)性的五種遺傳模型,包括等位基因(T vs. A)、純合子(TT vs. AA)、雜合子(TA vs AA)、顯性(TT vs. TA + AA)和隱性比較模型(TT + TA與AA),其中TT是野生型等位基因的純合子,TA是雜合子,AA是突變等位基因的純合子。CAV1之間的比較(rs7804372) 多態(tài)性和消化道癌使用匯總優(yōu)勢比 (OR) 和 95% 置信區(qū)間 (CI) 表示。采用χ 2檢驗和I 2統(tǒng)計量判斷研究間是否存在異質(zhì)性;P >.10和I 2 ?<50%可以認(rèn)為研究結(jié)果之間不存在統(tǒng)計學(xué)異質(zhì)性,選擇固定效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)整合;P≤.10和I 2 ≥50%可以認(rèn)為研究結(jié)果之間存在統(tǒng)計學(xué)異質(zhì)性,采用隨機效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)整理。對照組的 Hardy-Weinberg 平衡使用 χ2評估測試,并比較對照組的預(yù)期和實際基因型頻率。在這項薈萃分析中,P值≤.05 被認(rèn)為具有統(tǒng)計學(xué)意義。
3. 結(jié)果
3.1 注冊研究的特征
根據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn),共納入病例對照研究6項,其中消化道腫瘤患者2477例,健康對照2477例?;颊逿基因位點陽性率為74.22%,健康對照組為68.21%(表???1和???2)。
表1:納入研究的主要特征
先進(jìn)作者
|
種族
|
癌癥類型
|
案例/對照
|
測試方法
|
張 2014
|
亞洲人
|
胃癌
|
412/412
|
光譜法
|
林 2014
|
亞洲人
|
胃癌
|
358/358
|
逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)
|
王 2014
|
亞洲人
|
食道癌
|
427/427
|
逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)
|
許 2013
|
亞洲人
|
肝細(xì)胞癌
|
298/298
|
逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)
|
鮑 2011
|
亞洲人
|
口腔癌
|
620/620
|
逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)
|
楊 2010
|
亞洲人
|
大腸癌
|
363/362
|
逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)
|
表 2:納入研究中對照和病例的等位基因頻率和基因型分布。
對照 |
病例 |
||||||||||
先進(jìn)作者
|
n
|
TT
|
AT
|
AA
|
T
|
A
|
TT
|
AT
|
AA
|
T
|
A
|
張 2014
|
824
|
210
|
136
|
66
|
556
|
268
|
239
|
134
|
39
|
612
|
212
|
林 2014
|
756
|
192
|
133
|
33
|
517
|
199
|
188
|
135
|
35
|
511
|
205
|
王 2014
|
854
|
221
|
166
|
40
|
608
|
246
|
259
|
143
|
25
|
661
|
193
|
許 2013
|
596
|
152
|
98
|
48
|
402
|
194
|
166
|
93
|
39
|
425
|
171
|
鮑 2011
|
1240
|
306
|
206
|
108
|
818
|
422
|
363
|
193
|
64
|
919
|
321
|
楊 2010
|
724
|
179
|
120
|
63
|
478
|
246
|
216
|
117
|
29
|
549
|
175
|
總計
|
4954
|
1260
|
859
|
358
|
3379
|
1575
|
1431
|
815
|
231
|
3677
|
1277
|
3.2. 異質(zhì)性檢驗
χ 2檢驗和I 2統(tǒng)計量用于評估納入研究的異質(zhì)性。結(jié)果表明,雜合比較模型(TA vs AA)和顯性比較模型( TT vs TA + AA)存在統(tǒng)計學(xué)異質(zhì)性,固定效應(yīng)模型用于評估這些比較的合并OR和95% CI。在等位基因( T vs A)、純合比較模型(TT vs AA)和隱性比較模型(TT + TA vs AA )中未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計異質(zhì)性),隨機效應(yīng)模型用于評估這些比較的合并 OR 和 95% CI。
3.3. 敏感性分析和發(fā)表偏倚
進(jìn)行敏感性分析,以評估每項研究對整體結(jié)果的影響,方法是逐個排除每項研究。結(jié)果表明,沒有獨立研究對匯總的 OR 產(chǎn)生顯著影響。漏斗圖用于評估發(fā)表偏倚。漏斗圖沒有顯示出任何明顯的不對稱性(圖???1)。
圖1:發(fā)表偏倚的漏斗圖。漏斗圖用于評估研究的發(fā)表偏倚。漏斗圖的形狀沒有顯示主導(dǎo)模型中顯著不對稱的任何證據(jù)。
3.4. CAV1(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌易感性的Meta分析
關(guān)于CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性與消化道癌之間關(guān)系的薈萃分析結(jié)果總結(jié)在(表???
(表3和圖2–6) 總體匯總結(jié)果顯示,等位基因 ( T vs A : OR 1.33, 95% CI: 1.15–1.53, P ?< .01)、純合子 ( TT vs AA : OR 1.72 ) 中CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性的風(fēng)險增加, 95% CI: 1.31–2.26, P ?< .01), 雜合子 ( TA vs AA : OR 1.47, 95% CI: 1.21–1.78, P ?< .01), 顯性 ( TT vs TA + AA : OR 1.32, 95 % CI:1.18–1.48,P ?< .01)和隱性比較模型(TT + TA vs AA: OR 1.61, 95% CI: 1.26–2.07, P ?< .01)。
表3:Cav-1 rs7804372基因多態(tài)性與消化系統(tǒng)腫瘤易感性的Meta分析
關(guān)聯(lián)測試 |
異質(zhì)性檢驗 |
||||||
基因型
|
n
|
OR (95%CI)
|
Z
|
P
|
χ 2
|
P
|
I2
|
T與A
|
9908
|
1.33
|
3.92
|
<.01
|
12.83
|
<.01
|
61%
|
TT 與 AA
|
3280
|
1.72
|
3.90
|
<.01
|
10.60
|
<.01
|
53%
|
助教與機管局
|
2263
|
1.47
|
3.92
|
<.01
|
5.75
|
.33
|
13%
|
TT 與 (TA+AA)
|
4954
|
1.32
|
4.87
|
<.01
|
6.80
|
.24
|
26%
|
(TT+TA) 與 AA
|
4954
|
1.61
|
3.81
|
<.01
|
9.33
|
.10
|
46%
|
圖 2:等位基因T與A基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示等位基因比較模型中消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( T vs A:優(yōu)勢比 1.33,95% 置信區(qū)間:1.15-1.53??,P ?< .01)觀察到納入的研究(I 2 ?= 61%,P ?= .03)。結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)多態(tài)性T等位基因攜帶者的風(fēng)險是A等位基因攜帶者的1.33倍。
圖 3:TT與AA基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示,純合比較模型中消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TT與AA:優(yōu)勢比 1.72,95% 置信區(qū)間:1.31-2.26,P ?< .01)。觀察到納入研究的異質(zhì)性(I 2 ?= 53%,P ?= .06)。結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)多態(tài)性TT基因型攜帶者的風(fēng)險是AA基因型攜帶者的1.72倍。
圖 4:TA 與 AA基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示,在雜合比較模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TA與AA:優(yōu)勢比 1.47,95% 置信區(qū)間:1.21–1.78,P ?< .01)。在納入的研究中未觀察到異質(zhì)性(I 2 ?= 13%,P ?= .33)。結(jié)果顯示,CAV1(rs7804372)多態(tài)性TA基因型攜帶者的風(fēng)險是AA基因型攜帶者的1.47倍。
圖 5:TT 與(TA + AA)基因型的森林圖??傮w匯總結(jié)果顯示,在顯性比較模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TT vs TA + AA:優(yōu)勢比 1.32,95% 置信區(qū)間:1.18-1.48,P ?< .01)。觀察到納入研究的異質(zhì)性(I 2 ?= 26%,P ?= 0.24)。結(jié)果顯示,CAV1(rs7804372)多態(tài)性TT基因型攜帶者的風(fēng)險是(TA+AA)基因型攜帶者的1.31倍。
圖 6:( TT + TA ) 與AA基因型的森林圖。總體匯總結(jié)果顯示,在隱性比較模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性風(fēng)險增加( TT + TA與AA:優(yōu)勢比 1.61,95% 置信區(qū)間:1.26–2.07,P ?< .01)。在納入的研究中未觀察到異質(zhì)性(I 2 ?= 46%,P ?= .10)。結(jié)果顯示,CAV1(rs7804372)多態(tài)性(TT + TA)基因型攜帶者的風(fēng)險比AA高1.61倍基因型攜帶者。
4 討論
CAV1 是構(gòu)成小窩蛋白的完整膜蛋白的關(guān)鍵成分之一。據(jù)報道,它與食道癌、前列腺癌、結(jié)腸癌、乳腺癌、膀胱癌、肺癌、等有關(guān), 可以促進(jìn)或抑制腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。
根據(jù)癌癥數(shù)據(jù)庫中BioMuta-單核苷酸變異的結(jié)果,已記錄了CAV1多態(tài)性的45個修飾殘基和2個修飾功能殘基,其中一些已被報道與消化道癌癥相關(guān)。
Yang等新穎報道了CAV1(rs7804372)多態(tài)性與結(jié)直腸癌的相關(guān)性。他們的結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)與結(jié)直腸癌的高易感性相關(guān),與吸煙狀況對結(jié)直腸癌易感性有共同影響,CAV1 (rs7804372)多態(tài)性的A等位基因可能作為早期診斷的潛在生物標(biāo)志物,預(yù)測和癌癥治療的目標(biāo)。Zhang等報道了CAV1(rs7804372)多態(tài)性與胃癌的相關(guān)性,他們的結(jié)果表明CAV1(rs7804372) 多態(tài)性增加了胃癌的易感性和風(fēng)險。接受CAV1 (rs7804372) TT單倍型的患者比具有AT或AA單倍型的患者具有更高的胃癌風(fēng)險和易感性。Bau等報道CAV1(rs7804372)與口腔癌有關(guān),CAV1的A等位基因(rs7804372)對預(yù)防癌癥的發(fā)生起保護(hù)作用,T等位基因可能是一個危險因素。CAV1 (rs7804372)的TT基因型可能與口腔癌的風(fēng)險有關(guān)。此外,王等對于食道癌也得出了同樣的結(jié)論。雖然得到了不同的結(jié)論,但林等人。報道??CAV1(rs7804372)多態(tài)性與胃癌易感性之間沒有相關(guān)性。Hsu 等人在臺灣人群中評估了CAV1基因的六個單核苷酸多態(tài)性與肝細(xì)胞癌風(fēng)險之間的關(guān)系。未觀察到rs7804372多態(tài)性與肝細(xì)胞癌之間存在顯著關(guān)聯(lián)。由于CAV1之間的結(jié)果不一致(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌易感性,消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊團(tuán)隊全面檢索了所有已發(fā)表的關(guān)于消化道癌CAV1(rs7804372)多態(tài)性的研究,并進(jìn)行了薈萃分析,以獲得它們之間的綜合相關(guān)性。
在消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的研究中,賊終納入了六項研究。為了更詳細(xì)地概述CAV1 (rs7804372) 多態(tài)性與消化道癌之間的關(guān)系,使用了五種遺傳模型。消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊的研究結(jié)果表明,CAV1(rs7804372)多態(tài)性與消化道癌的風(fēng)險有關(guān),并影響消化道癌的易感性。CAV1 (rs7804372)的T等位基因、TT基因型和TA會增加患消化道癌的風(fēng)險。這意味著CAV1(rs7804372)多態(tài)性可以被視為消化道癌早期診斷、發(fā)展和預(yù)后預(yù)測的潛在生物標(biāo)志物。
由于CAV1(rs7804372)基因多態(tài)性與消化系統(tǒng)腫瘤關(guān)系的研究報道較少,數(shù)據(jù)庫檢索和數(shù)據(jù)收集的局限性, CAV1(rs7804372)基因多態(tài)性與年齡、性別、臨床病理特征的關(guān)系沒有進(jìn)行分析。需要更大樣本的進(jìn)一步研究來確認(rèn)CAV1(rs7804372)基因多態(tài)性與消化系統(tǒng)腫瘤之間的關(guān)系。
總之,消化道腫瘤風(fēng)險基因檢測持續(xù)改進(jìn)團(tuán)隊證實CAV1 (rs7804372) 可以作為消化道癌的有價值的遺傳易感性標(biāo)志物。CAV1(rs7804372)等位基因T的存在比等位基因A的存在消化道癌的風(fēng)險更高。靶向等位基因A對于消化道癌癥的早期診斷、預(yù)后預(yù)測和治療具有潛在價值。
Chen P, Zhang YL, Xue B, Wang JR.
Medicine (Baltimore). 2021 Jun 18;100(24):e26186. doi: 10.1097/MD.0000000000026186.
PMID: 34128850
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)