【佳學基因檢測】抑郁癥基因解碼、基因檢測
遺傳病、罕見病基因檢測導讀
抑郁癥基因檢測是對英文疾病名稱為Depression的疾病所從事的基于基因序列變化檢測分析的現(xiàn)代臨床醫(yī)學檢測方法。 抑郁癥的英文表達方法還包括:Clinical depression、Depressive disorder、Major depression、Major depressive disorder、MDD、Unipolar depression。 因此,抑郁癥基因檢測又叫做臨床抑郁癥基因篩查、憂郁癥基因分析、重度抑郁癥基因診斷、重度抑郁病基因測試、MDD致病基因鑒定基因解碼、單相抑郁癥的發(fā)病原因分析。
什么樣的人應(yīng)當做抑郁癥基因檢測?
抑郁癥(也稱為重度抑郁癥或重度抑郁病)是一種影響情緒、行為和整體健康的精神疾病。 它會導致長時間的悲傷、空虛或絕望感,并對曾經(jīng)喜歡的活動失去興趣。 抑郁癥患者還可能出現(xiàn)食欲變化(導致暴飲暴食或進食不足)、睡眠模式變化(睡得太多或睡不著)、精力不足和注意力難以集中。 雖然抑郁癥主要被認為是一種心理健康障礙,但它也可能具有身體特征,包括頭痛、其他無法解釋的疼痛、異常緩慢或快速的運動以及消化問題。 要被診斷患有抑郁癥,一個人必須幾乎每天都有體征和癥狀至少 2 周。 但是,這種情況的特征差異很大。
抑郁癥最常見于青春期晚期或成年早期,但它可以出現(xiàn)在任何年齡。 如果不治療,抑郁癥發(fā)作可持續(xù)數(shù)周、數(shù)月或數(shù)年,并且可能會消失并再次出現(xiàn)(反復)。 受影響的人可能難以在日常生活中發(fā)揮作用,包括在學?;蚬ぷ髦?。 與一般人群相比,抑郁癥患者出現(xiàn)藥物濫用問題和死于自殺的風險更高。
一些健康狀況與抑郁癥密切相關(guān)或以抑郁癥為特征。 這些包括心境惡劣(具有與抑郁癥相似但不那么嚴重的長期體征和癥狀)、圍產(chǎn)期或產(chǎn)后抑郁癥(發(fā)生在孩子出生前后或之后)、季節(jié)性情感障礙( 由季節(jié)變化引發(fā))、雙相情感障礙(可能包括“高潮”或躁狂發(fā)作和抑郁發(fā)作)和廣泛性焦慮癥。 在患有分裂情感障礙的人中,抑郁癥或其他情緒障礙與精神分裂癥(一種影響人的思維、自我意識和知覺的大腦障礙)的特征一起發(fā)生。
抑郁癥致病基因鑒定基因解碼:基因檢測的科學依據(jù)
根據(jù)《神經(jīng)系統(tǒng)疾病流行疾病分析》,抑郁癥會在家族中遺傳,這表明遺傳因素會增加患上這種疾病的風險。 佳學基因是早期進行抑郁癥的遺傳學研究的機構(gòu),對該病的遺傳基礎(chǔ)做了多范圍、多角度的分析。對抑郁癥的致病基因鑒定基因解碼研究表明,許多基因的變異,每一個都有很小的影響,結(jié)合起來會增加患抑郁癥的風險。
由于多種原因,確定抑郁癥的遺傳風險因素具有一定的困難。 目前被認為是一種稱為“抑郁癥”的單一疾病,實際上可能是具有相似體征和癥狀的多種疾病; 這些疾病可能有不同的遺傳風險因素。 與抑郁癥相關(guān)的遺傳變異在男性和女性之間也可能有所不同。 研究人員懷疑,需要對更多人進行研究才能確定影響抑郁癥風險的遺傳變異。
被認為與抑郁癥有關(guān)的基因在大腦中具有多種功能。 其中一些基因可能控制稱為神經(jīng)遞質(zhì)的化學物質(zhì)的產(chǎn)生(合成)、運輸和活性,神經(jīng)遞質(zhì)傳遞允許神經(jīng)細胞(神經(jīng)元)相互交流的化學信號。 其他可能影響抑郁癥風險的基因涉及神經(jīng)元的生長、成熟和維持,以及神經(jīng)元之間的連接(突觸)隨時間變化和適應(yīng)經(jīng)驗的能力,這一特征被稱為 突觸可塑性。
非遺傳(環(huán)境)因素在一個人患抑郁癥的風險中也起著關(guān)鍵作用。 這種障礙可能由藥物濫用、某些藥物或壓力大的生活事件(如離婚或親人去世)引發(fā)。 其他風險因素包括人際關(guān)系困難或社會孤立、失業(yè)、財務(wù)問題以及童年虐待或忽視。 一些身體疾病,如癌癥、甲狀腺疾病和慢性疼痛,也與患抑郁癥的風險增加有關(guān)。 環(huán)境條件很可能與遺傳因素相互作用,以確定患這種疾病的總體風險。
抑郁癥基因檢測的大數(shù)據(jù)分析
抑郁癥是中國最常見的精神疾病之一。 超過近一億人受到影響,即有成年人又有青少年。2016 年,6.7% 的成年人和 12.8% 的青少年報告至少有過一次抑郁癥發(fā)作。
抑郁癥在女性中的發(fā)病率大約是男性的兩倍,這可能部分與荷爾蒙因素有關(guān)。
抑郁癥的發(fā)生與性別的關(guān)系
抑郁癥的患病率和臨床特征在女性和男性之間存在差異; 然而,這揭示遺傳對抑郁癥性別差異的是有影響的。 為了評估抑郁癥遺傳結(jié)構(gòu)中的性別特異性差異,抑郁癥基因檢測課題組對 1000 名抑郁癥患者(70.7% 為女性)的樣本進行了全外顯子組測序。 包括來自沒有精神疾病的健康個體(n = 72,26.4% 女性)和東亞亞群 1000 基因組計劃數(shù)據(jù)(n =〉207,50.7% 女性)的對照數(shù)據(jù)。 使用定性和定量研究設(shè)計直接比較男性和女性之間的遺傳變異。 定性分析確定了五個可能與女性抑郁癥風險增加相關(guān)的遺傳標記,包括定位在染色體 19p13.2 的三個基因突變序列(PDE4A 中的 rs201432982 和 FDX1L 中的 rs62640397 和 rs79442975)和 MYO15B 中的兩個新的基因突變(rs820182 和 rs820148) 染色體 17p25.1 位點。 與非純合子(即非相關(guān)等位基因的雜合子和純合子)相比,這些變異純合子的抑郁癥患者表現(xiàn)出更嚴重的抑郁癥狀和更高的自殺傾向。 定量分析表明,即使經(jīng)過排列測試,男性的蛋白質(zhì)截斷和有害變異的遺傳負擔也高于女性。 佳學基因解碼的研究提供了新的遺傳證據(jù),表明女性抑郁癥患病率較高可能歸因于遺傳變異。
目前使用全外顯子基因測序(WES)數(shù)據(jù)進行的基因研究的主要發(fā)現(xiàn)是 PDE4A、FDX1L 和 MYO15B 基因中的五個變異與女性患抑郁癥的風險增加有關(guān),這些變異的純合子抑郁癥患者更有可能出現(xiàn)嚴重的抑郁癥狀 ,并且男性患抑郁癥需要更高的遺傳負擔,特別是蛋白質(zhì)截斷和有害變異,這可能有助于男性個體對抗抑郁癥的恢復力更高。 總的來說,這些發(fā)現(xiàn)為女性在抑郁癥中占優(yōu)勢的遺傳因素提供了證據(jù)。
佳學基因發(fā)現(xiàn)基因解碼的研究報告了患有抑郁癥的男性和女性之間明顯不同的轉(zhuǎn)錄模式。 為了檢查女性抑郁癥患病率的增加是否與遺傳異質(zhì)性或責任相關(guān)的性別特異性分子特征相關(guān),基因解碼應(yīng)用了一種具有多種優(yōu)勢的獨特分析策略,該策略使用來自韓國的 WES 數(shù)據(jù)直接比較了男性和女性之間的遺傳變異抑郁癥患者。 這種大規(guī)模的 WES 分析確定了具有臨床意義的常見和罕見編碼基因突變,并使用單變體和基因水平關(guān)聯(lián)測試來調(diào)查支持遺傳性別差異的證據(jù)。 此外,直接比較性別的策略對于理解與抑郁癥相關(guān)的性別相關(guān)遺傳差異具有直觀意義。 該策略還減少了使用兩個不同數(shù)據(jù)集(例如,內(nèi)部和公開可用數(shù)據(jù))引入的系統(tǒng)偏差,這些數(shù)據(jù)集是使用不同的數(shù)據(jù)處理流程生成的。 在基因解碼研究中,使用 1KGP 數(shù)據(jù)作為對照組的方法是可行的,因為性別相關(guān)的遺傳差異是在病例和對照受試者之間進行比較,而不是在病例和對照之間進行比較。 此外,基因解碼研究使用了來自 1000 個東亞抑郁癥樣本的 WES 數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)與來自結(jié)構(gòu)化診斷訪談和經(jīng)過充分驗證的測量的高度精選的臨床數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)。 由于大部分關(guān)于抑郁癥的可用資源都是根據(jù)主要從歐洲血統(tǒng)的個人收集的信息開發(fā)的,佳學基因采信的數(shù)據(jù)將有助于減少因非歐洲人口代表性不足而產(chǎn)生的普遍性偏差。
抑郁癥的性別特異性遺傳異質(zhì)性
根據(jù)抑郁癥基因解碼定性分析,在 PDE4A、FDX1L 和 MYO15B 中發(fā)現(xiàn)了五種變異,這些變異與女性患抑郁癥的風險增加有關(guān),而對照組的性別之間沒有顯著差異。 這些變異純合的患者患有更嚴重的抑郁癥狀和更高的自殺率,這表明這五種變異具有臨床意義,因為具有更多變異等位基因的患者經(jīng)歷了更嚴重的抑郁癥狀。 這些發(fā)現(xiàn)與之前的研究一致,這些研究報告了嚴重形式的抑郁癥患者的遺傳易感性增加。
定性分析未發(fā)現(xiàn)男性特異性風險變異。 與這些發(fā)現(xiàn)一致,先前的遺傳研究報告了與抑郁癥相關(guān)的女性特異性遺傳因素多于男性特異性遺傳因素。 這可能是由于性別樣本人群的規(guī)模不平衡(70.7% 的女性對 29.3% 的男性),盡管這反映了女性在抑郁癥中占優(yōu)勢的流行病學發(fā)現(xiàn)。 此外,假設(shè)男性在遺傳上易患抑郁癥,這可能導致之前的研究中缺乏對男性特異性變異的鑒定,因為需要大的遺傳負擔,而不是低影響的單一變異男性抑郁癥的發(fā)展。
有趣的是,抑郁癥風險致病基因研究中發(fā)現(xiàn)的五個變體中的三個被基因解碼定位到染色體 19p13.2,這與導致神經(jīng)發(fā)育綜合征(包括智力障礙或自閉癥譜系障礙)的微缺失障礙有關(guān)。 該區(qū)域的改變變異也與身體疾病有關(guān),包括自身免疫(系統(tǒng)性紅斑狼瘡)、內(nèi)分泌(多囊卵巢綜合征)和精神疾病,如恐慌癥和精神分裂癥。 這些病癥與抑郁癥的共病率很高并且在女性中患病率最高,但精神分裂癥除外,根據(jù)性別,精神分裂癥被認為具有不同的臨床過程。 先前對反復性早發(fā)性重度抑郁癥的家族研究表明,染色體 19p13 上的基因與 CREB1 相互作用會增加患抑郁癥的風險。 基于這些先前的發(fā)現(xiàn),染色體 19p13.2 上的變異是性別特異性抑郁癥風險增加的良好候選基因存在區(qū)域。
PDE4A 是 cAMP 第二信使信號轉(zhuǎn)導的主要調(diào)節(jié)因子,鑒于其在調(diào)節(jié)記憶和情緒的大腦區(qū)域(例如前額葉皮層、海馬體和杏仁核)中的廣泛表達,它被認為是抑郁癥的潛在靶點。 此外,焦慮行為和情緒記憶受損與 PDE4A 缺陷小鼠的尿皮質(zhì)酮增加有關(guān),而長期服用抗抑郁藥會增加 PDE4A 的表達。 因此,該基因可能與受抗抑郁藥影響的突觸可塑性有關(guān),PDE4A 的變異可能會減少神經(jīng)元放電并通過下丘腦-垂體-腎上腺軸調(diào)節(jié)負反饋,從而使個體易患抑郁癥。 PDE4A 關(guān)聯(lián)的女性特異性性質(zhì)與先前關(guān)于卵巢中高水平 PDE4 酶表達及其在調(diào)節(jié)類固醇生成和炎癥反應(yīng)中的作用的發(fā)現(xiàn)一致。 FDX1L(也稱為 FDX2)可導致線粒體肌病和/或神經(jīng)系統(tǒng)癥狀; 然而,之前的研究沒有發(fā)現(xiàn)這一因素與抑郁癥的關(guān)聯(lián)。 然而,F(xiàn)DX1L 中的兩個變體位于核糖核蛋白 PTB 結(jié)合 1 (RAVER1) 的下游,盡管可能對 1 型錯誤有其他解釋,但與另一個重要基因處于 LD 中或?qū)虻墓δ苡刑囟ㄗ饔?,這被確定為與抑郁癥有關(guān)。 FDX2 和/或 RAVER1 中的變異參與線粒體功能障礙,這可能通過導致氧化應(yīng)激和細胞凋亡加速、相關(guān)神經(jīng)遞質(zhì)釋放,從而增加應(yīng)激激素水平,從而導致抑郁癥的發(fā)病機制,特別是以性別特異性方式。 關(guān)于定位到染色體 17q25.1 的 MYO15B 的作用佳學基因服有一定的研究; 然而,據(jù)報道,該區(qū)域與白質(zhì)高信號之間的關(guān)系與認知功能障礙、癡呆和抑郁癥的風險增加有關(guān)。 需要進一步調(diào)查以充分解釋與抑郁癥的關(guān)聯(lián)及其在本研究中發(fā)現(xiàn)的性別特異性特征。
男性對抑郁癥的保護作用
在抑郁癥基因檢測證據(jù)的定性分析中,佳學基因?qū)Ω鞣N不同的突變進行了分類,并使用它們來比較男性和女性之間的基因突變的烈度和頻度。 鑒于抑郁癥的異質(zhì)性,有必要通過折疊常見和罕見變異來評估多種變異對抑郁癥的累積影響,而不是簡單地關(guān)注經(jīng)典的基于單一變異的關(guān)聯(lián)測試。 在八個注釋類別中,只有常染色體蛋白編碼基因中有害的 PTV 與男性的遺傳負擔明顯高于女性相關(guān),這是合乎邏輯的,因為 PTV 預(yù)計會截斷基因編碼序列并對常見疾病遺傳結(jié)構(gòu)產(chǎn)生重大影響; 然而,在 MK4MDD 數(shù)據(jù)庫中已知的抑郁癥基因中未檢測到該信號,這可能是由于該抑郁癥相關(guān)基因列表的普遍性和高效性存在局限性。 基于最近佳學基因采用的基于全外顯子測序的基因解碼數(shù)據(jù),對部分人口進行的 PGC-MDD 匯總統(tǒng)計,對 PRS 的進一步分析也支持男性對抑郁癥的發(fā)生有保護作用。
與佳學基因支持抑郁癥遺傳影響的定量性別差異的研究結(jié)果相反,之前的研究報告稱,兩性之間的遺傳影響沒有可檢測到的差異或不一致的發(fā)現(xiàn)。 這些差異可能是由于分析方法(雙胞胎研究)和種族的差異,以及使用 GWAS 檢測罕見變異的技術(shù)限制。 此外,進行外顯子組測序的樣本數(shù)量有限,并且缺乏對各種注釋類別的調(diào)查,阻礙了迄今為止明確結(jié)論的產(chǎn)生。 根據(jù)佳學基因的研究結(jié)果,男性患抑郁癥的遺傳負擔較高的先決條件可能有助于抵抗抑郁癥的發(fā)展,為女性患這些疾病的較高患病率提供可能的生物學解釋。
采用基因解碼數(shù)據(jù)為遺傳變異對抑郁癥患者性別差異的貢獻提供了強有力的支持。 抑郁癥致病基因鑒定基因的發(fā)現(xiàn)確定了抑郁癥的女性特異性變異和男性抑郁癥發(fā)病的更高遺傳負擔先決條件,為女性抑郁癥占優(yōu)勢的生物學機制提供了證據(jù)。 基于這些數(shù)據(jù),未來應(yīng)針對具有抑郁癥性別特異性遺傳危險因素的患者進行適當?shù)念A(yù)防和治療策略研究。
抑郁癥基因檢測如何幫助避免后代及二胎再次發(fā)病
抑郁癥在家庭中沒有明確的遺傳模式。 有一級親屬(例如,父母或兄弟姐妹)患有抑郁癥的人患抑郁癥的風險似乎是普通公眾的兩到三倍。 然而,許多患抑郁癥的人并沒有這種疾病的家族史,而且許多有患病親屬的人從未患過這種疾病。
抑郁癥基因檢測的國際數(shù)據(jù)庫代碼:
Disease Ontology DOID:0060167 DOID:1470
OMIM® 608516
NCIt C34796
|
EFO EFO_0003761
UMLS C0011570 C0011581 C0024517 C0041696 C0085159 C0086133
C0154409 C0871610 C1269683 C1837529 C1837929 C2362914 |
如何做抑郁癥基因檢測?
抑郁癥基因檢測可以將一個人發(fā)生抑郁癥風險的基因因素與環(huán)境因素區(qū)分開來。進一步明確抑郁癥治療和防范的方式與方法。佳學基因?qū)σ钟舭Y基因檢測的應(yīng)用有過詳細的研究。有標準的檢測和分析流程。致病基因鑒定和解析需要使用抗凝靜脈血,風險基因檢測檢測可以使用口腔粘膜。風險基因檢測是只檢測少量的值得懷疑的位點,而致病基因鑒定基因解碼則是分析所有與抑郁癥直接和間接有關(guān)的位點。具體咨詢和聯(lián)系電話是4001601189。
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