【佳學基因檢測】怎樣選擇多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測?
遺傳病、罕見病基因檢測導讀:
多發(fā)性骨髓瘤抗性是英文Multiple myeloma, resistance to的中文翻譯。多發(fā)性骨髓瘤 (MM) 是僅次于非霍奇金淋巴瘤的第二大常見血液系統(tǒng)惡性腫瘤。 癌細胞對標準藥物的內在和獲得性耐藥性是現代臨床方案治療的多發(fā)性骨髓瘤患者獲得更成功生存結果的主要障礙。 佳學基因關于“多發(fā)性骨髓瘤的藥物靶點和耐藥機制”的關注的主要目的是收集關于多發(fā)性骨髓瘤耐藥機制和腫瘤微環(huán)境在治療失敗中的作用的新見解的新的和變革性信息。可以通過基因檢測了解多發(fā)性骨髓瘤抗性產生的原因及更有效果的治療方案。根據《人的基因序列變化與人體疾病表征》,該臨床征狀歸屬于血液腫瘤基因檢測。
什么樣的人應當做多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測?
多發(fā)性骨髓瘤是第二常見的血液惡性腫瘤。 盡管治療取得了重大進展,但反復很常見且預后不良。 因此,闡明導致疾病進展和耐藥性的遺傳因素至關重要。便利及可及的基因檢測有可能為出現這種不利情況后提供更新的解決方案。多發(fā)性骨髓瘤抗藥性基因解碼基因檢測對511 名反復難治性多發(fā)性骨髓瘤 (RRMM) 患者進行了綜合臨床測序,以確定該疾病的分子改變圖譜。 NF-κB 和 RAS/MAPK 通路的改變比之前報道的更普遍,各有 45-65% 的發(fā)生率。 在 RAS/MAPK 通路中,存在與 RASopathies 相關的長尾變異。 通過將反復難治性多發(fā)性骨髓瘤病例與未經治療的患者進行比較,多發(fā)性骨髓瘤抗藥性基因解碼基因檢測發(fā)現一組不同的基因突變導致受研究的患者中有22% 的人對三種主要類型的靶向治療產生耐藥性。 IL6ST 中的激活突變也在反復難治性多發(fā)性骨髓瘤中富集。 綜上所述,佳學基因檢測收集的這些科技數據可作為未來反復難治性多發(fā)性骨髓瘤生物學研究的資源,并可能為臨床診斷和治療提供信息。。
佳學基因多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測大數據分析
在排除接受同種異體干細胞移植 (allo-SCT) 或在 CD138 + 選擇后腫瘤純度較低 (<20%) 的患者后,基因解碼大數據分析組編制了一組 511 名具有綜合 1700 基因腫瘤/正常 DNA 的反復難治性多發(fā)性骨髓瘤患者的測序和全轉錄組測序基因檢測數據用于綜合分析??傮w而言,反復難治性多發(fā)性骨髓瘤樣本由22 個學術醫(yī)療中心提供。該隊列由 53.3% 的男性和 46.7% 的女性組成。輕鏈類型統(tǒng)計包括 52.4% kappa、31.5% lambda 和 0.4% 雙克??;15.7% 沒有可用信息。CD138 + 選擇后,反復難治性多發(fā)性骨髓瘤隊列的平均腫瘤含量為 62%。對于每位患者,基因檢測研究團隊對來自腫瘤的 DNA 進行了靶向測序,并匹配正常樣本以識別體細胞和種系遺傳畸變。腫瘤和正常文庫的平均目標覆蓋率分別為 655X 和 483X,這是一個有利于亞克隆評估的測序深度。除了一個腫瘤樣本外,所有樣本的 RNA 測序都是可用的,并通過捕獲轉錄組測序進行,所獲得的測序數據平均有 44.5 M 匹配序列?;蚪獯a基因檢測的分析包括拷貝數改變 (CNA)、基因融合,并提供每個樣本的基因表達水平。截至 2020 年 8 月,從 dbGaP 下載了來自 CoMMpass 研究的 1108 個 NDMM 樣本的 FASTQ 文件,并使用相同的生物信息學管道進行了分析,以促進與反復難治性多發(fā)性骨髓瘤的比較。總共有 965 個完整的 CoMMpass 案例可用于下游綜合分析。
采用統(tǒng)計工具的集成方法來發(fā)現基于單核苷酸變異 (SNV) 和插入缺失的癌癥驅動因素,基因解碼確定了一組 43 個高置信度、顯著突變的基因。它們的生物學功能可分為以下幾類:(1)RAS-MAPK通路(KRAS、NRAS、BRAF、PTPN11、 N ??F1、IL6ST),(2)NF-κB通路(CYLD、TRAF3、TRAF2、NFKBIA、IRAK1) , (3) MYC 通路 ( MYC ,MAX,EP300,CREBBP,SP3),(4)細胞周期和 DNA 損傷檢查點(TP53,RB1,CDKN2C,CDKN1B,ATM,FGFR3,LATS2),(5)RNA 加工機器(DIS3,FAM46C,DDX3X,DDX5), (6) 表觀遺傳修飾因子和轉錄共激活因子/共抑制因子(KDM3B、SETD2、ARID1A、ARID2、MBD1、IDH1、BCORL1、ATAD2B),(7)B 淋巴細胞發(fā)育(PRDM1、SP140、UBR5、IRF4)和(8)可能因 MM 治療而獲得突變的基因(CRBN、CUL4B、NR3C1)。RRMM的平均突變率為3.43點突變/兆堿基。由于 APOBEC 突變過程,在 9.8% 的病例中觀察到超突變,在另外 2.7% 的病例中觀察到超突變。由于晚期患者存在循環(huán)腫瘤細胞 (CTC),在具有廣泛變異等位基因部分 (VAF) 的匹配正常測序文庫中也檢測到癌癥驅動基因的突變。
多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼如何幫助婚戀和二胎生育
反復難治性多發(fā)性骨髓瘤很難通過侵襲性疾病過程來治療腫瘤。該病的基因解碼研究代表了反復難治性多發(fā)性骨髓瘤遺傳學的綜合分析,并進一步系統(tǒng)地比較了反復難治性多發(fā)性骨髓瘤和NDMM的遺傳圖變的綜合性圖譜。通過涵蓋體細胞突變、indels、拷貝數改變、基因融合、基因表達和異常表達,基因解碼基因檢測證明大多數多發(fā)性骨髓瘤患者在NF-κB和RAS-MAPK通路中存在改變。
多發(fā)性骨髓瘤抗性的數據庫代碼
根據《人的基因序列變化與人體疾病表征》,多發(fā)性骨髓瘤抗性的數據庫代碼正在增定審核中,歡迎持續(xù)關注支持。
怎樣選擇多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測?
如果是為了驗證對導致病的基因位點的猜測,可以選擇基因檢測。基因解碼在檢測的基因信息量、分析解讀的方式方法上要明顯優(yōu)于基因檢測。如果是為了幫助診斷、找到病因、避免遺傳,專業(yè)人員強烈建議選擇基因解碼。
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