【佳學基因檢測】前列腺癌中的PIK3CA基因檢測:如何應用單擊與多擊突變結(jié)果
前列腺癌基因解碼背景
PIK3CA基因編碼了PI3K(磷脂酰肌醇3激酶)的一個亞基,參與細胞增殖、存活和代謝等重要生物過程。PIK3CA突變,尤其是多擊突變,已在多種腫瘤中顯示出對靶向治療的敏感性。在乳腺癌中,攜帶多個PIK3CA短變異(short variant, SV)的腫瘤與改善的治療結(jié)果相關(guān)。這一現(xiàn)象在前列腺癌中的表現(xiàn)和臨床意義通過前列腺癌基因解碼基因檢測得到進一步明確。
前列腺癌基因解碼目的
前列腺癌基因解碼旨在評估臨床晚期前列腺癌(Clinically Advanced Prostate Cancer, CAPC)中單擊和多擊PIK3CA基因突變的基因組特征,為臨床治療提供新見解。
患者和方法
我們利用Foundation Medicine FoundationCore數(shù)據(jù)庫,識別出19,978例接受了混合捕獲基礎(chǔ)的綜合基因組分析的CAPC腫瘤。這些分析評估了所有類型的基因組改變(genomic alterations, GA)以及腫瘤突變負擔(Tumor Mutational Burden, TMB)、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite Instability, MSI)、基因組祖先、單堿基替換突變特征以及同源重組缺陷特征(HRD signature)。此外,腫瘤細胞PD-L1表達通過免疫組化(IHC)檢測。
結(jié)果
在分析的19,978例CAPC腫瘤中,有18,741例(93.8%)為PIK3CA野生型(WT),1,155例(5.8%)表現(xiàn)為單擊PIK3CA SV,而82例(0.4%)則為多擊PIK3CA SV。與PIK3CA WT相比,單擊(6.6對3.8,p < 0.0001)和多擊(12.8對3.8,p < 0.0001)腫瘤每個腫瘤的驅(qū)動基因改變數(shù)量顯著增加。此外,單擊和多擊PIK3CA突變的腫瘤表現(xiàn)出更高的MMR突變特征、高MSI狀態(tài)和TMB水平(p < 0.0001)。其他基因組改變方面,多擊組BRCA2的突變頻率(18.3%對8.5%,p = 0.0191)和ATM基因的突變頻率(13.4%對5.6%,p = 0.02)顯著高于WT組,而單擊組PTEN基因的突變頻率(40.2%對30.1%,p < 0.0001)則高于WT組。與單擊組相比,PIK3CA WT的同源重組缺陷特征顯著高(11.2%對7.6%,p = 0.0002)。在PD-L1表達方面,三組之間沒有顯著差異。
討論
前列腺癌基因解碼的結(jié)果表明,前列腺癌中存在著PIK3CA基因的多擊突變,這一特征可能預示著一種獨特的腫瘤表型。該表型與驅(qū)動基因改變的增加、高TMB以及高MSI狀態(tài)相關(guān),這些因素可能影響腫瘤對抗PIK3CA靶向治療的反應。與乳腺癌類似,前列腺癌患者中PIK3CA多擊突變的發(fā)現(xiàn)為其潛在的靶向治療提供了新的方向,尤其是在免疫檢查點抑制劑的應用方面。
臨床意義
隨著靶向治療和免疫療法的迅速發(fā)展,了解腫瘤的基因組特征對于制定個體化治療方案至關(guān)重要。我們的前列腺癌基因解碼表明,前列腺癌中的PIK3CA多擊突變可能成為預后標志物,并為相關(guān)臨床試驗的設(shè)計提供基礎(chǔ)。這一發(fā)現(xiàn)強調(diào)了在CAPC患者中進行PIK3CA基因檢測的重要性,特別是在選擇針對PIK3CA的治療時。
結(jié)論
前列腺癌基因解碼揭示了前列腺癌中PIK3CA基因突變的復雜性,特別是多擊突變可能與腫瘤的治療反應相關(guān)。未來的前列腺癌基因解碼應進一步探索這些基因組改變?nèi)绾斡绊懪R床結(jié)果,以便為CAPC患者提供更為有效的治療選擇。隨著基因檢測技術(shù)的發(fā)展,我們期待能夠在前列腺癌的管理中看到更好的成果和更多的臨床應用。
(責任編輯:佳學基因)