【佳學基因檢測】NAb-seq：一種在雜交瘤細胞系和單個 B 細胞中進行抗體長讀長測序的正確、快速且經(jīng)濟高效的方法

基因檢測有必要做嗎—解答

研討基因檢測人員學科學習手冊《腫瘤靶向藥物的敏感性及有效性》《PLoS Genet》在?2021 Apr; 17(4): e1009329發(fā)表了一篇題目為《NAb-seq：一種在雜交瘤細胞系和單個 B 細胞中進行抗體長讀長測序的正確、快速且經(jīng)濟高效的方法》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Yinbo Zhang, Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Software, Writing – original draft, Writing – review & editing, Luther Davis, Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Validation, Writing – original draft, Writing – review & editing, and Nancy Maizels, Conceptualization, Funding acquisition, Investigation, Project administration, Resources, Supervision, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing,等完成。促進了腫瘤的正確治療與個性化用藥的發(fā)展，進一步強調(diào)了基因信息檢測與分析的重要性。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

抗體測序,B 細胞,雜交瘤,長讀長,納米孔測序,大鼠 B 細胞克隆,單細胞,工作流程

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應用結(jié)果

盡管它們在研究中普遍使用，但目前尚未對單克隆抗體進行系統(tǒng)測序。這可能會導致重現(xiàn)性問題以及偶爾會丟失抗體并丟失細胞系。雜交瘤細胞系是從免疫動物（包括小鼠、大鼠、兔和羊駝）中產(chǎn)生單克隆抗體的主要手段。除治療性抗體外，很少有雜交瘤衍生的抗體序列是已知的。 Sanger 測序一直是抗體基因測序的“金標準”，但這種方法依賴于物種特異性簡并引物組的可用性，用于擴增輕抗體和重抗體基因，并且需要冗長且昂貴的 cDNA 制備。在這里，我們利用長讀長牛津納米孔技術(shù) (ONT) 測序的最新改進來開發(fā)納米孔抗體測序 (NAb-seq)：一種為期三天、不依賴物種且具有成本效益的工作流程，用于表征配對的全長免疫球蛋白光- 和來自雜交瘤細胞系的重鏈基因。與兩種雜交瘤細胞系的 Sanger 測序相比，長讀長 ONT 測序具有高度正確、可靠和高通量的特點。我們進一步表明該方法適用于單細胞，允許在記憶 B 細胞等稀有群體中有效地發(fā)現(xiàn)抗體?？傊?，NAb-seq 有望加速雜交瘤抗體以及用于研究、診斷和治療的單個 B 細胞抗體的鑒定和驗證。關(guān)鍵詞：抗體測序、B 細胞、雜交瘤、長讀長、納米孔測序、大鼠B 細胞克隆、單細胞、工作流程

腫瘤發(fā)生與反復轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

Antibody sequencing, B cell, hybridoma, long-read, nanopore sequencing, rat B cell cloning, single cell, workflow

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