【佳學(xué)基因檢測】人類糞便細(xì)菌 DNA 百分比 G+C 組分文庫的序列分析顯示大量放線菌

基因檢測多少錢解析

試圖了解腸道微生物基因檢測與腫瘤治療的關(guān)系，閱讀腫瘤檢測的時(shí)間與空間對治療效果的影響認(rèn)識(shí)到《Blood》在 2017 Apr 27; 129(17): 2347–2358發(fā)表了一篇題目為《人類糞便細(xì)菌 DNA 百分比 G+C 組分文庫的序列分析顯示大量放線菌》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Genetic abnormalities in myelodysplasia and secondary acute myeloid leukemia: impact on outcome of stem cell transplantation等完成。該研究成果通過JOURNAL CLUB, 內(nèi)部研討及文獻(xiàn)的批判性閱讀，使得佳學(xué)基因工作人員充分掌握了這一新出現(xiàn)的基因檢測技術(shù)及臨床應(yīng)用范疇。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

胃腸道微生物群,多樣性,GC百分比,16S rRNA,序列

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果

背景：人類胃腸道 (GI) 道微生物群的特點(diǎn)是存在大量未培養(yǎng)的細(xì)菌，這些細(xì)菌最常見于厚壁菌門和擬桿菌門。盡管在幾項(xiàng)研究中采用了獨(dú)立于培養(yǎng)的技術(shù)，但這種微生物群的多樣性仍然需要更多的闡明。這項(xiàng)工作的主要目的是研究在 16S rRNA 基因序列分析之前基于基因組百分比的鳥嘌呤和胞嘧啶 (%G+C) 的分析和分級(jí)是否揭示了更高的微生物群多樣性，尤其是在高 G+C 細(xì)菌被認(rèn)為代表性不足的情況下結(jié)果：通過將基于基因組 %G+C 的分析和分級(jí)與 16S rRNA 基因克隆和測序相結(jié)合，從匯集的糞便細(xì)菌 DNA 樣本中對 23 名健康成人受試者的人類胃腸道微生物群組成進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析.共測序了 3199 個(gè)部分 16S rRNA 基因。為了比較，從可比較的未分級(jí)樣品中對 459 個(gè)克隆進(jìn)行了測序。最重要的發(fā)現(xiàn)是與放線菌門相關(guān)的序列的比例數(shù)量在 %G+C 分級(jí)樣品中為 26.6%，但在未分級(jí)樣品中僅為 3.5%。 Coriobacteriales、Bifidobacteriales 和 Actinomycetales 目構(gòu)成了分餾樣品中的 65 個(gè)放線菌系統(tǒng)型，分別占該門內(nèi)序列的 50%、47% 和 3%。結(jié)論本研究表明，克隆前的 %G+C 分析和分餾與人類胃腸道中未分離的樣本相比，測序可以揭示回收的克隆中高 G+C 含量細(xì)菌的比例顯著增加。特別是發(fā)現(xiàn)放線菌門內(nèi)的科里細(xì)菌目比以前用傳統(tǒng)測序研究估計(jì)的要豐富。

腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

gastrointestinal tract microbiota,diversity,GC percent,16S rRNA,sequence

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