【佳學(xué)基因檢測(cè)】同源獨(dú)立 CRISPR-Cas9 脫靶評(píng)估方法的評(píng)估

如何決定做基因檢測(cè)，不做基因檢測(cè)的理由合理嗎

挖掘腫瘤基因組學(xué)個(gè)性化藥物選擇記錄《PLoS One》在 2018; 13(4): e0185237發(fā)表了一篇題目為《同源獨(dú)立 CRISPR-Cas9 脫靶評(píng)估方法的評(píng)估》腫瘤靶向藥物治療基因檢測(cè)臨床研究文章。該研究由Hui Huang, Investigation, Yanhua Chen, Validation, Huishuang Chen, Project administration, Yuanyuan Ma, Formal analysis, Pei-Wen Chiang, Conceptualization, Jing Zhong, Data curation, Xuyang Liu, Methodology, Asan, Supervision, Jing Wu, Software, Yan Su, Writing – original draft, Xin Li, Writing – review & editing, Jianlian Deng, Supervision, Yingping Huang, Investigation, Xinxin Zhang, Writing – original draft, Yang Li, Funding acquisition, Ning Fan, Investigation, Ying Wang, Data curation, Lihui Tang, Validation, Jinting Shen, Validation, Meiyan Chen, Methodology, Xiuqing Zhang, Conceptualization, Deng Te, Resources, Writing – review & editing, Santasree Banerjee, Conceptualization, Hui Liu, Formal analysis, Ming Qi, Conceptualization, and Xin Yi, Conceptualization,等完成。促進(jìn)了腫瘤的正確治療與個(gè)性化用藥的發(fā)展，進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了基因信息檢測(cè)與分析的重要性。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究?jī)?nèi)容關(guān)鍵詞：

CRISPR-Cas基因編輯,脫靶編輯,CIRCLE-seq,SITE-seq

腫瘤靶向治療基因檢測(cè)臨床應(yīng)用結(jié)果

通過 CRISPR-Cas 基因編輯專門改變基因組的能力已經(jīng)有效改變了生物學(xué)研究、生物技術(shù)和醫(yī)學(xué)。然而，該技術(shù)的廣泛治療應(yīng)用將需要通過基于同源性的預(yù)測(cè)以及檢測(cè)脫靶編輯的可靠方法對(duì)脫靶編輯進(jìn)行有效的臨床前評(píng)估。存在幾種脫靶位點(diǎn)提名分析，但需要仔細(xì)比較以確定它們的相對(duì)優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)。在這項(xiàng)研究中，HEK293T 細(xì)胞用 Streptococcus pyogenes Cas9 和 8 個(gè)具有不同預(yù)測(cè)混雜水平的引導(dǎo) RNA 處理，以比較三種同源無關(guān)的脫靶提名方法的性能：基于細(xì)胞的測(cè)定法、GUIDE-seq 和生化檢測(cè) CIRCLE-seq 和 SITE-seq。這三種方法的基準(zhǔn)測(cè)試是使用混合捕獲對(duì) 75,000 個(gè)同源提名位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)序，然后進(jìn)行高通量測(cè)序，從而對(duì)此類方法進(jìn)行了迄今為止最全面的評(píng)估。這三種方法在提名序列確認(rèn)的脫靶位點(diǎn)方面表現(xiàn)相似，但在提名的位點(diǎn)總數(shù)上存在很大差異。當(dāng)與依賴同源性的提名方法和測(cè)序確認(rèn)相結(jié)合時(shí)，所有三種脫靶提名方法都提供了對(duì)脫靶活動(dòng)的全面評(píng)估。 GUIDE-seq 的低假陽性率以及其信號(hào)與觀察到的編輯的高度相關(guān)性突出了其為離體 CRISPR-Cas 療法提名脫靶位點(diǎn)的適用性。

腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)描述：

CRISPR-Cas gene editing,off-target editing, CIRCLE-seq,SITE-seq

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