【佳學基因檢測】SAMD9基因檢測

SAMD9的功能：

SAMD9是一個與SAMD9L同源的高度保守基因，與它的同源基因具有共同的基因結(jié)構(gòu)，兩個基因編碼的蛋白質(zhì)具有58%的氨基酸同源性。大多數(shù)哺乳動物都有Samd9和Samd9l。然而，小鼠只有Samd9l，而奶牛只編碼Samd9，這表明這些基因部分互補了彼此的功能。SAMD9和SAMD9L一樣，參與控制細胞增殖，并在某些癌癥中起到腫瘤抑制作用。已知SAMD9基因的有害突變可導致正常血球型家族性腫瘤性鈣沉積（NFTC），這是一種罕見的常染色體隱性疾病。NFTC的特征是皮膚和牙齦的異常炎癥，這是由干擾素途徑的過度信號引起的。與此一致，SAMD9的功能受到干擾素-γ的嚴格調(diào)節(jié)。
 

SAMD9突變導致海市蜃樓綜合征

賊近的研究已經(jīng)在患有脊髓發(fā)育不良、感染、生長受限、腎上腺發(fā)育不良、生殖器表型和腸病的兒童中發(fā)現(xiàn)SAMD9突變，命名為幻影綜合征（OMIM#617053）。在賊初的報告中，大多數(shù)受影響的兒童在兒童早期死亡，但兩名壽命延長的個體出現(xiàn)了單體7型MDS，導致突變SAMD9等位基因丟失。賊近的一項研究還報告說，在7名有親代DNA的幻影兒童中，突變是從頭發(fā)生的，位于高度保守的殘基中，通常影響精氨酸（8個中的6個），一半的突變聚集在SAMD9的982和983密碼子熱點。因此，結(jié)論是，海市蜃樓綜合征背后的SAMD9突變是GOF，對細胞生長的負面影響給細胞帶來選擇壓力，使其失去突變拷貝。此外，這表明這些基因同源物的功能非常相似。然而，除了相似的血液學表型外，尚不清楚為什么SAMD9L突變導致小腦萎縮，而SAMD9突變與復(fù)雜的多器官缺陷相關(guān)。我們假設(shè)SAMD9相關(guān)疾病中可能的神經(jīng)表現(xiàn)可能一直未被注意到，因為大多數(shù)患者在神經(jīng)系統(tǒng)尚不成熟且輕度平衡問題或視覺問題不明顯的情況下，在很小的年齡就死亡了。

Buonocore等人描述了八名幻影患者，其中六名兒童患有宮內(nèi)生長受限和嚴重睪丸功能障礙，導致女性外生殖器，而其余兩名兒童患有非典型外生殖器（圖。1b及?和2）2）[28]。迄今確認的19例新發(fā)幻影患者中，大多數(shù)在病史中有骨髓衰竭（各種細胞減少）和感染的跡象?？偣灿兴拿麅和膲勖L，并出現(xiàn)了7號染色體畸變的MDS。引人注目的是，在進行細胞遺傳學檢查的三名非MDS患者中，造血細胞顯示了7號染色體的某種形式的畸變，即單體7或7q-。這三名患者的初始VAF約為50%，但在隨后的樣本中顯示出較低的VAF，這表明由于單體7或7q-而失去GOF SAMD9突變的克隆的擴增。這些患者沒有發(fā)生MDS的原因可能與時間有關(guān)，因為他們都在5-21個月大時死亡。與ATXPC中GOF SAMD9L突變的觀察結(jié)果類似，GOF SAMD9突變也被其他遺傳機制逆轉(zhuǎn)，如幻影綜合征患者（包括非顯性造血表型患者）血液中的移碼或停止增益突變（圖3）。

遺傳性SAMD9突變導致輕度表型

Schwartz等人賊近發(fā)現(xiàn)了一個具有遺傳性SAMD9突變的家族，其中三名兒童在早期發(fā)展為單體7型MDS。雖然母親有效不受MDS和遺傳逆轉(zhuǎn)的影響，但所有三個孩子都通過不同的機制在血液中表現(xiàn)出克隆性體細胞逆轉(zhuǎn)。一名受影響的兒童有7號染色體的CN-LOH和同時發(fā)生的單體7，而另外兩名兒童有單體7以及SAMD9的順式突變，主張通過這兩種機制中和生殖系GOF變體。

只能推測，新發(fā)和家族性SAMD9突變之間的差異在于GOF的嚴重程度。較弱的GOF變異可能是可耐受的，而較嚴重的GOF變異只能因胚胎致死性而從頭發(fā)生，或因伴隨的生殖器畸形導致不育而無法在人群中固定。然而，在報告的家族中，尚不清楚為什么母親沒有表現(xiàn)出任何表型，也沒有表現(xiàn)出任何遺傳逆轉(zhuǎn)。不幸的是，RNA不能用于檢測SAMD9的單等位基因或雙等位基因表達。