【佳學基因檢測】心血管內(nèi)科的基因檢測:遺傳咨詢和檢測項目建議
基因檢測旨在識別遺傳信息中的基因變異,從而確認或者是否定對一病人的疾病表現(xiàn)所做出的判斷,預測嘗未出現(xiàn)的癥狀的疾病的發(fā)生,或者為醫(yī)療和生育決定提供風險估計。遺傳下來的變異不僅包括DNA和RNA的變化,還包括整個染色體、蛋白質(zhì)或某些代謝物的變化。明確基因檢測一類檢測內(nèi)容、檢測技術(shù)和檢測結(jié)果非常廣泛的。不同的基因檢測機構(gòu)、甚至是同一檢測機構(gòu)不同的上下文中會采用不同的含義。
診斷測試 |
確認或排除醫(yī)生根據(jù)臨床觀察所懷疑的特定遺傳病的基因檢測 |
產(chǎn)前檢查 |
在出生前進行的測試,以確定胎兒受遺傳性 疾病影響的可能性。常見的產(chǎn)前診斷方法包括羊膜穿刺術(shù)和絨毛取樣(CVS) |
新生兒篩查 |
在新生兒期進行的測試,以確定新生兒是否患有遺傳性代謝疾病。例如,苯丙酮尿癥(PKU) |
攜帶者檢測 |
為確定無癥狀個體中是否存在突變而進行的測試 |
預測測試 |
對無癥狀個體進行測試,以提供有關(guān)其發(fā)生遺傳病風險的信息。包括癥狀前和易感/敏感性測試 |
發(fā)病前檢測 |
為確定無癥狀個體是否攜帶遺傳病的突變而進行的預測測試。陽性結(jié)果表明患者將發(fā)展為該疾病,但沒有具體說明發(fā)病時間。亨廷頓病 |
易感/敏感性測試 |
進行預測性測試,以確定無癥狀個體是否攜帶突變,增加或減少發(fā)生特定疾病的機會。與癥狀前測試不同的是,陽性結(jié)果并不一定意味著患者會產(chǎn)生這種疾病。癌癥,心血管疾病 |
研究性檢測 |
測試旨在促進對特定疾病遺傳病發(fā)病原因的科學理解,而不是為了臨床評估和管理而進行的測試。 |
基因檢測與通常的臨床評估相比,具有許多優(yōu)勢?;驒z測的優(yōu)勢有檢測是傷的,診斷正確性高,存在對一些可治好的疾病進行早期診斷并進行預防性干預的機會。基因檢測也有可能提供其他臨床檢測無法提供的有用信息,特別是涉及其他家庭成員的風險和未來疾病的易感性。然而,基因檢測只是構(gòu)成完整心血管臨床評估的許多組成 部分之一。詳細的家族史、體格檢查或常規(guī)生化、心血管成像或電生理研究都是臨床評估中可以提供豐富信息的手段。在合適的情況下,可以通過通過基因檢測來加強。
基因檢測前的考慮內(nèi)容:表型拷貝、基因拷貝、不有效外顯率和表型差異化
在考慮進行基因檢測之前,對于需要檢測的疾病,應對先證者進行盡可能正確的診斷,這一點很重要。例如,LQTS表型,如藥物誘導的QT延長,或基因拷貝(如兒茶酚胺能多態(tài)性室性心動過速的存在可能會阻礙基因檢測工作,因為它們在病因上與該疾病不同。同樣復雜的是不有效外顯率和表型差異化。在許多情況下,當這些因素存在時,詳細了解患者的家族史可能有助于發(fā)現(xiàn)這些問題 。
基因檢測的選擇
選擇基因檢測的先決條件是了解需要檢測的疾病的可能的遺傳原因。由于通道病和心肌病通常由致病性核苷酸變異而不是大的染色體或生化異常引起,分子遺傳檢測方法(方框I)與治療法這些疾病醫(yī)生賊為相關(guān)。有關(guān)通道病和心肌病相關(guān)基因的總結(jié),請參閱下表。
基因檢測的結(jié)果是否用
在評估基因測試的效用時,許多與傳統(tǒng)臨床測試相同的考慮因素同樣適用,包括有效性、結(jié)果解釋方式、相關(guān)成本和是否可以進行檢測。
分析檢測和臨床檢測的有效性及陽性預測值
對于基因檢測來說,分析有效性是指當基因變異確實存在時,能夠正確檢測到該變異(敏感性),而當基因變異真正缺失(特異性)時,則能夠排除該變異。同樣重要的是,基因檢測將臨床表型與檢測到的遺傳變異的匹配程度如何(臨床有效性)??偟膩碚f,分析有效性和臨床有效性可作為基因檢測質(zhì)量和效用的衡量標準,并可作為確定基因檢測適當性或選擇特定檢測方法的有用工具。檢測的陽性預測值(PPV)是檢測結(jié)果呈陽性的患者中真正患有該疾病的比例。雖然明顯類似于敏感性,但陽性預測值的不同之處在于,它是一種來自突變陽性個體庫而非患者庫的測量值。由于為同一基因提供檢測的不同實驗室可能使用不同的技術(shù),因此應優(yōu)先選擇提供高有效性和陽性預測值的質(zhì)量高效的第三方醫(yī)學檢驗實驗室。
解釋基因檢測結(jié)果的障礙
兩個主要問題阻礙了心血管疾病的基因檢測。首先,在許多情況下,只有家族史和臨床表型高度提示遺傳原因的少數(shù)病例,才可以通過數(shù)據(jù)庫比對方法確定遺傳原因。例如,據(jù)估計在家族性擴張型心肌病(FDC)家族中,只有四分之一到三分之一的遺傳原因被確定。HCM(家族性疾病中的30%-40%或更高)或通道?。↙QTS13中的65%-75%)的遺傳原因比例更高。第二,許多心血管疾病表現(xiàn)出明顯的位點異質(zhì)性,具有跨許多不同基因的致病突變。例如,在家族性擴張型心肌病FDC中,已經(jīng)確定了20多種不同基因的突變,但如上所述,這仍然只能解釋一小部分疾病的遺傳原因。這種異質(zhì)性使基因檢測策略復雜化,因為許多基因必須測序,增加了分析的總體成本和復雜性。由于這些問題,雖然陽性檢測結(jié)果可以提供非常豐富的信息,但在沒有先前確定的家族突變的情況下,陰性結(jié)果不能排除家族中的遺傳疾病,并且臨床實用性有限。而新近出現(xiàn)的基因解碼技術(shù),通過擴大測序檢測方案和應用不同于數(shù)據(jù)庫比對的結(jié)構(gòu)功能分析方法,大幅度提高了分析結(jié)果的陽性率。
患者的基因檢測與高危親屬的檢測
基因檢測有助于對先證者的診斷。它還可以促進親屬的風險評估。除特殊情況外,基因檢測總是從患有賊明顯疾病的家庭成員(通常是指示病例)開始,因為對這個人進行檢測將賊大可能發(fā)現(xiàn)突變。如果未檢測到突變,則對該家族中的相同基因進行進一步檢測通常是無用的。如果在患者受檢測到致病突變,可以對疑似攜帶者進行有針對性的突變分析,這可能為疾病治療和生育選安排提供重要信息。
基因檢測結(jié)果中的意義未明(未知意義)
除了陽性或陰性結(jié)果外,基因測試還可能證明存在一種基因變異,而這種變異的證據(jù)太少,無法將其歸類為致病或良性。這些結(jié)果通常被稱為意義未知的變異(VUS),具有不確定的臨床相關(guān)性,對患者治療構(gòu)成重大挑戰(zhàn)。廣泛的家族史和/或證明變異與疾病共分離可以支持致病性,功能分析也可以顯示基因變異所導致的蛋白質(zhì)功能的改變。關(guān)于基因突變影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或幫助編碼位于蛋白質(zhì)進化保守區(qū)的氨基酸的知識也可以是支持性的,但不是決定性的。盡管基因研究可能能夠進一步深入了解特定VUS的意義,但在許多情況下,測試結(jié)果對臨床環(huán)境的幫助可能微乎其微。而功能分析是基因解碼所采取的一種有效的途徑。
(責任編輯:佳學基因)